MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 5560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019566	TGTA	2	8	165	172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019566	TAAT	2	8	242	249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019566	AGAT	2	8	286	293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019566	TAAT	2	8	330	337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019566	CTAT	2	8	1435	1442	25 %	50 %	0 %	25 %	426400513
6	NC_019566	ATCG	2	8	1677	1684	25 %	25 %	25 %	25 %	426400513
7	NC_019566	AAAG	2	8	2448	2455	75 %	0 %	25 %	0 %	426400514
8	NC_019566	TTTA	2	8	2963	2970	25 %	75 %	0 %	0 %	426400515
9	NC_019566	ATTG	2	8	2973	2980	25 %	50 %	25 %	0 %	426400515
10	NC_019566	CTAG	2	8	3301	3308	25 %	25 %	25 %	25 %	426400516
11	NC_019566	ATGA	2	8	3649	3656	50 %	25 %	25 %	0 %	426400516
12	NC_019566	TTAA	2	8	3808	3815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019566	TATT	2	8	3921	3928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019566	TTTA	2	8	3931	3938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019566	GTAA	2	8	3958	3965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019566	GTAT	2	8	4050	4057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019566	CTTG	2	8	4174	4181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019566	TAAT	2	8	4183	4190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019566	ATTA	2	8	4419	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019566	TATT	2	8	6459	6466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019566	AAAT	2	8	6470	6477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019566	TGCC	2	8	7628	7635	0 %	25 %	25 %	50 %	426400519
23	NC_019566	ATTG	2	8	9322	9329	25 %	50 %	25 %	0 %	426400519
24	NC_019566	AATG	2	8	9426	9433	50 %	25 %	25 %	0 %	426400519
25	NC_019566	TTTC	2	8	10184	10191	0 %	75 %	0 %	25 %	426400521
26	NC_019566	ATCC	2	8	10427	10434	25 %	25 %	0 %	50 %	426400521
27	NC_019566	TATT	2	8	11464	11471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019566	AAAT	2	8	11472	11479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019566	GTTA	2	8	11554	11561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019566	AAGC	2	8	11601	11608	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019566	TAAT	2	8	11732	11739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019566	TAAA	2	8	11752	11759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019566	AGTT	2	8	12305	12312	25 %	50 %	25 %	0 %	426400524
34	NC_019566	GTTT	2	8	12882	12889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019566	AAAT	2	8	13225	13232	75 %	25 %	0 %	0 %	426400525
36	NC_019566	TGAA	2	8	13329	13336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019566	ACAG	2	8	13634	13641	50 %	0 %	25 %	25 %	426400526
38	NC_019566	GCTC	2	8	13834	13841	0 %	25 %	25 %	50 %	426400526
39	NC_019566	ATTT	2	8	13918	13925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019566	TGAT	2	8	14054	14061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019566	TAAT	2	8	14188	14195	50 %	50 %	0 %	0 %	426400527
42	NC_019566	CTAG	2	8	14230	14237	25 %	25 %	25 %	25 %	426400527
43	NC_019566	AATC	2	8	14292	14299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019566	ATTT	2	8	14341	14348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019566	GTTA	2	8	14514	14521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019566	TTAT	2	8	14529	14536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019566	GGAA	2	8	15255	15262	50 %	0 %	50 %	0 %	426400528
48	NC_019566	AGTA	2	8	15975	15982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019566	ATTT	2	8	16054	16061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019566	GCTT	2	8	16292	16299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019566	GATA	2	8	16466	16473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019566	TTAA	2	8	16800	16807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019566	TTTA	2	8	16841	16848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019566	TTAA	2	8	16875	16882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019566	ATTA	2	8	17723	17730	50 %	50 %	0 %	0 %	426400529
56	NC_019566	GATA	2	8	18338	18345	50 %	25 %	25 %	0 %	426400529
57	NC_019566	AGTT	2	8	18404	18411	25 %	50 %	25 %	0 %	426400529
58	NC_019566	GCTT	2	8	18513	18520	0 %	50 %	25 %	25 %	426400529
59	NC_019566	ATCT	2	8	18534	18541	25 %	50 %	0 %	25 %	426400529
60	NC_019566	CTTT	2	8	19085	19092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019566	TGTT	2	8	19121	19128	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019566	TTTA	2	8	19211	19218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019566	TCTT	2	8	19271	19278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019566	TTAA	2	8	19364	19371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019566	TATT	2	8	19533	19540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019566	CTTG	2	8	19776	19783	0 %	50 %	25 %	25 %	426400530
67	NC_019566	CTTG	2	8	19853	19860	0 %	50 %	25 %	25 %	426400530
68	NC_019566	GTTG	3	12	19883	19894	0 %	50 %	50 %	0 %	426400530
69	NC_019566	CTAT	2	8	20328	20335	25 %	50 %	0 %	25 %	426400530
70	NC_019566	CAAA	2	8	20346	20353	75 %	0 %	0 %	25 %	426400530
71	NC_019566	TAAA	2	8	20934	20941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019566	ATTT	2	8	21071	21078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019566	TGCT	2	8	21169	21176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019566	ATTG	2	8	21435	21442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019566	AACA	2	8	21446	21453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019566	TTTC	2	8	21508	21515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019566	TGAG	2	8	21718	21725	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019566	ATTT	2	8	21801	21808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019566	TATG	2	8	22089	22096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019566	AATC	2	8	22289	22296	50 %	25 %	0 %	25 %	426400533
81	NC_019566	CTAA	2	8	22485	22492	50 %	25 %	0 %	25 %	426400533
82	NC_019566	GTAT	2	8	23120	23127	25 %	50 %	25 %	0 %	426400534
83	NC_019566	AAGT	2	8	23467	23474	50 %	25 %	25 %	0 %	426400534
84	NC_019566	CTTC	2	8	23593	23600	0 %	50 %	0 %	50 %	426400534
85	NC_019566	ATTT	2	8	23666	23673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019566	AATT	2	8	23932	23939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019566	GAAT	2	8	24138	24145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019566	TCAA	2	8	24170	24177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019566	CTTA	2	8	24687	24694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019566	TATC	2	8	24970	24977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019566	TGCG	2	8	25597	25604	0 %	25 %	50 %	25 %	426400535
92	NC_019566	AGAA	2	8	25609	25616	75 %	0 %	25 %	0 %	426400535
93	NC_019566	CAAT	2	8	26194	26201	50 %	25 %	0 %	25 %	426400535
94	NC_019566	TTGT	2	8	26421	26428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019566	GGTA	2	8	26597	26604	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019566	ATTT	2	8	27015	27022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019566	TGAT	2	8	27612	27619	25 %	50 %	25 %	0 %	426400537
98	NC_019566	ACTA	2	8	28500	28507	50 %	25 %	0 %	25 %	426400538
99	NC_019566	TAAT	2	8	28761	28768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019566	TAAT	2	8	28846	28853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019566	ATTT	2	8	28909	28916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019566	AACT	2	8	29330	29337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019566	TAAT	2	8	29772	29779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019566	TTAC	2	8	29805	29812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019566	ATTT	2	8	29931	29938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019566	TTAG	2	8	30340	30347	25 %	50 %	25 %	0 %	426400539
107	NC_019566	AGAT	2	8	31230	31237	50 %	25 %	25 %	0 %	426400540
108	NC_019566	AGTA	2	8	31979	31986	50 %	25 %	25 %	0 %	426400541
109	NC_019566	ATAA	2	8	32450	32457	75 %	25 %	0 %	0 %	426400541
110	NC_019566	TTAT	2	8	32628	32635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019566	CAGA	2	8	32855	32862	50 %	0 %	25 %	25 %	426400542
112	NC_019566	TAAC	2	8	33401	33408	50 %	25 %	0 %	25 %	426400542
113	NC_019566	TAAA	2	8	33549	33556	75 %	25 %	0 %	0 %	426400542
114	NC_019566	ATTT	2	8	33748	33755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019566	TTTA	2	8	33936	33943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019566	TTTC	2	8	33965	33972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019566	TGCA	2	8	34106	34113	25 %	25 %	25 %	25 %	426400543
118	NC_019566	TCTT	2	8	34205	34212	0 %	75 %	0 %	25 %	426400543
119	NC_019566	CGTG	2	8	34485	34492	0 %	25 %	50 %	25 %	426400544
120	NC_019566	GAAA	2	8	34822	34829	75 %	0 %	25 %	0 %	426400544
121	NC_019566	CCAA	2	8	35046	35053	50 %	0 %	0 %	50 %	426400544
122	NC_019566	TTTA	2	8	35109	35116	25 %	75 %	0 %	0 %	426400544
123	NC_019566	TAAT	2	8	35285	35292	50 %	50 %	0 %	0 %	426400545
124	NC_019566	AGTT	2	8	35709	35716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019566	TTAA	2	8	35761	35768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019566	ATTT	2	8	36067	36074	25 %	75 %	0 %	0 %	426400546
127	NC_019566	TGGT	2	8	36117	36124	0 %	50 %	50 %	0 %	426400546
128	NC_019566	AAAG	2	8	36307	36314	75 %	0 %	25 %	0 %	426400546
129	NC_019566	TATT	2	8	36366	36373	25 %	75 %	0 %	0 %	426400546
130	NC_019566	AAAT	2	8	37039	37046	75 %	25 %	0 %	0 %	426400546
131	NC_019566	TTTC	2	8	37219	37226	0 %	75 %	0 %	25 %	426400546
132	NC_019566	TTAA	2	8	37417	37424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019566	ATTA	2	8	37588	37595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019566	AAAT	2	8	37704	37711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019566	AACA	2	8	37758	37765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019566	ACTA	2	8	38329	38336	50 %	25 %	0 %	25 %	426400547
137	NC_019566	AAGC	2	8	38373	38380	50 %	0 %	25 %	25 %	426400547
138	NC_019566	ATTT	2	8	38501	38508	25 %	75 %	0 %	0 %	426400547
139	NC_019566	AATT	2	8	38548	38555	50 %	50 %	0 %	0 %	426400547
140	NC_019566	CAAA	2	8	38574	38581	75 %	0 %	0 %	25 %	426400547
141	NC_019566	GTGA	2	8	38582	38589	25 %	25 %	50 %	0 %	426400547
142	NC_019566	GGCA	2	8	38725	38732	25 %	0 %	50 %	25 %	426400547
143	NC_019566	AGTA	2	8	38756	38763	50 %	25 %	25 %	0 %	426400547
144	NC_019566	TAAT	3	12	39005	39016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019566	TTAT	2	8	39050	39057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019566	GTGC	2	8	39428	39435	0 %	25 %	50 %	25 %	426400548
147	NC_019566	ATCC	2	8	39476	39483	25 %	25 %	0 %	50 %	426400548
148	NC_019566	ATGG	2	8	40036	40043	25 %	25 %	50 %	0 %	426400548
149	NC_019566	TATT	3	12	40143	40154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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