MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 plasmid p1HPAKL86

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019564	G	6	6	2	7	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019564	G	6	6	12	17	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019564	A	6	6	241	246	100 %	0 %	0 %	0 %	425791555
4	NC_019564	A	6	6	452	457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019564	A	6	6	476	481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019564	A	7	7	496	502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019564	A	8	8	851	858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019564	T	6	6	1229	1234	0 %	100 %	0 %	0 %	425791557
9	NC_019564	A	6	6	1426	1431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019564	T	6	6	1439	1444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019564	A	6	6	2030	2035	100 %	0 %	0 %	0 %	425791558
12	NC_019564	A	7	7	2419	2425	100 %	0 %	0 %	0 %	425791558
13	NC_019564	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	425791558
14	NC_019564	A	7	7	3566	3572	100 %	0 %	0 %	0 %	425791559
15	NC_019564	A	7	7	3704	3710	100 %	0 %	0 %	0 %	425791559
16	NC_019564	A	6	6	3834	3839	100 %	0 %	0 %	0 %	425791559
17	NC_019564	A	6	6	3871	3876	100 %	0 %	0 %	0 %	425791559
18	NC_019564	A	6	6	4739	4744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019564	A	6	6	4778	4783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019564	A	9	9	4806	4814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019564	A	6	6	4824	4829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019564	T	6	6	4929	4934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019564	T	6	6	4943	4948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019564	T	6	6	5060	5065	0 %	100 %	0 %	0 %	425791561
25	NC_019564	T	7	7	5417	5423	0 %	100 %	0 %	0 %	425791561
26	NC_019564	A	7	7	5443	5449	100 %	0 %	0 %	0 %	425791561
27	NC_019564	A	7	7	5890	5896	100 %	0 %	0 %	0 %	425791561
28	NC_019564	A	6	6	5910	5915	100 %	0 %	0 %	0 %	425791561
29	NC_019564	G	6	6	5957	5962	0 %	0 %	100 %	0 %	425791561
30	NC_019564	T	7	7	5972	5978	0 %	100 %	0 %	0 %	425791561
31	NC_019564	A	7	7	6421	6427	100 %	0 %	0 %	0 %	425791561
32	NC_019564	T	6	6	6440	6445	0 %	100 %	0 %	0 %	425791562
33	NC_019564	A	6	6	6522	6527	100 %	0 %	0 %	0 %	425791562
34	NC_019564	A	6	6	6565	6570	100 %	0 %	0 %	0 %	425791562
35	NC_019564	A	8	8	6731	6738	100 %	0 %	0 %	0 %	425791562
36	NC_019564	A	6	6	6744	6749	100 %	0 %	0 %	0 %	425791562
37	NC_019564	T	6	6	6788	6793	0 %	100 %	0 %	0 %	425791562
38	NC_019564	A	6	6	6854	6859	100 %	0 %	0 %	0 %	425791562
39	NC_019564	A	6	6	6922	6927	100 %	0 %	0 %	0 %	425791562
40	NC_019564	A	6	6	6939	6944	100 %	0 %	0 %	0 %	425791562
41	NC_019564	A	6	6	6984	6989	100 %	0 %	0 %	0 %	425791562
42	NC_019564	T	6	6	7047	7052	0 %	100 %	0 %	0 %	425791562
43	NC_019564	A	7	7	7337	7343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019564	A	6	6	7358	7363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019564	A	6	6	7559	7564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019564	T	7	7	7625	7631	0 %	100 %	0 %	0 %	425791563
47	NC_019564	A	6	6	7691	7696	100 %	0 %	0 %	0 %	425791563
48	NC_019564	A	6	6	7880	7885	100 %	0 %	0 %	0 %	425791563
49	NC_019564	A	6	6	7922	7927	100 %	0 %	0 %	0 %	425791563
50	NC_019564	T	6	6	8098	8103	0 %	100 %	0 %	0 %	425791563
51	NC_019564	T	7	7	8507	8513	0 %	100 %	0 %	0 %	425791563
52	NC_019564	T	7	7	8523	8529	0 %	100 %	0 %	0 %	425791563
53	NC_019564	T	6	6	8958	8963	0 %	100 %	0 %	0 %	425791563
54	NC_019564	A	6	6	9082	9087	100 %	0 %	0 %	0 %	425791563
55	NC_019564	T	6	6	9318	9323	0 %	100 %	0 %	0 %	425791563
56	NC_019564	A	6	6	11160	11165	100 %	0 %	0 %	0 %	425791565
57	NC_019564	T	7	7	12001	12007	0 %	100 %	0 %	0 %	425791566

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.