MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 3960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019673	CCGC	2	8	1672	1679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_019673	CGGC	2	8	1746	1753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019673	CGGC	2	8	1778	1785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019673	CGGC	2	8	1810	1817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019673	CGGA	2	8	1843	1850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019673	CGCT	2	8	2478	2485	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019673	CGGC	2	8	8630	8637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019673	CCGG	2	8	13103	13110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019673	GCCG	2	8	13138	13145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019673	GGGC	2	8	13155	13162	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019673	GGGC	2	8	13185	13192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019673	CGCC	2	8	13202	13209	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_019673	GCCG	2	8	14350	14357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019673	CGCC	2	8	19433	19440	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_019673	TCCG	2	8	23683	23690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019673	GCCG	2	8	31567	31574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019673	CGAT	2	8	31773	31780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019673	GTCG	2	8	32309	32316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019673	CAGT	2	8	32478	32485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019673	CGGT	3	12	32578	32589	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019673	CGGT	2	8	32603	32610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019673	GTGG	2	8	32658	32665	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019673	GCCG	2	8	36705	36712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019673	AGTC	2	8	36753	36760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019673	GAGG	2	8	40943	40950	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019673	GTCG	2	8	40986	40993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019673	GCCG	2	8	41004	41011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019673	GGTC	2	8	53646	53653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019673	CTCG	2	8	56514	56521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019673	CCAC	2	8	57724	57731	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_019673	GGGC	2	8	61111	61118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019673	GGCG	2	8	61155	61162	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019673	GGGT	2	8	61319	61326	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019673	AGCG	2	8	63204	63211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019673	GGGC	2	8	63271	63278	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019673	ACCT	2	8	63674	63681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019673	TGCC	2	8	63951	63958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019673	GCCC	2	8	63988	63995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_019673	CCGG	2	8	74589	74596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019673	GCGG	2	8	79205	79212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019673	CGGG	2	8	79220	79227	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019673	CGCC	2	8	81102	81109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_019673	CCCG	2	8	81140	81147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_019673	CCGA	2	8	82250	82257	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019673	TTCG	2	8	83826	83833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019673	GGAA	2	8	89304	89311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019673	GCCT	2	8	89412	89419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019673	ACGG	2	8	89616	89623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019673	CCGT	2	8	92527	92534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019673	AGGA	2	8	92565	92572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019673	CGGG	2	8	104670	104677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019673	GGCC	2	8	105319	105326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019673	GACC	2	8	125524	125531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019673	CGGA	2	8	127087	127094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019673	CCGG	2	8	127129	127136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019673	CCCG	2	8	135095	135102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_019673	GGGC	2	8	137037	137044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019673	CGGG	2	8	137051	137058	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019673	CGGC	2	8	138754	138761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019673	CGGG	2	8	140242	140249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019673	GAGT	2	8	140317	140324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019673	CGGG	2	8	142853	142860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019673	CCGG	2	8	144985	144992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019673	CTTT	2	8	151376	151383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019673	CCCG	2	8	154646	154653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_019673	CGGC	2	8	155512	155519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019673	CGCC	2	8	157729	157736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_019673	TCCG	2	8	162081	162088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019673	GCTC	2	8	165858	165865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019673	CGGC	2	8	167466	167473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019673	TCGC	2	8	170882	170889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019673	GACC	2	8	175149	175156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019673	CCGA	2	8	175270	175277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019673	ACCG	2	8	177263	177270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019673	GCCG	2	8	177292	177299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019673	GCCG	2	8	177324	177331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019673	GATT	2	8	179039	179046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019673	CGCA	2	8	179049	179056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019673	GGCC	2	8	180664	180671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019673	CGCC	2	8	181753	181760	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_019673	CGGC	2	8	181855	181862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019673	CCGC	2	8	181897	181904	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_019673	TGAC	2	8	182026	182033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019673	CCCG	2	8	182228	182235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_019673	GCCG	2	8	182309	182316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019673	CGGA	2	8	182419	182426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019673	CGAT	2	8	185858	185865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019673	CCAC	2	8	192300	192307	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_019673	CGCC	2	8	198803	198810	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_019673	CGTA	2	8	200183	200190	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019673	CAGG	2	8	201131	201138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019673	CCTG	2	8	201341	201348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019673	GCCG	2	8	201542	201549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019673	CAGG	2	8	201697	201704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019673	CCCG	2	8	201903	201910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_019673	AAAC	2	8	201998	202005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019673	CCCG	2	8	202329	202336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_019673	CCGA	2	8	202347	202354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019673	CGGG	2	8	203007	203014	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019673	CCCG	2	8	203035	203042	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_019673	GGGC	2	8	206472	206479	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019673	GGGA	2	8	209589	209596	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019673	GCCT	2	8	215730	215737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019673	TACC	2	8	219655	219662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019673	ACCC	2	8	222210	222217	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_019673	CGCC	2	8	222466	222473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_019673	GGGC	2	8	222511	222518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019673	GAGG	2	8	224087	224094	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019673	ACCG	2	8	229666	229673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019673	CGGG	2	8	231524	231531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019673	CGGT	2	8	233966	233973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019673	CGCA	2	8	235203	235210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019673	CCCG	2	8	237757	237764	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_019673	CGGG	2	8	237772	237779	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019673	AACA	2	8	238730	238737	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019673	GGTG	2	8	239852	239859	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019673	CGAG	2	8	242127	242134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019673	TGCG	2	8	246844	246851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019673	ACGA	2	8	253522	253529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019673	CGGG	2	8	254849	254856	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019673	GGAG	2	8	259150	259157	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019673	CCCG	2	8	261516	261523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_019673	GCCC	2	8	261530	261537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_019673	CCGA	2	8	261562	261569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019673	CCGG	2	8	269524	269531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019673	TGCA	2	8	272677	272684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019673	CGAA	2	8	274364	274371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019673	CCGG	2	8	286504	286511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019673	GGGC	2	8	286523	286530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019673	CTCG	2	8	288710	288717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_019673	GCCC	2	8	291274	291281	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_019673	CTGG	2	8	291371	291378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019673	GGTC	2	8	292688	292695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019673	GGTC	2	8	294031	294038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019673	TCGA	2	8	294195	294202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019673	GTCG	2	8	295664	295671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019673	CCTG	2	8	304572	304579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019673	GCTG	2	8	304594	304601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019673	TCCC	2	8	316867	316874	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_019673	CCCG	2	8	318275	318282	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_019673	TCCG	2	8	318300	318307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019673	GCGG	2	8	318378	318385	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019673	CGGG	2	8	318450	318457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019673	CGCC	2	8	320535	320542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_019673	CCGG	2	8	320557	320564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019673	TACC	2	8	322416	322423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019673	GCCG	2	8	323256	323263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019673	ACGG	2	8	325777	325784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_019673	CGGG	2	8	328301	328308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019673	CCGG	2	8	329636	329643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019673	CCGG	2	8	329649	329656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019673	GGCG	2	8	330479	330486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_019673	TGGG	2	8	392972	392979	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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