MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 10222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019673	CCGGG	2	10	1851	1860	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019673	GAAGA	2	10	2299	2308	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019673	GGTCC	2	10	4340	4349	0 %	20 %	40 %	40 %	433601841
4	NC_019673	CCGCG	2	10	7511	7520	0 %	0 %	40 %	60 %	433601844
5	NC_019673	GCGCT	2	10	8962	8971	0 %	20 %	40 %	40 %	433601845
6	NC_019673	TGCTC	2	10	10640	10649	0 %	40 %	20 %	40 %	433601845
7	NC_019673	GCCGC	2	10	11393	11402	0 %	0 %	40 %	60 %	433601846
8	NC_019673	GGTCG	2	10	11494	11503	0 %	20 %	60 %	20 %	433601846
9	NC_019673	GGGCG	2	10	11560	11569	0 %	0 %	80 %	20 %	433601846
10	NC_019673	GCTCG	2	10	11587	11596	0 %	20 %	40 %	40 %	433601846
11	NC_019673	ACCGC	2	10	14999	15008	20 %	0 %	20 %	60 %	433601851
12	NC_019673	CGGCG	2	10	16463	16472	0 %	0 %	60 %	40 %	433601853
13	NC_019673	CGGGC	2	10	18256	18265	0 %	0 %	60 %	40 %	433601856
14	NC_019673	CGCCA	2	10	18450	18459	20 %	0 %	20 %	60 %	433601856
15	NC_019673	GCCCG	2	10	19286	19295	0 %	0 %	40 %	60 %	433601857
16	NC_019673	TAGGT	2	10	20881	20890	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019673	CGGCC	2	10	21927	21936	0 %	0 %	40 %	60 %	433601860
18	NC_019673	CCGGG	2	10	24185	24194	0 %	0 %	60 %	40 %	433601861
19	NC_019673	CGGCG	2	10	25251	25260	0 %	0 %	60 %	40 %	433601862
20	NC_019673	AGGCC	2	10	27928	27937	20 %	0 %	40 %	40 %	433601863
21	NC_019673	GTCCG	2	10	28881	28890	0 %	20 %	40 %	40 %	433601864
22	NC_019673	CGGAC	2	10	29929	29938	20 %	0 %	40 %	40 %	433601865
23	NC_019673	CGACC	2	10	32042	32051	20 %	0 %	20 %	60 %	433601867
24	NC_019673	CGGCC	2	10	33985	33994	0 %	0 %	40 %	60 %	433601869
25	NC_019673	CGCAG	2	10	34922	34931	20 %	0 %	40 %	40 %	433601870
26	NC_019673	TCGAC	2	10	35858	35867	20 %	20 %	20 %	40 %	433601871
27	NC_019673	GCCGC	2	10	35976	35985	0 %	0 %	40 %	60 %	433601871
28	NC_019673	CGGCG	2	10	36178	36187	0 %	0 %	60 %	40 %	433601871
29	NC_019673	GGCCG	2	10	36538	36547	0 %	0 %	60 %	40 %	433601871
30	NC_019673	GCCGG	2	10	36722	36731	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019673	GCCGG	2	10	36740	36749	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_019673	GCGCT	2	10	37338	37347	0 %	20 %	40 %	40 %	433601872
33	NC_019673	TGGCC	2	10	37722	37731	0 %	20 %	40 %	40 %	433601873
34	NC_019673	CCGGA	2	10	38136	38145	20 %	0 %	40 %	40 %	433601873
35	NC_019673	ACCCG	2	10	38313	38322	20 %	0 %	20 %	60 %	433601873
36	NC_019673	ACCTG	2	10	40754	40763	20 %	20 %	20 %	40 %	433601875
37	NC_019673	ACGGC	2	10	42147	42156	20 %	0 %	40 %	40 %	433601878
38	NC_019673	GCCGG	2	10	44013	44022	0 %	0 %	60 %	40 %	433601879
39	NC_019673	TCGAC	2	10	44035	44044	20 %	20 %	20 %	40 %	433601879
40	NC_019673	CACCG	2	10	44728	44737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_019673	TGGCG	2	10	47241	47250	0 %	20 %	60 %	20 %	433601882
42	NC_019673	TGTGC	2	10	48623	48632	0 %	40 %	40 %	20 %	433601884
43	NC_019673	GGCCG	2	10	49979	49988	0 %	0 %	60 %	40 %	433601885
44	NC_019673	AGCCC	2	10	50169	50178	20 %	0 %	20 %	60 %	433601886
45	NC_019673	CGGGT	2	10	50915	50924	0 %	20 %	60 %	20 %	433601887
46	NC_019673	GCGCC	2	10	51236	51245	0 %	0 %	40 %	60 %	433601887
47	NC_019673	TCGGC	2	10	52196	52205	0 %	20 %	40 %	40 %	433601888
48	NC_019673	CGGCG	2	10	53707	53716	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019673	CGGCG	2	10	54044	54053	0 %	0 %	60 %	40 %	433601890
50	NC_019673	CTCGG	2	10	54998	55007	0 %	20 %	40 %	40 %	433601890
51	NC_019673	CCGGC	2	10	55024	55033	0 %	0 %	40 %	60 %	433601890
52	NC_019673	ATGCG	2	10	56386	56395	20 %	20 %	40 %	20 %	433601893
53	NC_019673	GGTCC	2	10	58597	58606	0 %	20 %	40 %	40 %	433601896
54	NC_019673	ACCCG	2	10	60936	60945	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_019673	TGGCT	2	10	61621	61630	0 %	40 %	40 %	20 %	433601898
56	NC_019673	CCGCG	2	10	64688	64697	0 %	0 %	40 %	60 %	433601901
57	NC_019673	GCTGG	2	10	64933	64942	0 %	20 %	60 %	20 %	433601901
58	NC_019673	GACCC	2	10	65918	65927	20 %	0 %	20 %	60 %	433601902
59	NC_019673	CGGGC	2	10	65935	65944	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_019673	CCGGT	2	10	66700	66709	0 %	20 %	40 %	40 %	433601903
61	NC_019673	GCCCG	2	10	67439	67448	0 %	0 %	40 %	60 %	433601903
62	NC_019673	GCCGC	2	10	67872	67881	0 %	0 %	40 %	60 %	433601903
63	NC_019673	GGCCG	2	10	70101	70110	0 %	0 %	60 %	40 %	433601905
64	NC_019673	TGCGC	2	10	71639	71648	0 %	20 %	40 %	40 %	433601906
65	NC_019673	CGCGG	2	10	71701	71710	0 %	0 %	60 %	40 %	433601906
66	NC_019673	CGGCG	2	10	73020	73029	0 %	0 %	60 %	40 %	433601906
67	NC_019673	GCCCG	2	10	73224	73233	0 %	0 %	40 %	60 %	433601906
68	NC_019673	GCGTC	2	10	74256	74265	0 %	20 %	40 %	40 %	433601907
69	NC_019673	CCTGG	2	10	75785	75794	0 %	20 %	40 %	40 %	433601908
70	NC_019673	CGCGC	2	10	75968	75977	0 %	0 %	40 %	60 %	433601908
71	NC_019673	CGGGC	2	10	76642	76651	0 %	0 %	60 %	40 %	433601909
72	NC_019673	CGGGC	2	10	80780	80789	0 %	0 %	60 %	40 %	433601914
73	NC_019673	CGGCA	2	10	81397	81406	20 %	0 %	40 %	40 %	433601915
74	NC_019673	CGCGG	2	10	81912	81921	0 %	0 %	60 %	40 %	433601915
75	NC_019673	CAGCG	2	10	82267	82276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019673	GCCCG	2	10	82817	82826	0 %	0 %	40 %	60 %	433601916
77	NC_019673	GGTCG	2	10	84476	84485	0 %	20 %	60 %	20 %	433601918
78	NC_019673	TGGGC	2	10	87210	87219	0 %	20 %	60 %	20 %	433601921
79	NC_019673	CGGGG	2	10	88774	88783	0 %	0 %	80 %	20 %	433601922
80	NC_019673	AGTCC	2	10	89794	89803	20 %	20 %	20 %	40 %	433601923
81	NC_019673	CTGGT	2	10	89870	89879	0 %	40 %	40 %	20 %	433601923
82	NC_019673	CCGCG	2	10	90438	90447	0 %	0 %	40 %	60 %	433601924
83	NC_019673	CGGCG	2	10	90726	90735	0 %	0 %	60 %	40 %	433601924
84	NC_019673	CGGCG	2	10	90978	90987	0 %	0 %	60 %	40 %	433601924
85	NC_019673	CCAGC	2	10	91929	91938	20 %	0 %	20 %	60 %	433601925
86	NC_019673	CGAGC	2	10	92247	92256	20 %	0 %	40 %	40 %	433601925
87	NC_019673	CCGGC	2	10	92398	92407	0 %	0 %	40 %	60 %	433601925
88	NC_019673	CCAGT	2	10	92438	92447	20 %	20 %	20 %	40 %	433601925
89	NC_019673	GGTCG	2	10	92909	92918	0 %	20 %	60 %	20 %	433601926
90	NC_019673	GCCGC	2	10	94018	94027	0 %	0 %	40 %	60 %	433601928
91	NC_019673	CTCGA	2	10	98248	98257	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_019673	ACACC	2	10	98649	98658	40 %	0 %	0 %	60 %	433601936
93	NC_019673	CCGCG	2	10	98901	98910	0 %	0 %	40 %	60 %	433601936
94	NC_019673	CGGCG	2	10	99476	99485	0 %	0 %	60 %	40 %	433601937
95	NC_019673	ACGGC	2	10	100984	100993	20 %	0 %	40 %	40 %	433601938
96	NC_019673	CCGGG	2	10	101310	101319	0 %	0 %	60 %	40 %	433601938
97	NC_019673	GACGG	2	10	101776	101785	20 %	0 %	60 %	20 %	433601939
98	NC_019673	GGTCG	2	10	104711	104720	0 %	20 %	60 %	20 %	433601944
99	NC_019673	CTCGC	2	10	104733	104742	0 %	20 %	20 %	60 %	433601944
100	NC_019673	GGCCC	2	10	105532	105541	0 %	0 %	40 %	60 %	433601945
101	NC_019673	AGCGC	2	10	106270	106279	20 %	0 %	40 %	40 %	433601945
102	NC_019673	GCCGG	2	10	106517	106526	0 %	0 %	60 %	40 %	433601945
103	NC_019673	CGTTG	2	10	106754	106763	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019673	CCGGG	2	10	108459	108468	0 %	0 %	60 %	40 %	433601947
105	NC_019673	CGGCG	2	10	108942	108951	0 %	0 %	60 %	40 %	433601947
106	NC_019673	GGTCG	2	10	110241	110250	0 %	20 %	60 %	20 %	433601949
107	NC_019673	GTGCG	2	10	110922	110931	0 %	20 %	60 %	20 %	433601949
108	NC_019673	GCGGG	2	10	112826	112835	0 %	0 %	80 %	20 %	433601951
109	NC_019673	ACCGG	2	10	113395	113404	20 %	0 %	40 %	40 %	433601952
110	NC_019673	CGGAC	2	10	113888	113897	20 %	0 %	40 %	40 %	433601953
111	NC_019673	GCGGT	2	10	115312	115321	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019673	GCGGT	2	10	115333	115342	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019673	GCGGT	2	10	115346	115355	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019673	GCGGT	2	10	115359	115368	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019673	GCGGT	2	10	115372	115381	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019673	GCGGT	2	10	115385	115394	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019673	GCGGT	2	10	115398	115407	0 %	20 %	60 %	20 %	433601955
118	NC_019673	CCGCG	2	10	115970	115979	0 %	0 %	40 %	60 %	433601955
119	NC_019673	GGCGA	2	10	116821	116830	20 %	0 %	60 %	20 %	433601955
120	NC_019673	CGGTC	2	10	117346	117355	0 %	20 %	40 %	40 %	433601955
121	NC_019673	GCGCG	2	10	118075	118084	0 %	0 %	60 %	40 %	433601956
122	NC_019673	GGCGC	2	10	121128	121137	0 %	0 %	60 %	40 %	433601958
123	NC_019673	CGCGG	2	10	121308	121317	0 %	0 %	60 %	40 %	433601958
124	NC_019673	GCTGC	2	10	123269	123278	0 %	20 %	40 %	40 %	433601960
125	NC_019673	GAGCT	2	10	124649	124658	20 %	20 %	40 %	20 %	433601961
126	NC_019673	GACCC	2	10	124832	124841	20 %	0 %	20 %	60 %	433601962
127	NC_019673	GTCGA	2	10	127704	127713	20 %	20 %	40 %	20 %	433601965
128	NC_019673	GTCCG	2	10	130057	130066	0 %	20 %	40 %	40 %	433601967
129	NC_019673	CGGCC	2	10	130303	130312	0 %	0 %	40 %	60 %	433601967
130	NC_019673	CGGCC	2	10	130933	130942	0 %	0 %	40 %	60 %	433601968
131	NC_019673	CCGAC	2	10	131064	131073	20 %	0 %	20 %	60 %	433601968
132	NC_019673	GGACC	2	10	133846	133855	20 %	0 %	40 %	40 %	433601968
133	NC_019673	CCGCG	2	10	134187	134196	0 %	0 %	40 %	60 %	433601969
134	NC_019673	GACCA	2	10	134617	134626	40 %	0 %	20 %	40 %	433601969
135	NC_019673	CCGTG	2	10	135391	135400	0 %	20 %	40 %	40 %	433601970
136	NC_019673	CGGCG	2	10	137237	137246	0 %	0 %	60 %	40 %	433601973
137	NC_019673	GTCGC	2	10	138014	138023	0 %	20 %	40 %	40 %	433601973
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251	NC_019673	GCCCG	2	10	239720	239729	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
252	NC_019673	CGGGG	2	10	240123	240132	0 %	0 %	80 %	20 %	433602074
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254	NC_019673	CCTCC	2	10	246831	246840	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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270	NC_019673	CGGTT	2	10	261668	261677	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
271	NC_019673	GGCGA	2	10	261827	261836	20 %	0 %	60 %	20 %	433602093
272	NC_019673	CGGCG	2	10	262957	262966	0 %	0 %	60 %	40 %	433602093
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285	NC_019673	GACCC	2	10	269498	269507	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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384	NC_019673	CGGTA	2	10	357674	357683	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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387	NC_019673	GGTCG	4	20	360707	360726	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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389	NC_019673	GTGTG	2	10	363962	363971	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
390	NC_019673	GCCGT	2	10	365789	365798	0 %	20 %	40 %	40 %	433602199
391	NC_019673	CCCGG	2	10	367153	367162	0 %	0 %	40 %	60 %	433602201
392	NC_019673	GCTGG	2	10	367475	367484	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
393	NC_019673	CGGCG	2	10	369095	369104	0 %	0 %	60 %	40 %	433602203
394	NC_019673	CCCGG	2	10	369915	369924	0 %	0 %	40 %	60 %	433602203
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398	NC_019673	GACCA	2	10	380508	380517	40 %	0 %	20 %	40 %	433602214
399	NC_019673	CCGGC	2	10	386571	386580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
400	NC_019673	CCCGA	2	10	387159	387168	20 %	0 %	20 %	60 %	433602220
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