MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019566	AAAAG	2	10	3588	3597	80 %	0 %	20 %	0 %	426400516
2	NC_019566	CATTC	2	10	8687	8696	20 %	40 %	0 %	40 %	426400519
3	NC_019566	CAAAG	2	10	10249	10258	60 %	0 %	20 %	20 %	426400521
4	NC_019566	TTAGC	2	10	10988	10997	20 %	40 %	20 %	20 %	426400521
5	NC_019566	AATGA	2	10	15004	15013	60 %	20 %	20 %	0 %	426400528
6	NC_019566	TCTCC	2	10	22136	22145	0 %	40 %	0 %	60 %	426400533
7	NC_019566	TGGTT	2	10	23220	23229	0 %	60 %	40 %	0 %	426400534
8	NC_019566	TTTGC	2	10	23307	23316	0 %	60 %	20 %	20 %	426400534
9	NC_019566	AGTTA	2	10	25505	25514	40 %	40 %	20 %	0 %	426400535
10	NC_019566	TTCAT	2	10	25841	25850	20 %	60 %	0 %	20 %	426400535
11	NC_019566	GGAGA	2	10	28295	28304	40 %	0 %	60 %	0 %	426400538
12	NC_019566	AAAAT	2	10	30066	30075	80 %	20 %	0 %	0 %	426400539
13	NC_019566	GAGCT	2	10	33371	33380	20 %	20 %	40 %	20 %	426400542
14	NC_019566	TTTTC	2	10	34226	34235	0 %	80 %	0 %	20 %	426400543
15	NC_019566	TGGCA	2	10	34746	34755	20 %	20 %	40 %	20 %	426400544
16	NC_019566	TTGGA	2	10	36255	36264	20 %	40 %	40 %	0 %	426400546
17	NC_019566	TCGCT	2	10	36898	36907	0 %	40 %	20 %	40 %	426400546
18	NC_019566	GATTA	2	10	37167	37176	40 %	40 %	20 %	0 %	426400546
19	NC_019566	GATCG	2	10	39812	39821	20 %	20 %	40 %	20 %	426400548
20	NC_019566	ATTTT	2	10	43127	43136	20 %	80 %	0 %	0 %	426400550
21	NC_019566	AGCTA	2	10	44098	44107	40 %	20 %	20 %	20 %	426400551
22	NC_019566	TGGGT	2	10	44530	44539	0 %	40 %	60 %	0 %	426400551
23	NC_019566	TGGCA	2	10	44740	44749	20 %	20 %	40 %	20 %	426400551
24	NC_019566	AAGTA	2	10	50014	50023	60 %	20 %	20 %	0 %	426400558
25	NC_019566	ATTTC	2	10	51242	51251	20 %	60 %	0 %	20 %	426400558
26	NC_019566	ATCGC	2	10	54810	54819	20 %	20 %	20 %	40 %	426400562
27	NC_019566	TATTT	2	10	61802	61811	20 %	80 %	0 %	0 %	426400570
28	NC_019566	ATTTT	2	10	62679	62688	20 %	80 %	0 %	0 %	426400570
29	NC_019566	AACTC	2	10	63602	63611	40 %	20 %	0 %	40 %	426400571
30	NC_019566	ATATT	2	10	63718	63727	40 %	60 %	0 %	0 %	426400571
31	NC_019566	CCATC	2	10	66734	66743	20 %	20 %	0 %	60 %	426400576
32	NC_019566	ACCTC	2	10	67441	67450	20 %	20 %	0 %	60 %	426400576
33	NC_019566	CATTG	2	10	69553	69562	20 %	40 %	20 %	20 %	426400577
34	NC_019566	CTCTT	2	10	70620	70629	0 %	60 %	0 %	40 %	426400578
35	NC_019566	AGCTT	2	10	71342	71351	20 %	40 %	20 %	20 %	426400579
36	NC_019566	TTCAA	2	10	71396	71405	40 %	40 %	0 %	20 %	426400579
37	NC_019566	AACTC	2	10	72602	72611	40 %	20 %	0 %	40 %	426400580
38	NC_019566	ATCTA	2	10	73560	73569	40 %	40 %	0 %	20 %	426400581
39	NC_019566	GTCTT	2	10	75118	75127	0 %	60 %	20 %	20 %	426400583
40	NC_019566	CATTC	2	10	75464	75473	20 %	40 %	0 %	40 %	426400583
41	NC_019566	CATTA	2	10	78808	78817	40 %	40 %	0 %	20 %	426400587
42	NC_019566	GCATT	2	10	81556	81565	20 %	40 %	20 %	20 %	426400589
43	NC_019566	ATGGG	2	10	83462	83471	20 %	20 %	60 %	0 %	426400593
44	NC_019566	CCAGC	2	10	85225	85234	20 %	0 %	20 %	60 %	426400595
45	NC_019566	AGTTT	2	10	87524	87533	20 %	60 %	20 %	0 %	426400599
46	NC_019566	ACTAG	2	10	89171	89180	40 %	20 %	20 %	20 %	426400603
47	NC_019566	GGCTG	2	10	91108	91117	0 %	20 %	60 %	20 %	426400605
48	NC_019566	GCCAA	2	10	91462	91471	40 %	0 %	20 %	40 %	426400605
49	NC_019566	ATGAA	2	10	94724	94733	60 %	20 %	20 %	0 %	426400610
50	NC_019566	ACAAA	2	10	94765	94774	80 %	0 %	0 %	20 %	426400610
51	NC_019566	TGCAA	2	10	105470	105479	40 %	20 %	20 %	20 %	426400620
52	NC_019566	AAAAT	2	10	105592	105601	80 %	20 %	0 %	0 %	426400620
53	NC_019566	CAGAG	2	10	107786	107795	40 %	0 %	40 %	20 %	426400624
54	NC_019566	CTGCT	2	10	111560	111569	0 %	40 %	20 %	40 %	426400626
55	NC_019566	CTTCC	2	10	112810	112819	0 %	40 %	0 %	60 %	426400628
56	NC_019566	TTGTT	2	10	119010	119019	0 %	80 %	20 %	0 %	426400630
57	NC_019566	TAGAT	2	10	123655	123664	40 %	40 %	20 %	0 %	426400633
58	NC_019566	AAATT	2	10	124489	124498	60 %	40 %	0 %	0 %	426400634
59	NC_019566	AAATA	2	10	125720	125729	80 %	20 %	0 %	0 %	426400635
60	NC_019566	TGGTT	2	10	126027	126036	0 %	60 %	40 %	0 %	426400636
61	NC_019566	CTCAC	2	10	127450	127459	20 %	20 %	0 %	60 %	426400637
62	NC_019566	GTGAG	2	10	127492	127501	20 %	20 %	60 %	0 %	426400637
63	NC_019566	CCAAT	2	10	128922	128931	40 %	20 %	0 %	40 %	426400639
64	NC_019566	CAACC	2	10	130572	130581	40 %	0 %	0 %	60 %	426400640
65	NC_019566	TGCTG	2	10	131458	131467	0 %	40 %	40 %	20 %	426400642
66	NC_019566	TAATT	2	10	131563	131572	40 %	60 %	0 %	0 %	426400642
67	NC_019566	ACAAA	2	10	131796	131805	80 %	0 %	0 %	20 %	426400642
68	NC_019566	TGCTG	2	10	132388	132397	0 %	40 %	40 %	20 %	426400642
69	NC_019566	TATCC	2	10	133987	133996	20 %	40 %	0 %	40 %	426400643
70	NC_019566	ATTTC	2	10	138014	138023	20 %	60 %	0 %	20 %	426400647
71	NC_019566	TTAAT	2	10	138129	138138	40 %	60 %	0 %	0 %	426400647
72	NC_019566	AATAA	2	10	138437	138446	80 %	20 %	0 %	0 %	426400647
73	NC_019566	AATCC	2	10	141300	141309	40 %	20 %	0 %	40 %	426400651
74	NC_019566	AAAAT	2	10	147639	147648	80 %	20 %	0 %	0 %	426400654
75	NC_019566	GATTA	2	10	150657	150666	40 %	40 %	20 %	0 %	426400656
76	NC_019566	AATCG	2	10	160170	160179	40 %	20 %	20 %	20 %	426400663
77	NC_019566	TTTCC	2	10	160431	160440	0 %	60 %	0 %	40 %	426400663
78	NC_019566	TTGTT	2	10	160909	160918	0 %	80 %	20 %	0 %	426400663
79	NC_019566	GGCAG	2	10	162786	162795	20 %	0 %	60 %	20 %	426400666
80	NC_019566	TTGGA	2	10	163092	163101	20 %	40 %	40 %	0 %	426400666
81	NC_019566	ACCTC	2	10	164962	164971	20 %	20 %	0 %	60 %	426400668
82	NC_019566	TTTAG	2	10	165572	165581	20 %	60 %	20 %	0 %	426400669
83	NC_019566	CCTTT	2	10	166948	166957	0 %	60 %	0 %	40 %	426400669
84	NC_019566	TGCAT	2	10	169228	169237	20 %	40 %	20 %	20 %	426400670
85	NC_019566	CTGAT	2	10	178040	178049	20 %	40 %	20 %	20 %	426400681
86	NC_019566	ATTTC	2	10	179437	179446	20 %	60 %	0 %	20 %	426400682
87	NC_019566	TGCAC	2	10	179510	179519	20 %	20 %	20 %	40 %	426400682
88	NC_019566	CGAAG	2	10	181204	181213	40 %	0 %	40 %	20 %	426400684
89	NC_019566	TTTAG	2	10	181686	181695	20 %	60 %	20 %	0 %	426400684
90	NC_019566	AAATT	2	10	188304	188313	60 %	40 %	0 %	0 %	426400692
91	NC_019566	TATTT	2	10	188541	188550	20 %	80 %	0 %	0 %	426400693
92	NC_019566	TTTTA	2	10	188624	188633	20 %	80 %	0 %	0 %	426400693
93	NC_019566	TAAAA	2	10	191069	191078	80 %	20 %	0 %	0 %	426400695
94	NC_019566	TTAAA	2	10	191137	191146	60 %	40 %	0 %	0 %	426400695
95	NC_019566	AATTT	2	10	193592	193601	40 %	60 %	0 %	0 %	426400697
96	NC_019566	CTTTA	2	10	194104	194113	20 %	60 %	0 %	20 %	426400697
97	NC_019566	GTTTA	2	10	194653	194662	20 %	60 %	20 %	0 %	426400697
98	NC_019566	TACTC	2	10	198990	198999	20 %	40 %	0 %	40 %	426400699
99	NC_019566	AACTA	2	10	204899	204908	60 %	20 %	0 %	20 %	426400705
100	NC_019566	ATTAT	2	10	209985	209994	40 %	60 %	0 %	0 %	426400713
101	NC_019566	TCTTT	2	10	212938	212947	0 %	80 %	0 %	20 %	426400717
102	NC_019566	ACTTG	2	10	214312	214321	20 %	40 %	20 %	20 %	426400721
103	NC_019566	TCACG	2	10	217743	217752	20 %	20 %	20 %	40 %	426400729
104	NC_019566	AATTT	2	10	217830	217839	40 %	60 %	0 %	0 %	426400729
105	NC_019566	ATCAA	2	10	219069	219078	60 %	20 %	0 %	20 %	426400732
106	NC_019566	AGTTA	2	10	220544	220553	40 %	40 %	20 %	0 %	426400734
107	NC_019566	CAGTA	2	10	220953	220962	40 %	20 %	20 %	20 %	426400735
108	NC_019566	GAAAA	2	10	222018	222027	80 %	0 %	20 %	0 %	426400736
109	NC_019566	ATCCA	2	10	223432	223441	40 %	20 %	0 %	40 %	426400736
110	NC_019566	GCGAC	2	10	224127	224136	20 %	0 %	40 %	40 %	426400737
111	NC_019566	TGCAG	2	10	224450	224459	20 %	20 %	40 %	20 %	426400738
112	NC_019566	GAAGC	2	10	225068	225077	40 %	0 %	40 %	20 %	426400739
113	NC_019566	AAAGT	2	10	225185	225194	60 %	20 %	20 %	0 %	426400739
114	NC_019566	ACAAT	2	10	226582	226591	60 %	20 %	0 %	20 %	426400739
115	NC_019566	AAATG	2	10	227063	227072	60 %	20 %	20 %	0 %	426400739
116	NC_019566	TGGCT	2	10	230339	230348	0 %	40 %	40 %	20 %	426400740
117	NC_019566	CTGAC	2	10	231812	231821	20 %	20 %	20 %	40 %	426400740
118	NC_019566	TTGAT	2	10	234507	234516	20 %	60 %	20 %	0 %	426400742
119	NC_019566	GGTTC	2	10	234532	234541	0 %	40 %	40 %	20 %	426400742
120	NC_019566	TGTCA	2	10	236733	236742	20 %	40 %	20 %	20 %	426400745
121	NC_019566	ATTTT	2	10	237205	237214	20 %	80 %	0 %	0 %	426400747
122	NC_019566	AGAGC	2	10	237880	237889	40 %	0 %	40 %	20 %	426400747
123	NC_019566	GCATT	2	10	241157	241166	20 %	40 %	20 %	20 %	426400749
124	NC_019566	ATCTT	2	10	245123	245132	20 %	60 %	0 %	20 %	426400756
125	NC_019566	GCTTC	2	10	245267	245276	0 %	40 %	20 %	40 %	426400756
126	NC_019566	CAGTG	2	10	245542	245551	20 %	20 %	40 %	20 %	426400756
127	NC_019566	TTATC	2	10	246793	246802	20 %	60 %	0 %	20 %	426400758
128	NC_019566	GTTTG	2	10	247214	247223	0 %	60 %	40 %	0 %	426400759
129	NC_019566	ACGTA	2	10	247961	247970	40 %	20 %	20 %	20 %	426400759
130	NC_019566	TTAAT	2	10	248673	248682	40 %	60 %	0 %	0 %	426400760
131	NC_019566	ATTTT	2	10	249636	249645	20 %	80 %	0 %	0 %	426400761
132	NC_019566	TTTGG	2	10	249943	249952	0 %	60 %	40 %	0 %	426400762
133	NC_019566	TTTAC	2	10	250807	250816	20 %	60 %	0 %	20 %	426400762
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