MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019566	TTGACA	2	12	2897	2908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400515
2	NC_019566	GTTTTA	2	12	4651	4662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019566	TTGTAT	2	12	5333	5344	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	426400517
4	NC_019566	ATTGAG	2	12	5836	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400517
5	NC_019566	TCTTTA	2	12	6589	6600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	426400518
6	NC_019566	GCTTTC	2	12	6891	6902	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	426400519
7	NC_019566	CTTAAT	2	12	7482	7493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400519
8	NC_019566	ATCTTA	2	12	9583	9594	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400520
9	NC_019566	TAACTT	2	12	12918	12929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019566	TGATAA	2	12	14259	14270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019566	TTTAAT	2	12	14566	14577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019566	CGCTGA	2	12	14865	14876	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	426400528
13	NC_019566	AGGATA	2	12	15709	15720	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	426400528
14	NC_019566	ATTGTG	2	12	18192	18203	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	426400529
15	NC_019566	CTATTT	2	12	20755	20766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	426400531
16	NC_019566	TTTATA	2	12	21963	21974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019566	GTGTAT	2	12	26568	26579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019566	TCTCAA	2	12	29959	29970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019566	GTGAAT	2	12	34662	34673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400544
20	NC_019566	TAATTA	2	12	35684	35695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019566	TGATGG	2	12	36634	36645	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	426400546
22	NC_019566	ACTACC	2	12	41406	41417	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	426400549
23	NC_019566	TTTAAT	2	12	44581	44592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400551
24	NC_019566	TATCAT	2	12	47072	47083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400554
25	NC_019566	ATTAGT	2	12	55759	55770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019566	ATTAAT	2	12	58724	58735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019566	ATTAAT	2	12	59293	59304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019566	TAACCT	2	12	61465	61476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400570
29	NC_019566	CCACGT	2	12	68134	68145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	426400576
30	NC_019566	TTCAGC	2	12	68463	68474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	426400576
31	NC_019566	CTAACT	2	12	72645	72656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019566	AGCTAG	2	12	76834	76845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019566	TTTAAT	2	12	77628	77639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400586
34	NC_019566	CTTATG	2	12	78531	78542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019566	GTTGCT	2	12	78932	78943	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	426400587
36	NC_019566	TTTCAA	2	12	80596	80607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019566	ATTAGG	2	12	82370	82381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400591
38	NC_019566	AATAGG	2	12	83543	83554	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	426400593
39	NC_019566	ATCTTG	2	12	85815	85826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	426400595
40	NC_019566	AATATT	2	12	92336	92347	50 %	50 %	0 %	0 %	426400606
41	NC_019566	TCTATA	2	12	94214	94225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400609
42	NC_019566	GCTGGT	2	12	94606	94617	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	426400610
43	NC_019566	TATTGT	2	12	102776	102787	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019566	GGGTGG	2	12	105329	105340	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	426400620
45	NC_019566	ATTTTA	2	12	107144	107155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019566	CTTGGC	2	12	107491	107502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400624
47	NC_019566	ATCAAT	2	12	111942	111953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	426400626
48	NC_019566	ATATAG	2	12	112542	112553	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	426400627
49	NC_019566	CGATGA	2	12	113815	113826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019566	ATCCGG	2	12	117721	117732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019566	TTAATA	2	12	122539	122550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019566	CATAAT	2	12	123422	123433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019566	AGGCTT	2	12	125963	125974	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	426400635
54	NC_019566	TGATGG	2	12	126690	126701	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	426400636
55	NC_019566	CAAGCT	2	12	140113	140124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	426400649
56	NC_019566	TTTGTG	2	12	140732	140743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400650
57	NC_019566	GAATTT	2	12	144664	144675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019566	TAATAT	2	12	144794	144805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019566	CTTAAC	2	12	144932	144943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019566	GTTTAT	2	12	148725	148736	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019566	TTTAAC	2	12	148890	148901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019566	CGATAT	2	12	155727	155738	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400660
63	NC_019566	TTGGCA	2	12	156612	156623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	426400661
64	NC_019566	GTTTTA	2	12	161928	161939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019566	ACTTTA	2	12	163542	163553	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019566	GTTTTT	2	12	173002	173013	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	426400675
67	NC_019566	AGCTAA	2	12	174242	174253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	426400675
68	NC_019566	TTATGG	2	12	176578	176589	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019566	ATTAGC	2	12	177257	177268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400680
70	NC_019566	CTTCAT	2	12	179115	179126	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	426400681
71	NC_019566	TTATAT	2	12	190325	190336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019566	TTATAT	2	12	194043	194054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400697
73	NC_019566	AAAGCA	2	12	196103	196114	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019566	GGTAAT	2	12	197468	197479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400698
75	NC_019566	CTAGCA	2	12	200387	200398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	426400700
76	NC_019566	GATTTG	2	12	203341	203352	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	426400703
77	NC_019566	AGCCAG	2	12	203785	203796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400703
78	NC_019566	TCCATG	2	12	207025	207036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	426400708
79	NC_019566	AAATTA	2	12	208528	208539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019566	TCGTAA	2	12	209215	209226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400711
81	NC_019566	TACCTT	2	12	213397	213408	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	426400719
82	NC_019566	GAAAAT	2	12	214644	214655	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	426400722
83	NC_019566	TTACCC	2	12	216565	216576	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	426400727
84	NC_019566	CGGATG	2	12	221083	221094	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	426400735
85	NC_019566	AAAAAT	2	12	224537	224548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019566	CGACCT	2	12	233293	233304	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_019566	AAGACC	2	12	233697	233708	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	426400741
88	NC_019566	TCTTAA	2	12	234023	234034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400742
89	NC_019566	TAACCA	2	12	235204	235215	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	426400743
90	NC_019566	AAAAGT	2	12	235806	235817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	426400744
91	NC_019566	CAATTT	2	12	237662	237673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400747
92	NC_019566	GCCTAA	2	12	239100	239111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	426400748
93	NC_019566	ACTTAT	2	12	240398	240409	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400749
94	NC_019566	GTAGCA	2	12	243515	243526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	426400753
95	NC_019566	TATTTT	2	12	246709	246720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019566	TTTAGC	2	12	248690	248701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	426400760
97	NC_019566	TCAGCG	2	12	251689	251700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	426400762
98	NC_019566	TTTAGG	2	12	253298	253309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	426400765
99	NC_019566	TTTAAT	2	12	253320	253331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400765
100	NC_019566	AAAAAT	2	12	254954	254965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019566	TTTAAT	2	12	256551	256562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019566	GATCGT	2	12	260537	260548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	426400773
103	NC_019566	ATTAAT	2	12	262719	262730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019566	TGTTAC	2	12	263747	263758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	426400777
105	NC_019566	TACTGA	2	12	263840	263851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019566	TGCCAA	2	12	266729	266740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	426400782
107	NC_019566	AGATAA	2	12	267830	267841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019566	TACGAT	2	12	275483	275494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400792
109	NC_019566	CAGTAG	2	12	278891	278902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	426400794
110	NC_019566	CCAATC	2	12	282461	282472	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019566	TTTGTT	2	12	284523	284534	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019566	ATGGTG	2	12	286537	286548	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	426400800
113	NC_019566	TCTGGT	2	12	288513	288524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	426400802
114	NC_019566	ATTAGC	2	12	296241	296252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019566	AACTTA	2	12	299131	299142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	426400812
116	NC_019566	TAGTAT	2	12	300745	300756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019566	TTGATT	2	12	301601	301612	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	426400815
118	NC_019566	ATTTTA	2	12	312373	312384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019566	TTATAT	2	12	313025	313036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019566	TTGGTC	2	12	314323	314334	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019566	AGTTTT	2	12	316136	316147	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019566	GCTGTT	2	12	317306	317317	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	426400837
123	NC_019566	CTCCAG	2	12	319482	319493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	426400839
124	NC_019566	CTTGAA	2	12	323346	323357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400842
125	NC_019566	CTTCTA	2	12	325809	325820	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	426400846
126	NC_019566	TAGGCA	2	12	327277	327288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	426400847
127	NC_019566	GATTAT	2	12	329177	329188	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019566	TGTATT	2	12	329605	329616	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	426400849
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130	NC_019566	AAAAAT	2	12	336275	336286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019566	CTATTT	2	12	338942	338953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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142	NC_019566	GTCTAA	2	12	376281	376292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400901
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146	NC_019566	TCCACC	2	12	386439	386450	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	426400912
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150	NC_019566	ATTTCA	2	12	402011	402022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_019566	TCATGA	2	12	405610	405621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426400935
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154	NC_019566	GAAATG	2	12	416960	416971	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	426400946
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162	NC_019566	AATTTT	2	12	451346	451357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019566	AATTTA	2	12	456142	456153	50 %	50 %	0 %	0 %	426400986
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221	NC_019566	ATCAAT	2	12	589479	589490	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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231	NC_019566	ATCTTT	2	12	623610	623621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
232	NC_019566	TAATTA	2	12	623842	623853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_019566	AAATAA	2	12	627266	627277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	426401168
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238	NC_019566	AATAAA	2	12	635074	635085	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_019566	TATAAA	2	12	635935	635946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426401182
240	NC_019566	GTATTA	2	12	636608	636619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
241	NC_019566	TATTAG	2	12	637113	637124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
242	NC_019566	GCACCA	2	12	638834	638845	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	426401183
243	NC_019566	TATTTG	2	12	640408	640419	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
244	NC_019566	ATCTTA	2	12	643460	643471	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
245	NC_019566	AATGAA	2	12	644821	644832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	426401186
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247	NC_019566	AATTTT	2	12	650608	650619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_019566	GAATAG	2	12	651781	651792	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	426401195
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252	NC_019566	ATTGAT	2	12	656660	656671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_019566	TTACCG	2	12	658085	658096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	426401202
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259	NC_019566	TATAAT	2	12	669602	669613	50 %	50 %	0 %	0 %	426401211
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262	NC_019566	TAGCGA	2	12	675732	675743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	426401213
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355	NC_019566	ATCAAT	2	12	921814	921825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
356	NC_019566	TATAGT	2	12	923878	923889	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
357	NC_019566	TATTTA	2	12	924150	924161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_019566	GTGCTT	2	12	926880	926891	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	426401484
359	NC_019566	AATTAA	2	12	927648	927659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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361	NC_019566	TTAATT	2	12	929206	929217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_019566	GCAACT	2	12	1210810	1210821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	426401802
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477	NC_019566	TAATTA	2	12	1232012	1232023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_019566	TTAACT	2	12	1243591	1243602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
481	NC_019566	CAATGA	2	12	1244532	1244543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	426401843
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488	NC_019566	AATTTA	2	12	1273282	1273293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_019566	TGAGCA	2	12	1278164	1278175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	426401872
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