MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	AAAGCA	2	12	288	299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425790180
2	NC_019563	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	425790183
3	NC_019563	TTTCTT	2	12	11859	11870	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425790193
4	NC_019563	TAGTGA	2	12	12991	13002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790194
5	NC_019563	TATCCT	2	12	14873	14884	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	425790197
6	NC_019563	CAAATT	2	12	15171	15182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425790197
7	NC_019563	AAAGCC	2	12	16021	16032	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	425790197
8	NC_019563	CGGACT	2	12	19842	19853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	425790203
9	NC_019563	GAATTG	2	12	20805	20816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790204
10	NC_019563	ATCAAG	2	12	22657	22668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	425790205
11	NC_019563	ACCAAC	2	12	22728	22739	50 %	0 %	0 %	50 %	425790205
12	NC_019563	ATTTGC	2	12	29027	29038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425790209
13	NC_019563	TCATTA	2	12	29171	29182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425790209
14	NC_019563	AACTTG	2	12	34470	34481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019563	TGAAGC	2	12	41322	41333	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425790219
16	NC_019563	TGTTTA	2	12	41798	41809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019563	AAAGAC	2	12	42854	42865	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019563	CCATGC	2	12	44475	44486	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	425790221
19	NC_019563	ATTTCA	2	12	46026	46037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425790222
20	NC_019563	GTCAAA	2	12	56580	56591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	425790231
21	NC_019563	AAAAGA	2	12	57068	57079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425790231
22	NC_019563	TGATTT	2	12	57278	57289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425790231
23	NC_019563	GGGTTT	2	12	57461	57472	0 %	50 %	50 %	0 %	425790231
24	NC_019563	CCAAAA	2	12	59208	59219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019563	AAATCA	2	12	59808	59819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019563	AAAAGA	2	12	62360	62371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019563	TTCTTT	3	18	62621	62638	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425790232
28	NC_019563	TTTTCT	2	12	62647	62658	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425790232
29	NC_019563	TTTTCT	2	12	64518	64529	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425790234
30	NC_019563	TTTCTT	2	12	72143	72154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425790242
31	NC_019563	TTTTGG	2	12	78665	78676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790253
32	NC_019563	TTTTTA	2	12	80071	80082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019563	GTTTAG	2	12	81293	81304	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019563	GTGATG	2	12	82063	82074	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019563	TTTTAT	2	12	84502	84513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	425790258
36	NC_019563	GCATTG	2	12	84607	84618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425790258
37	NC_019563	TTGTCA	2	12	85009	85020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425790258
38	NC_019563	GAGCGA	2	12	85994	86005	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	425790259
39	NC_019563	TTTCTA	2	12	86643	86654	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425790260
40	NC_019563	TGATAA	2	12	88006	88017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	425790262
41	NC_019563	AAATCC	2	12	89223	89234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425790263
42	NC_019563	GTGGAA	2	12	101724	101735	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	425790275
43	NC_019563	GTTTTT	2	12	102413	102424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425790277
44	NC_019563	TCAAGC	2	12	102614	102625	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425790277
45	NC_019563	CTTATT	2	12	102871	102882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425790277
46	NC_019563	GAAAAT	2	12	104751	104762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425790280
47	NC_019563	ATTTTG	2	12	107803	107814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425790281
48	NC_019563	TAAGAC	2	12	107983	107994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	425790282
49	NC_019563	TTGCAA	2	12	119663	119674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425790293
50	NC_019563	ATGCAA	2	12	124830	124841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	425790299
51	NC_019563	GTTAGC	2	12	136580	136591	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425790312
52	NC_019563	AAATCC	2	12	136980	136991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425790313
53	NC_019563	GGGCTT	2	12	138113	138124	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	425790314
54	NC_019563	TTGACT	2	12	139398	139409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425790315
55	NC_019563	GTGTGA	2	12	139514	139525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019563	GGTTAT	2	12	142772	142783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425790318
57	NC_019563	TAAAAA	2	12	143483	143494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	425790319
58	NC_019563	GTGTTG	2	12	146517	146528	0 %	50 %	50 %	0 %	425790324
59	NC_019563	TGACGC	2	12	149374	149385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	425790327
60	NC_019563	ATCACC	2	12	151119	151130	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	425790330
61	NC_019563	TTTATC	2	12	152044	152055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425790331
62	NC_019563	TCATTC	2	12	152220	152231	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	425790331
63	NC_019563	CAAACC	2	12	153007	153018	50 %	0 %	0 %	50 %	425790331
64	NC_019563	CTTTTT	2	12	155592	155603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425790334
65	NC_019563	TTGTTT	2	12	155627	155638	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425790334
66	NC_019563	CTTTAT	2	12	156732	156743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425790335
67	NC_019563	CTAAAA	2	12	159622	159633	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425790336
68	NC_019563	TTGCAC	2	12	162180	162191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	425790340
69	NC_019563	AAAATA	2	12	170916	170927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019563	GATTTG	2	12	172907	172918	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425790349
71	NC_019563	GTAAAG	2	12	176684	176695	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	425790356
72	NC_019563	CAAAAC	2	12	181622	181633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790368
73	NC_019563	ATCACT	2	12	183820	183831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790373
74	NC_019563	GCTTTT	2	12	184901	184912	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	425790375
75	NC_019563	GCAAGA	2	12	187047	187058	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	425790377
76	NC_019563	CAAGGC	2	12	187248	187259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790377
77	NC_019563	TTGCGA	2	12	188273	188284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425790378
78	NC_019563	AAGAAT	2	12	190348	190359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425790381
79	NC_019563	TATAGC	2	12	192476	192487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425790382
80	NC_019563	ATCAAT	2	12	194825	194836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425790384
81	NC_019563	TCAATT	2	12	196649	196660	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425790385
82	NC_019563	ATGGGT	2	12	197263	197274	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	425790386
83	NC_019563	GCTCCC	2	12	199280	199291	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425790392
84	NC_019563	GCCTGT	2	12	200541	200552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790394
85	NC_019563	CCTTTT	2	12	204989	205000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790397
86	NC_019563	TACTCT	2	12	205672	205683	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	425790398
87	NC_019563	ATGCGA	2	12	205741	205752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425790398
88	NC_019563	TAGACT	2	12	206065	206076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019563	GACGCT	2	12	213541	213552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	425790404
90	NC_019563	CAGCCC	2	12	216989	217000	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	425790406
91	NC_019563	AAACTT	2	12	217783	217794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019563	GTGGGC	2	12	219792	219803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	425790409
93	NC_019563	CAATAT	2	12	219857	219868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425790409
94	NC_019563	CTCTTA	2	12	223125	223136	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	425790414
95	NC_019563	CTCAAA	2	12	227526	227537	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425790420
96	NC_019563	AAAGCG	2	12	229609	229620	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	425790422
97	NC_019563	GGCTAT	2	12	236198	236209	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425790427
98	NC_019563	ACATTT	2	12	237763	237774	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425790428
99	NC_019563	CAAGCT	2	12	246373	246384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425790436
100	NC_019563	GATTTG	2	12	247959	247970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425790439
101	NC_019563	ATATTT	2	12	251110	251121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790441
102	NC_019563	TATATG	2	12	252657	252668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425790441
103	NC_019563	GAAAAA	2	12	253679	253690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425790441
104	NC_019563	AAGAAA	2	12	258685	258696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425790444
105	NC_019563	GATCAC	2	12	258701	258712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425790444
106	NC_019563	AGTGGA	2	12	260339	260350	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	425790444
107	NC_019563	CAAAGA	2	12	261203	261214	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425790445
108	NC_019563	ATAAAA	2	12	261220	261231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	425790445
109	NC_019563	ATACAA	2	12	262634	262645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_019563	GTTTTG	2	12	262755	262766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790447
111	NC_019563	GATTTT	2	12	263027	263038	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425790447
112	NC_019563	ATTTAA	2	12	263268	263279	50 %	50 %	0 %	0 %	425790447
113	NC_019563	GAAAAA	2	12	264159	264170	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425790448
114	NC_019563	AAATCC	2	12	265331	265342	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425790449
115	NC_019563	ATTTTT	2	12	267303	267314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019563	AAAATG	2	12	276591	276602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425790455
117	NC_019563	AGATAA	2	12	277274	277285	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019563	AAAAGA	2	12	277460	277471	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019563	AGAAAA	2	12	278334	278345	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425790458
120	NC_019563	GATGTG	2	12	279559	279570	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019563	CCAACA	2	12	281517	281528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019563	TTTTGT	2	12	281849	281860	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425790460
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219	NC_019563	ATCGCC	2	12	495343	495354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	425790644
220	NC_019563	CTAACG	2	12	495474	495485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425790644
221	NC_019563	TCAAAA	2	12	509100	509111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
222	NC_019563	CGCTAA	2	12	510270	510281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425790656
223	NC_019563	TTGATG	2	12	512489	512500	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425790658
224	NC_019563	TGGCGA	2	12	513468	513479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425790659
225	NC_019563	TTGAGC	2	12	513797	513808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425790659
226	NC_019563	AGTTTG	2	12	513818	513829	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425790659
227	NC_019563	GTTAGC	2	12	516520	516531	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425790662
228	NC_019563	GCTCAA	2	12	517213	517224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425790662
229	NC_019563	GTAGTT	2	12	517546	517557	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425790662
230	NC_019563	TTAGCG	2	12	519176	519187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425790662
231	NC_019563	TAAAAA	2	12	520265	520276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_019563	ATATTG	2	12	520799	520810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425790663
233	NC_019563	TACCAA	2	12	521985	521996	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425790664
234	NC_019563	ATTTAG	2	12	522082	522093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425790664
235	NC_019563	TGGAAA	2	12	525009	525020	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	425790667
236	NC_019563	GATTTT	2	12	525889	525900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425790667
237	NC_019563	TGAGCG	2	12	529150	529161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425790670
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240	NC_019563	AAATAC	2	12	536373	536384	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425790680
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343	NC_019563	TTGCGC	2	12	753082	753093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
344	NC_019563	GAGCCA	2	12	758205	758216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790890
345	NC_019563	ATTAAA	2	12	759286	759297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_019563	ATCAAG	2	12	759933	759944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	425790891
347	NC_019563	ATAAAG	2	12	762860	762871	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425790892
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350	NC_019563	GTTTGG	2	12	773470	773481	0 %	50 %	50 %	0 %	425790902
351	NC_019563	TCAATA	2	12	774454	774465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425790902
352	NC_019563	GAGCGG	2	12	774524	774535	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	425790902
353	NC_019563	GATTTT	2	12	777850	777861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425790905
354	NC_019563	TTAGCC	2	12	787677	787688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	425790914
355	NC_019563	TTGTAG	2	12	790766	790777	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425790917
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368	NC_019563	TTTGGA	2	12	805410	805421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
369	NC_019563	CTTGCG	2	12	806645	806656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790930
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378	NC_019563	TGGGCA	2	12	819831	819842	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425790943
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447	NC_019563	TTAGCG	2	12	934281	934292	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425791047
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458	NC_019563	CATCGC	2	12	953927	953938	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	425791063
459	NC_019563	GCTACC	2	12	954222	954233	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	425791063
460	NC_019563	CATATA	2	12	957487	957498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425791065
461	NC_019563	TTCCTT	2	12	957936	957947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791065
462	NC_019563	TTTGGG	2	12	962207	962218	0 %	50 %	50 %	0 %	425791068
463	NC_019563	TCTCAC	2	12	963429	963440	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	425791069
464	NC_019563	TAGAGC	2	12	963470	963481	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425791069
465	NC_019563	ATTTTC	2	12	965620	965631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425791070
466	NC_019563	TTTAGA	2	12	967671	967682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425791071
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496	NC_019563	TTGGCG	2	12	1015750	1015761	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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499	NC_019563	ATCAAA	2	12	1017949	1017960	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425791119
500	NC_019563	TATCGC	2	12	1022738	1022749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	425791123

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