MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 1643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019566	TGAAT	2	10	195	204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019566	AAAAG	2	10	3588	3597	80 %	0 %	20 %	0 %	426400516
3	NC_019566	TAATT	2	10	4205	4214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019566	ATTAA	2	10	4313	4322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019566	ATAAA	3	15	4876	4890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019566	AATTT	2	10	4916	4925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019566	CATTC	2	10	8687	8696	20 %	40 %	0 %	40 %	426400519
8	NC_019566	CAAAG	2	10	10249	10258	60 %	0 %	20 %	20 %	426400521
9	NC_019566	TTAGC	2	10	10988	10997	20 %	40 %	20 %	20 %	426400521
10	NC_019566	AATGA	2	10	15004	15013	60 %	20 %	20 %	0 %	426400528
11	NC_019566	TAACT	2	10	15965	15974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019566	TATAT	2	10	16091	16100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019566	CTTTA	2	10	16270	16279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019566	ATTTT	2	10	16654	16663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019566	CTTTT	2	10	19432	19441	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019566	TAAGT	2	10	20661	20670	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019566	TAAAT	2	10	21864	21873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019566	TCTCC	2	10	22136	22145	0 %	40 %	0 %	60 %	426400533
19	NC_019566	TGGTT	2	10	23220	23229	0 %	60 %	40 %	0 %	426400534
20	NC_019566	TTTGC	2	10	23307	23316	0 %	60 %	20 %	20 %	426400534
21	NC_019566	TTAAT	2	10	24498	24507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019566	AACTA	2	10	24637	24646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019566	ATTTT	2	10	24805	24814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019566	AGTTA	2	10	25505	25514	40 %	40 %	20 %	0 %	426400535
25	NC_019566	TTCAT	2	10	25841	25850	20 %	60 %	0 %	20 %	426400535
26	NC_019566	TAATA	2	10	26892	26901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019566	TTTAG	2	10	27249	27258	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019566	GGAGA	2	10	28295	28304	40 %	0 %	60 %	0 %	426400538
29	NC_019566	AAATT	2	10	29403	29412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019566	ATTTA	2	10	29496	29505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019566	ATCCC	2	10	29637	29646	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_019566	TTATC	2	10	29850	29859	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019566	AAAAT	2	10	30066	30075	80 %	20 %	0 %	0 %	426400539
34	NC_019566	GAGCT	2	10	33371	33380	20 %	20 %	40 %	20 %	426400542
35	NC_019566	TTTAA	2	10	34000	34009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019566	TTTTC	2	10	34226	34235	0 %	80 %	0 %	20 %	426400543
37	NC_019566	TGGCA	2	10	34746	34755	20 %	20 %	40 %	20 %	426400544
38	NC_019566	TAATG	2	10	35452	35461	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019566	TTGGA	2	10	36255	36264	20 %	40 %	40 %	0 %	426400546
40	NC_019566	TCGCT	2	10	36898	36907	0 %	40 %	20 %	40 %	426400546
41	NC_019566	GATTA	2	10	37167	37176	40 %	40 %	20 %	0 %	426400546
42	NC_019566	GATCG	2	10	39812	39821	20 %	20 %	40 %	20 %	426400548
43	NC_019566	ATTAC	2	10	40349	40358	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019566	TTTTA	2	10	42038	42047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019566	ATTTT	2	10	43127	43136	20 %	80 %	0 %	0 %	426400550
46	NC_019566	AGCTA	2	10	44098	44107	40 %	20 %	20 %	20 %	426400551
47	NC_019566	TGGGT	2	10	44530	44539	0 %	40 %	60 %	0 %	426400551
48	NC_019566	TGGCA	2	10	44740	44749	20 %	20 %	40 %	20 %	426400551
49	NC_019566	TATTT	2	10	46412	46421	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019566	TGTTA	2	10	48696	48705	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019566	AAGTA	2	10	50014	50023	60 %	20 %	20 %	0 %	426400558
52	NC_019566	ATTTC	2	10	51242	51251	20 %	60 %	0 %	20 %	426400558
53	NC_019566	ATCGC	2	10	54810	54819	20 %	20 %	20 %	40 %	426400562
54	NC_019566	GTTAT	2	10	56756	56765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019566	AAACT	2	10	57257	57266	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019566	TGTTA	2	10	58509	58518	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019566	AAATT	2	10	58652	58661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019566	AATTA	2	10	58828	58837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019566	AAAAT	2	10	61256	61265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019566	TATTT	2	10	61802	61811	20 %	80 %	0 %	0 %	426400570
61	NC_019566	ATTTT	2	10	62679	62688	20 %	80 %	0 %	0 %	426400570
62	NC_019566	AACTC	2	10	63602	63611	40 %	20 %	0 %	40 %	426400571
63	NC_019566	ATATT	2	10	63718	63727	40 %	60 %	0 %	0 %	426400571
64	NC_019566	CCATC	2	10	66734	66743	20 %	20 %	0 %	60 %	426400576
65	NC_019566	ACCTC	2	10	67441	67450	20 %	20 %	0 %	60 %	426400576
66	NC_019566	CATTG	2	10	69553	69562	20 %	40 %	20 %	20 %	426400577
67	NC_019566	AACAA	2	10	69583	69592	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019566	CTCTT	2	10	70620	70629	0 %	60 %	0 %	40 %	426400578
69	NC_019566	AGCTT	2	10	71342	71351	20 %	40 %	20 %	20 %	426400579
70	NC_019566	TTCAA	2	10	71396	71405	40 %	40 %	0 %	20 %	426400579
71	NC_019566	AACTC	2	10	72602	72611	40 %	20 %	0 %	40 %	426400580
72	NC_019566	ATCTA	2	10	73560	73569	40 %	40 %	0 %	20 %	426400581
73	NC_019566	TCAAT	2	10	74242	74251	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019566	GTCTT	2	10	75118	75127	0 %	60 %	20 %	20 %	426400583
75	NC_019566	CATTC	2	10	75464	75473	20 %	40 %	0 %	40 %	426400583
76	NC_019566	TACTT	2	10	75723	75732	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019566	CATTA	2	10	78808	78817	40 %	40 %	0 %	20 %	426400587
78	NC_019566	TAAGT	2	10	80194	80203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019566	TTGAT	2	10	80490	80499	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019566	GCATT	2	10	81556	81565	20 %	40 %	20 %	20 %	426400589
81	NC_019566	TATAT	2	10	81850	81859	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019566	GTATT	2	10	83084	83093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019566	GATTT	2	10	83302	83311	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019566	ATGGG	2	10	83462	83471	20 %	20 %	60 %	0 %	426400593
85	NC_019566	CCAGC	2	10	85225	85234	20 %	0 %	20 %	60 %	426400595
86	NC_019566	TAATT	2	10	87402	87411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019566	AGTTT	2	10	87524	87533	20 %	60 %	20 %	0 %	426400599
88	NC_019566	TAGGA	2	10	88742	88751	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019566	ACTAG	2	10	89171	89180	40 %	20 %	20 %	20 %	426400603
90	NC_019566	GGCTG	2	10	91108	91117	0 %	20 %	60 %	20 %	426400605
91	NC_019566	GCCAA	2	10	91462	91471	40 %	0 %	20 %	40 %	426400605
92	NC_019566	TAAAT	2	10	93939	93948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019566	ATGAA	2	10	94724	94733	60 %	20 %	20 %	0 %	426400610
94	NC_019566	ACAAA	2	10	94765	94774	80 %	0 %	0 %	20 %	426400610
95	NC_019566	ATTAG	2	10	97981	97990	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019566	GTTTG	2	10	100158	100167	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019566	TTTAC	2	10	100686	100695	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019566	TCAAA	2	10	102002	102011	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019566	AATTT	2	10	102203	102212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019566	TGCTA	2	10	102280	102289	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019566	ATTTT	2	10	102964	102973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019566	TGCAA	2	10	105470	105479	40 %	20 %	20 %	20 %	426400620
103	NC_019566	AAAAT	2	10	105592	105601	80 %	20 %	0 %	0 %	426400620
104	NC_019566	CAGAG	2	10	107786	107795	40 %	0 %	40 %	20 %	426400624
105	NC_019566	TAAAT	2	10	109327	109336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019566	TAGAC	2	10	109357	109366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019566	TCTAA	2	10	109416	109425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019566	CTGCT	2	10	111560	111569	0 %	40 %	20 %	40 %	426400626
109	NC_019566	CTTCC	2	10	112810	112819	0 %	40 %	0 %	60 %	426400628
110	NC_019566	TCGTG	2	10	114422	114431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019566	AGAGG	2	10	117372	117381	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019566	TTGAA	2	10	117390	117399	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019566	ATCCC	2	10	118596	118605	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_019566	TTGTT	2	10	119010	119019	0 %	80 %	20 %	0 %	426400630
115	NC_019566	AACTC	2	10	119277	119286	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_019566	TTAAT	2	10	119420	119429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019566	AAGTA	2	10	119616	119625	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019566	ATTCT	2	10	122416	122425	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019566	TTTAA	2	10	123201	123210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019566	TTAAT	2	10	123320	123329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019566	TCTTT	2	10	123435	123444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019566	TAGAT	2	10	123655	123664	40 %	40 %	20 %	0 %	426400633
123	NC_019566	TTTAT	2	10	124275	124284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019566	TTAAT	2	10	124386	124395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019566	AAATT	2	10	124489	124498	60 %	40 %	0 %	0 %	426400634
126	NC_019566	AAATA	2	10	125720	125729	80 %	20 %	0 %	0 %	426400635
127	NC_019566	TGGTT	2	10	126027	126036	0 %	60 %	40 %	0 %	426400636
128	NC_019566	CTCAC	2	10	127450	127459	20 %	20 %	0 %	60 %	426400637
129	NC_019566	GTGAG	2	10	127492	127501	20 %	20 %	60 %	0 %	426400637
130	NC_019566	GCTTT	2	10	127855	127864	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019566	ATTCT	2	10	127926	127935	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019566	CAAAA	2	10	128448	128457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019566	CCAAT	2	10	128922	128931	40 %	20 %	0 %	40 %	426400639
134	NC_019566	AAAAG	2	10	129117	129126	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019566	CAACC	2	10	130572	130581	40 %	0 %	0 %	60 %	426400640
136	NC_019566	TGCTG	2	10	131458	131467	0 %	40 %	40 %	20 %	426400642
137	NC_019566	TAATT	2	10	131563	131572	40 %	60 %	0 %	0 %	426400642
138	NC_019566	ACAAA	2	10	131796	131805	80 %	0 %	0 %	20 %	426400642
139	NC_019566	TGCTG	2	10	132388	132397	0 %	40 %	40 %	20 %	426400642
140	NC_019566	TATCC	2	10	133987	133996	20 %	40 %	0 %	40 %	426400643
141	NC_019566	TAATA	2	10	135215	135224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019566	TATTG	2	10	135640	135649	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019566	ATTTC	2	10	138014	138023	20 %	60 %	0 %	20 %	426400647
144	NC_019566	TTAAT	2	10	138129	138138	40 %	60 %	0 %	0 %	426400647
145	NC_019566	AATAA	2	10	138437	138446	80 %	20 %	0 %	0 %	426400647
146	NC_019566	AAATT	2	10	139330	139339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019566	AATCC	2	10	141300	141309	40 %	20 %	0 %	40 %	426400651
148	NC_019566	TTCTT	2	10	144876	144885	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_019566	ATATA	2	10	145282	145291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019566	AAAAT	2	10	147639	147648	80 %	20 %	0 %	0 %	426400654
151	NC_019566	AATTT	2	10	149136	149145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019566	TTAGC	2	10	149781	149790	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_019566	GATTA	2	10	150657	150666	40 %	40 %	20 %	0 %	426400656
154	NC_019566	TTATT	2	10	151265	151274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019566	TATTT	2	10	151519	151528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019566	TTCTA	2	10	151799	151808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_019566	ATTAA	2	10	151859	151868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019566	TTTAT	2	10	152668	152677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019566	CATGT	2	10	152931	152940	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_019566	ATGGT	2	10	153998	154007	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019566	AATTA	2	10	154678	154687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019566	GAGCT	2	10	155152	155161	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_019566	TATTT	2	10	155812	155821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_019566	ATTAT	2	10	159364	159373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_019566	TAAAA	2	10	159670	159679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019566	AATCG	2	10	160170	160179	40 %	20 %	20 %	20 %	426400663
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171	NC_019566	TAATT	2	10	161369	161378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_019566	TAATA	2	10	162528	162537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_019566	CTTTT	2	10	170988	170997	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_019566	TAATA	2	10	171053	171062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_019566	TATAA	2	10	171161	171170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_019566	ATTTT	2	10	177510	177519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_019566	TTTAT	2	10	177638	177647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_019566	ATTTC	2	10	179437	179446	20 %	60 %	0 %	20 %	426400682
192	NC_019566	TGCAC	2	10	179510	179519	20 %	20 %	20 %	40 %	426400682
193	NC_019566	TTGTA	2	10	179647	179656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_019566	TGGAT	2	10	180062	180071	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
195	NC_019566	TAAAT	2	10	180912	180921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_019566	ATATT	3	15	182985	182999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_019566	TTATA	2	10	185787	185796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_019566	TATTT	2	10	188541	188550	20 %	80 %	0 %	0 %	426400693
204	NC_019566	TTTTA	2	10	188624	188633	20 %	80 %	0 %	0 %	426400693
205	NC_019566	TAGAT	2	10	190342	190351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
206	NC_019566	GTTTT	2	10	190602	190611	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
207	NC_019566	AATAT	2	10	190797	190806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
208	NC_019566	ATTTT	2	10	190919	190928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_019566	TAAAA	2	10	191069	191078	80 %	20 %	0 %	0 %	426400695
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225	NC_019566	AACTA	2	10	204899	204908	60 %	20 %	0 %	20 %	426400705
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253	NC_019566	GCATT	2	10	241157	241166	20 %	40 %	20 %	20 %	426400749
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264	NC_019566	ATTTT	2	10	249636	249645	20 %	80 %	0 %	0 %	426400761
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270	NC_019566	TTGTT	2	10	252521	252530	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_019566	AGGTA	2	10	257533	257542	40 %	20 %	40 %	0 %	426400770
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277	NC_019566	ATAGG	2	10	260214	260223	40 %	20 %	40 %	0 %	426400773
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279	NC_019566	GAAAT	2	10	261242	261251	60 %	20 %	20 %	0 %	426400773
280	NC_019566	TTTTA	2	10	263982	263991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_019566	TGAAT	2	10	264001	264010	40 %	40 %	20 %	0 %	426400778
282	NC_019566	TAAGG	2	10	265102	265111	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_019566	GTTGA	2	10	269810	269819	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
289	NC_019566	ATACT	2	10	270191	270200	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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301	NC_019566	TCTGA	2	10	284984	284993	20 %	40 %	20 %	20 %	426400799
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399	NC_019566	TGATT	2	10	360767	360776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_019566	TTATA	2	10	408505	408514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_019566	TATTT	2	10	409351	409360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_019566	TACTA	2	10	409677	409686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
456	NC_019566	TTTAT	2	10	409933	409942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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