MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter heilmannii ASB1.4 main chromosome

Total Repeats: 14933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019674	AGA	2	6	72	77	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527848
2	NC_019674	CAA	2	6	294	299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527848
3	NC_019674	GTG	2	6	361	366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527848
4	NC_019674	CCG	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480527848
5	NC_019674	AGC	2	6	559	564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527849
6	NC_019674	TTG	2	6	616	621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527849
7	NC_019674	AAG	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527849
8	NC_019674	CAG	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527849
9	NC_019674	CAA	2	6	904	909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527849
10	NC_019674	CAA	2	6	933	938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527849
11	NC_019674	TCG	2	6	956	961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527849
12	NC_019674	CAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527849
13	NC_019674	GAT	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527849
14	NC_019674	GGC	2	6	1224	1229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480527849
15	NC_019674	CAT	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527850
16	NC_019674	ACA	2	6	1567	1572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527850
17	NC_019674	AAG	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527850
18	NC_019674	ACC	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527850
19	NC_019674	TGT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527850
20	NC_019674	TTG	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527852
21	NC_019674	AAG	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527852
22	NC_019674	TAA	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480527852
23	NC_019674	TGT	2	6	3068	3073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527852
24	NC_019674	GTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527852
25	NC_019674	CTT	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527852
26	NC_019674	CAC	2	6	3328	3333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527852
27	NC_019674	TTG	2	6	3358	3363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527852
28	NC_019674	CTT	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527852
29	NC_019674	TTC	2	6	3751	3756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527852
30	NC_019674	GTA	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527852
31	NC_019674	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527852
32	NC_019674	TAG	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527852
33	NC_019674	TGG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527852
34	NC_019674	AAC	2	6	4547	4552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527853
35	NC_019674	AAC	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527853
36	NC_019674	ATC	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527853
37	NC_019674	ATG	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527853
38	NC_019674	CAA	2	6	4768	4773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527853
39	NC_019674	CCA	2	6	5028	5033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527853
40	NC_019674	AGC	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527853
41	NC_019674	TGA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527853
42	NC_019674	ATT	2	6	5431	5436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480527853
43	NC_019674	TGG	2	6	6225	6230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527854
44	NC_019674	AAG	2	6	6342	6347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527854
45	NC_019674	GGT	2	6	6391	6396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527854
46	NC_019674	AAG	2	6	6438	6443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527854
47	NC_019674	CTA	2	6	6608	6613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527854
48	NC_019674	GTG	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527854
49	NC_019674	ACA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527854
50	NC_019674	AAG	2	6	7071	7076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527854
51	NC_019674	ATC	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527855
52	NC_019674	CAT	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527855
53	NC_019674	AAG	2	6	7632	7637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527855
54	NC_019674	GAT	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527855
55	NC_019674	CAA	2	6	7816	7821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527855
56	NC_019674	CAA	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527855
57	NC_019674	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527855
58	NC_019674	CAC	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527856
59	NC_019674	CAT	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527856
60	NC_019674	CGG	2	6	8168	8173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480527856
61	NC_019674	GGA	2	6	8250	8255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480527856
62	NC_019674	CAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527856
63	NC_019674	AGA	2	6	8448	8453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527856
64	NC_019674	ACA	2	6	8480	8485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527856
65	NC_019674	TCC	2	6	8524	8529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480527857
66	NC_019674	TTA	2	6	8574	8579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480527857
67	NC_019674	CAT	2	6	8618	8623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527857
68	NC_019674	TAC	2	6	8763	8768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527857
69	NC_019674	CTG	2	6	8860	8865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527857
70	NC_019674	TTG	2	6	8914	8919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527857
71	NC_019674	ACA	2	6	8956	8961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527857
72	NC_019674	TGG	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527857
73	NC_019674	ACC	2	6	9010	9015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527857
74	NC_019674	CCA	2	6	9196	9201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527857
75	NC_019674	ACC	2	6	9286	9291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527857
76	NC_019674	GTG	2	6	9591	9596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527857
77	NC_019674	GCT	2	6	9602	9607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527857
78	NC_019674	CCG	2	6	9646	9651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480527857
79	NC_019674	AAG	2	6	9667	9672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527857
80	NC_019674	CGC	2	6	9740	9745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480527857
81	NC_019674	CGC	2	6	9758	9763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480527857
82	NC_019674	CAT	2	6	9839	9844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527857
83	NC_019674	ACC	2	6	10085	10090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527858
84	NC_019674	GAT	2	6	10195	10200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527858
85	NC_019674	CCA	2	6	10317	10322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527858
86	NC_019674	GTG	2	6	10437	10442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527858
87	NC_019674	GTT	2	6	10531	10536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527858
88	NC_019674	CAA	2	6	10538	10543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527858
89	NC_019674	GTT	2	6	10938	10943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527859
90	NC_019674	TGC	2	6	10956	10961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527859
91	NC_019674	GTT	2	6	11257	11262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527859
92	NC_019674	CAC	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527859
93	NC_019674	TTG	2	6	11338	11343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527859
94	NC_019674	ATC	2	6	11427	11432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527860
95	NC_019674	CAA	2	6	11469	11474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527860
96	NC_019674	GCA	2	6	11567	11572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527860
97	NC_019674	TCA	2	6	11597	11602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527860
98	NC_019674	CCA	2	6	11860	11865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527861
99	NC_019674	ATG	2	6	11970	11975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527861
100	NC_019674	TGG	2	6	14594	14599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527862
101	NC_019674	ACA	2	6	14741	14746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527862
102	NC_019674	CCA	2	6	14834	14839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527862
103	NC_019674	AGT	2	6	14885	14890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527862
104	NC_019674	TTG	2	6	14967	14972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527862
105	NC_019674	TGC	2	6	15044	15049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527862
106	NC_019674	CGG	2	6	15080	15085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480527862
107	NC_019674	CTT	2	6	15140	15145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527862
108	NC_019674	AAG	2	6	15165	15170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527862
109	NC_019674	TCA	2	6	15191	15196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527862
110	NC_019674	GTT	2	6	15270	15275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527863
111	NC_019674	AAC	2	6	15291	15296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527863
112	NC_019674	GTG	2	6	15334	15339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527863
113	NC_019674	GCG	2	6	15355	15360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480527863
114	NC_019674	GCT	2	6	15461	15466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527863
115	NC_019674	TTG	2	6	15603	15608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527863
116	NC_019674	GTA	2	6	15669	15674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527863
117	NC_019674	ATC	2	6	15681	15686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527863
118	NC_019674	GTA	2	6	15705	15710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527863
119	NC_019674	AGG	2	6	15821	15826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480527863
120	NC_019674	GTC	2	6	15939	15944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527863
121	NC_019674	ATA	2	6	16056	16061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480527863
122	NC_019674	TTG	2	6	16062	16067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527863
123	NC_019674	CAC	2	6	16068	16073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527863
124	NC_019674	GCT	2	6	16132	16137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527863
125	NC_019674	TTG	2	6	16150	16155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527863
126	NC_019674	TGT	2	6	16211	16216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527863
127	NC_019674	AGT	2	6	16352	16357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527863
128	NC_019674	ATC	3	9	16461	16469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527863
129	NC_019674	ACT	2	6	16745	16750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527864
130	NC_019674	TGG	2	6	16766	16771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527864
131	NC_019674	TTG	2	6	16962	16967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527864
132	NC_019674	TCT	2	6	17029	17034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527864
133	NC_019674	TCA	2	6	17036	17041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527864
134	NC_019674	TTC	2	6	17059	17064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527864
135	NC_019674	AGA	2	6	17320	17325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527865
136	NC_019674	GGT	2	6	17518	17523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527865
137	NC_019674	GTG	2	6	17594	17599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527865
138	NC_019674	ACC	2	6	17693	17698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527865
139	NC_019674	TGT	2	6	17740	17745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527865
140	NC_019674	GCA	2	6	17746	17751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527865
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142	NC_019674	CCT	2	6	17794	17799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480527865
143	NC_019674	TGG	2	6	17958	17963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527865
144	NC_019674	TGG	2	6	18204	18209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527865
145	NC_019674	AGC	2	6	19286	19291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527866
146	NC_019674	CTT	2	6	19493	19498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527866
147	NC_019674	TGG	2	6	19620	19625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527867
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150	NC_019674	CAA	2	6	19882	19887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527867
151	NC_019674	TAT	2	6	19904	19909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480527867
152	NC_019674	AAG	2	6	19961	19966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527867
153	NC_019674	ACG	2	6	19971	19976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527867
154	NC_019674	AGG	2	6	20037	20042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480527867
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156	NC_019674	CGG	2	6	20177	20182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480527867
157	NC_019674	ATC	2	6	20183	20188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527867
158	NC_019674	ATC	2	6	20246	20251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527867
159	NC_019674	ATC	2	6	20354	20359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480527867
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161	NC_019674	AAG	2	6	20525	20530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480527867
162	NC_019674	CTT	2	6	20770	20775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527868
163	NC_019674	GAT	2	6	20809	20814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527868
164	NC_019674	GTG	2	6	21070	21075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480527869
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253	NC_019674	TTG	2	6	31676	31681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527879
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258	NC_019674	TTG	2	6	32021	32026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480527879
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