MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 189249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019673	ACC	2	6	8	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601839
2	NC_019673	GCC	2	6	58	63	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
3	NC_019673	GCA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
4	NC_019673	CCG	2	6	277	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
5	NC_019673	CCG	2	6	337	342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
6	NC_019673	CCG	2	6	359	364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
7	NC_019673	CGA	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
8	NC_019673	GAG	2	6	412	417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
9	NC_019673	CGC	2	6	429	434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
10	NC_019673	GCG	2	6	461	466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
11	NC_019673	TCG	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
12	NC_019673	CGG	3	9	587	595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
13	NC_019673	CTG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
14	NC_019673	GAG	2	6	742	747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
15	NC_019673	TCA	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601839
16	NC_019673	CGA	2	6	777	782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
17	NC_019673	GCG	2	6	801	806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
18	NC_019673	TGC	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
19	NC_019673	TGG	2	6	830	835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601839
20	NC_019673	AGG	2	6	872	877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
21	NC_019673	TTC	2	6	880	885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601839
22	NC_019673	TCC	2	6	931	936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601839
23	NC_019673	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
24	NC_019673	GGA	2	6	966	971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
25	NC_019673	GCC	2	6	1017	1022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
26	NC_019673	AAG	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601839
27	NC_019673	GCC	2	6	1060	1065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
28	NC_019673	TGC	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
29	NC_019673	CGA	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
30	NC_019673	CCG	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
31	NC_019673	TTC	2	6	1291	1296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601839
32	NC_019673	GAC	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
33	NC_019673	CGG	2	6	1422	1427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
34	NC_019673	ACG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
35	NC_019673	AAG	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601839
36	NC_019673	GCC	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
37	NC_019673	AGC	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
38	NC_019673	GCC	2	6	2604	2609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
39	NC_019673	GGT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601840
40	NC_019673	GGA	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601840
41	NC_019673	GCG	2	6	2711	2716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
42	NC_019673	CGG	2	6	2736	2741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
43	NC_019673	ACC	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
44	NC_019673	CGG	2	6	2972	2977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
45	NC_019673	GAC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
46	NC_019673	CGA	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
47	NC_019673	ACG	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
48	NC_019673	ACG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
49	NC_019673	ACC	3	9	3244	3252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
50	NC_019673	GCT	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
51	NC_019673	GCT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
52	NC_019673	CGG	2	6	3308	3313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
53	NC_019673	CCG	2	6	3425	3430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
54	NC_019673	GAC	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
55	NC_019673	GAG	3	9	3454	3462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601840
56	NC_019673	CAC	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
57	NC_019673	GCC	2	6	3578	3583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
58	NC_019673	GCT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
59	NC_019673	TCG	2	6	3730	3735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
60	NC_019673	CCG	2	6	3773	3778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
61	NC_019673	GGT	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601841
62	NC_019673	TGG	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601841
63	NC_019673	CGC	2	6	3860	3865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
64	NC_019673	CTG	2	6	3936	3941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
65	NC_019673	CGG	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
66	NC_019673	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
67	NC_019673	GAA	2	6	3995	4000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601841
68	NC_019673	CGG	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
69	NC_019673	CGG	2	6	4094	4099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
70	NC_019673	AGG	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
71	NC_019673	CTG	2	6	4272	4277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
72	NC_019673	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
73	NC_019673	GCT	2	6	4352	4357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
74	NC_019673	CTG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
75	NC_019673	GAC	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
76	NC_019673	GGA	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
77	NC_019673	GAG	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
78	NC_019673	CCG	2	6	4489	4494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
79	NC_019673	GAC	2	6	4524	4529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
80	NC_019673	CGC	2	6	4550	4555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
81	NC_019673	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
82	NC_019673	TCG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
83	NC_019673	GTG	2	6	4839	4844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
84	NC_019673	GGT	2	6	4853	4858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
85	NC_019673	GCT	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
86	NC_019673	CGG	2	6	4897	4902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
87	NC_019673	GGA	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
88	NC_019673	GCG	2	6	5011	5016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
89	NC_019673	GCG	3	9	5027	5035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
90	NC_019673	CGA	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
91	NC_019673	GCT	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
92	NC_019673	AGC	2	6	5110	5115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
93	NC_019673	GCG	2	6	5116	5121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
94	NC_019673	GCT	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
95	NC_019673	CGG	2	6	5152	5157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
96	NC_019673	GCT	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
97	NC_019673	TGG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
98	NC_019673	CGC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601842
99	NC_019673	GGA	2	6	5363	5368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
100	NC_019673	CGA	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
101	NC_019673	CGG	2	6	5534	5539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
102	NC_019673	TGC	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
103	NC_019673	CGG	3	9	5616	5624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
104	NC_019673	GGC	4	12	5639	5650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
105	NC_019673	TCA	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601842
106	NC_019673	CGG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
107	NC_019673	GAG	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
108	NC_019673	TCG	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
109	NC_019673	GCG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
110	NC_019673	CGG	3	9	5980	5988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
111	NC_019673	GAC	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601843
112	NC_019673	CGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601843
113	NC_019673	CGG	2	6	6087	6092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
114	NC_019673	GCT	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601843
115	NC_019673	CGC	2	6	6249	6254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601843
116	NC_019673	GTG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601843
117	NC_019673	CGG	2	6	6299	6304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
118	NC_019673	AAG	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601844
119	NC_019673	CAC	2	6	6723	6728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601844
120	NC_019673	CGA	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601844
121	NC_019673	CTG	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601844
122	NC_019673	CGG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
123	NC_019673	CGA	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601844
124	NC_019673	GGT	2	6	6890	6895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601844
125	NC_019673	GGC	2	6	6915	6920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
126	NC_019673	CGG	2	6	6950	6955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
127	NC_019673	GTG	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601844
128	NC_019673	GAG	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601844
129	NC_019673	GAC	2	6	7106	7111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601844
130	NC_019673	ACC	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601844
131	NC_019673	ACA	2	6	7156	7161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433601844
132	NC_019673	CAT	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601844
133	NC_019673	CGA	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601844
134	NC_019673	GGC	2	6	7280	7285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
135	NC_019673	GGA	2	6	7322	7327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601844
136	NC_019673	GGC	2	6	7488	7493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
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138	NC_019673	GCT	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601844
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140	NC_019673	ATC	2	6	7620	7625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601844
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143	NC_019673	CGG	2	6	7856	7861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
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153	NC_019673	CTG	2	6	8190	8195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601844
154	NC_019673	GCT	2	6	8213	8218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601844
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162	NC_019673	CGA	2	6	8483	8488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601844
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258	NC_019673	CGA	2	6	12955	12960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601848
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261	NC_019673	GCA	2	6	13374	13379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601849
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