MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 206138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019673	ACC	2	6	8	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601839
2	NC_019673	GCC	2	6	58	63	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
3	NC_019673	GCA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
4	NC_019673	CCG	2	6	277	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
5	NC_019673	CCG	2	6	337	342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
6	NC_019673	CCG	2	6	359	364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
7	NC_019673	CGA	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
8	NC_019673	GAG	2	6	412	417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
9	NC_019673	CGC	2	6	429	434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
10	NC_019673	GCG	2	6	461	466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
11	NC_019673	TCG	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
12	NC_019673	CGG	3	9	587	595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
13	NC_019673	CTG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
14	NC_019673	GAG	2	6	742	747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
15	NC_019673	TCA	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601839
16	NC_019673	CGA	2	6	777	782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
17	NC_019673	GCG	2	6	801	806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
18	NC_019673	TGC	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
19	NC_019673	TGG	2	6	830	835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601839
20	NC_019673	AGG	2	6	872	877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
21	NC_019673	TTC	2	6	880	885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601839
22	NC_019673	TCC	2	6	931	936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601839
23	NC_019673	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
24	NC_019673	GGA	2	6	966	971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
25	NC_019673	GCC	2	6	1017	1022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
26	NC_019673	AAG	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601839
27	NC_019673	GCC	2	6	1060	1065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
28	NC_019673	TGC	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
29	NC_019673	CGA	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
30	NC_019673	CCG	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
31	NC_019673	TTC	2	6	1291	1296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601839
32	NC_019673	GAC	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
33	NC_019673	CGG	2	6	1422	1427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
34	NC_019673	ACG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
35	NC_019673	AAG	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601839
36	NC_019673	GCC	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
37	NC_019673	AGC	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
38	NC_019673	GTC	2	6	1558	1563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019673	CGC	2	6	1594	1599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019673	ACC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019673	GCG	2	6	1693	1698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019673	CGC	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019673	GCG	2	6	1945	1950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019673	GGC	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019673	CGG	2	6	2002	2007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019673	GCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019673	CCG	2	6	2154	2159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019673	GCG	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019673	TGT	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019673	CTG	2	6	2275	2280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019673	TGT	2	6	2285	2290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019673	GCC	2	6	2604	2609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
53	NC_019673	GGT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601840
54	NC_019673	GGA	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601840
55	NC_019673	GCG	2	6	2711	2716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
56	NC_019673	CGG	2	6	2736	2741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
57	NC_019673	ACC	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
58	NC_019673	CGG	2	6	2972	2977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
59	NC_019673	GAC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
60	NC_019673	CGA	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
61	NC_019673	ACG	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
62	NC_019673	ACG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
63	NC_019673	ACC	3	9	3244	3252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
64	NC_019673	GCT	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
65	NC_019673	GCT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
66	NC_019673	CGG	2	6	3308	3313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
67	NC_019673	CCG	2	6	3425	3430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
68	NC_019673	GAC	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
69	NC_019673	GAG	3	9	3454	3462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601840
70	NC_019673	CAC	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
71	NC_019673	GCC	2	6	3578	3583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
72	NC_019673	GCT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
73	NC_019673	TCG	2	6	3730	3735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
74	NC_019673	CCG	2	6	3773	3778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
75	NC_019673	GGT	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601841
76	NC_019673	TGG	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601841
77	NC_019673	CGC	2	6	3860	3865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
78	NC_019673	CTG	2	6	3936	3941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
79	NC_019673	CGG	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
80	NC_019673	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
81	NC_019673	GAA	2	6	3995	4000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601841
82	NC_019673	CGG	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
83	NC_019673	CGG	2	6	4094	4099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
84	NC_019673	AGG	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
85	NC_019673	CTG	2	6	4272	4277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
86	NC_019673	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
87	NC_019673	GCT	2	6	4352	4357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
88	NC_019673	CTG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
89	NC_019673	GAC	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
90	NC_019673	GGA	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
91	NC_019673	GAG	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
92	NC_019673	CCG	2	6	4489	4494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
93	NC_019673	GAC	2	6	4524	4529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
94	NC_019673	CGC	2	6	4550	4555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
95	NC_019673	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
96	NC_019673	TCG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
97	NC_019673	GTG	2	6	4839	4844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
98	NC_019673	GGT	2	6	4853	4858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
99	NC_019673	GCT	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
100	NC_019673	CGG	2	6	4897	4902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
101	NC_019673	GGA	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
102	NC_019673	GCG	2	6	5011	5016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
103	NC_019673	GCG	3	9	5027	5035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
104	NC_019673	CGA	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
105	NC_019673	GCT	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
106	NC_019673	AGC	2	6	5110	5115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
107	NC_019673	GCG	2	6	5116	5121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
108	NC_019673	GCT	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
109	NC_019673	CGG	2	6	5152	5157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
110	NC_019673	GCT	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
111	NC_019673	TGG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
112	NC_019673	CGC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601842
113	NC_019673	GGA	2	6	5363	5368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
114	NC_019673	CGA	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
115	NC_019673	CGG	2	6	5534	5539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
116	NC_019673	TGC	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
117	NC_019673	CGG	3	9	5616	5624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
118	NC_019673	GGC	4	12	5639	5650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
119	NC_019673	TCA	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601842
120	NC_019673	CGG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
121	NC_019673	GAG	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
122	NC_019673	TCG	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
123	NC_019673	GCG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
124	NC_019673	CGG	3	9	5980	5988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
125	NC_019673	GAC	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601843
126	NC_019673	CGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601843
127	NC_019673	CGG	2	6	6087	6092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
128	NC_019673	GCT	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601843
129	NC_019673	CGC	2	6	6249	6254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601843
130	NC_019673	GTG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601843
131	NC_019673	CGG	2	6	6299	6304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
132	NC_019673	GCG	2	6	6387	6392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019673	CAG	2	6	6415	6420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019673	CCG	2	6	6440	6445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019673	TGG	2	6	6501	6506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019673	GAG	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_019673	CGC	2	6	11660	11665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601846
261	NC_019673	TTC	2	6	11759	11764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601846
262	NC_019673	CAA	2	6	11830	11835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433601846
263	NC_019673	GGC	2	6	11911	11916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601846
264	NC_019673	TCG	2	6	11919	11924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601846
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372	NC_019673	GCG	3	9	17005	17013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601854
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375	NC_019673	GTG	2	6	17247	17252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
376	NC_019673	TCA	2	6	17307	17312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601855
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383	NC_019673	CTT	2	6	17530	17535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601855
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385	NC_019673	GGA	2	6	17686	17691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
386	NC_019673	GGC	2	6	17725	17730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601856
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498	NC_019673	CTT	2	6	23857	23862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601861
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