MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	AACTTG	2	12	34470	34481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019563	TGTTTA	2	12	41798	41809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019563	AAAGAC	2	12	42854	42865	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019563	CCAAAA	2	12	59208	59219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019563	AAATCA	2	12	59808	59819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019563	AAAAGA	2	12	62360	62371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019563	TTTTTA	2	12	80071	80082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019563	GTTTAG	2	12	81293	81304	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019563	GTGATG	2	12	82063	82074	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019563	GTGTGA	2	12	139514	139525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019563	AAAATA	2	12	170916	170927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019563	TAGACT	2	12	206065	206076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019563	AAACTT	2	12	217783	217794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019563	ATACAA	2	12	262634	262645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019563	ATTTTT	2	12	267303	267314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019563	AGATAA	2	12	277274	277285	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019563	AAAAGA	2	12	277460	277471	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019563	GATGTG	2	12	279559	279570	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019563	CCAACA	2	12	281517	281528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019563	TACAAA	2	12	309755	309766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019563	TATAAT	2	12	315406	315417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019563	ATTAAA	2	12	327351	327362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019563	ATTTTA	2	12	393195	393206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019563	AAAATC	2	12	403346	403357	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019563	TCTTTA	2	12	463995	464006	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019563	TCAAAA	2	12	509100	509111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019563	TAAAAA	2	12	520265	520276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019563	TAAAAA	2	12	679129	679140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019563	TGCGCT	2	12	688393	688404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019563	GCTCTT	2	12	688511	688522	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019563	GGCTTG	2	12	688584	688595	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019563	TCATTT	2	12	751427	751438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019563	TTGCGC	2	12	753082	753093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019563	ATTAAA	2	12	759286	759297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019563	TTTGGA	2	12	805410	805421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019563	AAAAAG	2	12	862506	862517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019563	CTAAAG	2	12	891354	891365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019563	TAAAAA	2	12	894172	894183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019563	ATTGAA	2	12	968017	968028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019563	ATTTCA	2	12	987632	987643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019563	TTTTCT	2	12	987809	987820	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019563	TAAAAT	2	12	990841	990852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019563	GCTGAA	2	12	999901	999912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019563	TTGGCG	2	12	1015750	1015761	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019563	CGGCTT	2	12	1029795	1029806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019563	TTGTAA	2	12	1065192	1065203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019563	AGGTAT	2	12	1072480	1072491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019563	AACTTG	2	12	1076885	1076896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019563	ATGCAA	2	12	1116728	1116739	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019563	AATTCA	2	12	1118158	1118169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019563	AAAAGC	2	12	1122065	1122076	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019563	ATTTTT	2	12	1137931	1137942	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019563	GTCTTT	2	12	1170795	1170806	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019563	CATTTT	2	12	1170931	1170942	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019563	TTTAAC	2	12	1202058	1202069	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019563	AATTAA	2	12	1228882	1228893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019563	TTAAAT	2	12	1282573	1282584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019563	TAAAAA	2	12	1303052	1303063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019563	TTATAA	2	12	1304182	1304193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019563	TTATAA	2	12	1305515	1305526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019563	TTTTAA	2	12	1367597	1367608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019563	GTTTTA	2	12	1374146	1374157	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019563	TAATTT	2	12	1397993	1398004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019563	ATTTTT	2	12	1401806	1401817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019563	TGGCTT	2	12	1424244	1424255	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019563	ATTTCA	2	12	1441101	1441112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019563	CAAAGA	2	12	1441606	1441617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.