MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 1198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	425790182
2	NC_019563	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	425790183
3	NC_019563	TTTTA	2	10	2427	2436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019563	ATTAA	2	10	2923	2932	60 %	40 %	0 %	0 %	425790184
5	NC_019563	GAAAC	2	10	4642	4651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019563	TTACT	2	10	6679	6688	20 %	60 %	0 %	20 %	425790187
7	NC_019563	TTTTC	2	10	6877	6886	0 %	80 %	0 %	20 %	425790187
8	NC_019563	GGCTT	2	10	8191	8200	0 %	40 %	40 %	20 %	425790188
9	NC_019563	AGGTT	2	10	9785	9794	20 %	40 %	40 %	0 %	425790189
10	NC_019563	CCCCA	2	10	13963	13972	20 %	0 %	0 %	80 %	425790195
11	NC_019563	TTCTT	2	10	14030	14039	0 %	80 %	0 %	20 %	425790195
12	NC_019563	CCCCA	2	10	15213	15222	20 %	0 %	0 %	80 %	425790197
13	NC_019563	TTATC	2	10	16670	16679	20 %	60 %	0 %	20 %	425790197
14	NC_019563	AAATA	2	10	17375	17384	80 %	20 %	0 %	0 %	425790199
15	NC_019563	GAATT	2	10	18659	18668	40 %	40 %	20 %	0 %	425790202
16	NC_019563	AATCA	2	10	19134	19143	60 %	20 %	0 %	20 %	425790203
17	NC_019563	GCTTG	2	10	19590	19599	0 %	40 %	40 %	20 %	425790203
18	NC_019563	GATAA	2	10	22749	22758	60 %	20 %	20 %	0 %	425790205
19	NC_019563	CAATC	2	10	22953	22962	40 %	20 %	0 %	40 %	425790205
20	NC_019563	ATGAA	2	10	24141	24150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019563	AAAGA	2	10	30880	30889	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019563	TATCT	2	10	31155	31164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019563	TTCAA	2	10	32273	32282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019563	CTCAT	2	10	32503	32512	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_019563	TCACT	2	10	33981	33990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019563	TACTT	2	10	34280	34289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019563	AATAA	2	10	34831	34840	80 %	20 %	0 %	0 %	425790212
28	NC_019563	AATAA	2	10	34848	34857	80 %	20 %	0 %	0 %	425790212
29	NC_019563	TATCG	2	10	37427	37436	20 %	40 %	20 %	20 %	425790214
30	NC_019563	TTGTA	2	10	38252	38261	20 %	60 %	20 %	0 %	425790215
31	NC_019563	TTTGG	2	10	38471	38480	0 %	60 %	40 %	0 %	425790215
32	NC_019563	TTGGG	2	10	39021	39030	0 %	40 %	60 %	0 %	425790216
33	NC_019563	TCTTT	2	10	39592	39601	0 %	80 %	0 %	20 %	425790218
34	NC_019563	AAAGT	2	10	43007	43016	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019563	AATTT	2	10	43208	43217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019563	CATTC	2	10	48281	48290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019563	CAAAA	2	10	48380	48389	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019563	CAAGC	2	10	49893	49902	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019563	AAAAG	2	10	50811	50820	80 %	0 %	20 %	0 %	425790227
40	NC_019563	ATTTT	2	10	51498	51507	20 %	80 %	0 %	0 %	425790228
41	NC_019563	TTATC	2	10	51766	51775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019563	TCATT	2	10	52262	52271	20 %	60 %	0 %	20 %	425790229
43	NC_019563	GGGGA	2	10	54385	54394	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019563	TCAAA	2	10	57802	57811	60 %	20 %	0 %	20 %	425790231
45	NC_019563	CGATC	2	10	61986	61995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019563	CAATA	2	10	62253	62262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019563	CAAAA	2	10	62607	62616	80 %	0 %	0 %	20 %	425790232
48	NC_019563	TCTTT	2	10	62617	62626	0 %	80 %	0 %	20 %	425790232
49	NC_019563	AAAAT	2	10	62812	62821	80 %	20 %	0 %	0 %	425790232
50	NC_019563	ATCTT	2	10	65593	65602	20 %	60 %	0 %	20 %	425790235
51	NC_019563	TTTGA	2	10	66171	66180	20 %	60 %	20 %	0 %	425790235
52	NC_019563	CAAAT	2	10	68597	68606	60 %	20 %	0 %	20 %	425790238
53	NC_019563	GTTTT	2	10	69241	69250	0 %	80 %	20 %	0 %	425790238
54	NC_019563	GCCTT	2	10	70612	70621	0 %	40 %	20 %	40 %	425790240
55	NC_019563	TGATT	2	10	72400	72409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019563	ATTGC	2	10	73603	73612	20 %	40 %	20 %	20 %	425790244
57	NC_019563	TCTTG	2	10	74036	74045	0 %	60 %	20 %	20 %	425790245
58	NC_019563	CAAAA	2	10	74454	74463	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019563	CAATT	2	10	75955	75964	40 %	40 %	0 %	20 %	425790251
60	NC_019563	TTGAT	2	10	76644	76653	20 %	60 %	20 %	0 %	425790252
61	NC_019563	AAAAT	2	10	77217	77226	80 %	20 %	0 %	0 %	425790252
62	NC_019563	CCCAC	2	10	78992	79001	20 %	0 %	0 %	80 %	425790253
63	NC_019563	GCGTT	2	10	79348	79357	0 %	40 %	40 %	20 %	425790254
64	NC_019563	ATCTT	2	10	79628	79637	20 %	60 %	0 %	20 %	425790254
65	NC_019563	ATTCA	2	10	79669	79678	40 %	40 %	0 %	20 %	425790254
66	NC_019563	CTTTT	2	10	81490	81499	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019563	TCTAT	2	10	84268	84277	20 %	60 %	0 %	20 %	425790258
68	NC_019563	GCTCT	2	10	86024	86033	0 %	40 %	20 %	40 %	425790259
69	NC_019563	TTTGC	2	10	86822	86831	0 %	60 %	20 %	20 %	425790260
70	NC_019563	ACCCC	2	10	87035	87044	20 %	0 %	0 %	80 %	425790261
71	NC_019563	ATAAA	2	10	88709	88718	80 %	20 %	0 %	0 %	425790262
72	NC_019563	AAAAT	2	10	88783	88792	80 %	20 %	0 %	0 %	425790262
73	NC_019563	TAAAA	2	10	90055	90064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019563	GCTTG	2	10	94948	94957	0 %	40 %	40 %	20 %	425790269
75	NC_019563	TGGCG	2	10	98433	98442	0 %	20 %	60 %	20 %	425790272
76	NC_019563	TAGGG	2	10	98958	98967	20 %	20 %	60 %	0 %	425790272
77	NC_019563	TTGTT	2	10	99004	99013	0 %	80 %	20 %	0 %	425790273
78	NC_019563	ACAAG	2	10	99038	99047	60 %	0 %	20 %	20 %	425790273
79	NC_019563	TTTTA	2	10	99699	99708	20 %	80 %	0 %	0 %	425790273
80	NC_019563	TTATT	2	10	101878	101887	20 %	80 %	0 %	0 %	425790276
81	NC_019563	ATCTC	2	10	107254	107263	20 %	40 %	0 %	40 %	425790281
82	NC_019563	AAACC	2	10	108118	108127	60 %	0 %	0 %	40 %	425790282
83	NC_019563	CATTA	2	10	108473	108482	40 %	40 %	0 %	20 %	425790282
84	NC_019563	AAATC	2	10	112467	112476	60 %	20 %	0 %	20 %	425790288
85	NC_019563	ATTTT	2	10	112772	112781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019563	TTTAG	2	10	112975	112984	20 %	60 %	20 %	0 %	425790289
87	NC_019563	TTTCA	2	10	115296	115305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019563	TTTCA	2	10	115937	115946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019563	ATTTT	2	10	119510	119519	20 %	80 %	0 %	0 %	425790293
90	NC_019563	TATCA	2	10	119573	119582	40 %	40 %	0 %	20 %	425790293
91	NC_019563	TTTTA	2	10	119740	119749	20 %	80 %	0 %	0 %	425790293
92	NC_019563	ATTCA	2	10	120966	120975	40 %	40 %	0 %	20 %	425790294
93	NC_019563	TTTTA	2	10	121061	121070	20 %	80 %	0 %	0 %	425790295
94	NC_019563	CATGG	2	10	123108	123117	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019563	AATTT	2	10	123271	123280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019563	CAAAG	2	10	124510	124519	60 %	0 %	20 %	20 %	425790299
97	NC_019563	ATTTT	2	10	125107	125116	20 %	80 %	0 %	0 %	425790299
98	NC_019563	GATTT	2	10	126361	126370	20 %	60 %	20 %	0 %	425790299
99	NC_019563	TTTTA	2	10	129871	129880	20 %	80 %	0 %	0 %	425790304
100	NC_019563	GGCGT	2	10	129893	129902	0 %	20 %	60 %	20 %	425790304
101	NC_019563	AGGGC	2	10	131420	131429	20 %	0 %	60 %	20 %	425790306
102	NC_019563	ATTGA	2	10	132084	132093	40 %	40 %	20 %	0 %	425790306
103	NC_019563	TTTTA	2	10	132390	132399	20 %	80 %	0 %	0 %	425790307
104	NC_019563	GCGCT	2	10	132842	132851	0 %	20 %	40 %	40 %	425790307
105	NC_019563	TAAAA	2	10	133207	133216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019563	TGATT	2	10	136471	136480	20 %	60 %	20 %	0 %	425790312
107	NC_019563	AAAAG	2	10	137716	137725	80 %	0 %	20 %	0 %	425790314
108	NC_019563	TGGGG	2	10	137791	137800	0 %	20 %	80 %	0 %	425790314
109	NC_019563	TCAAA	2	10	138535	138544	60 %	20 %	0 %	20 %	425790315
110	NC_019563	CTTTT	2	10	139845	139854	0 %	80 %	0 %	20 %	425790316
111	NC_019563	CCTTG	2	10	142517	142526	0 %	40 %	20 %	40 %	425790318
112	NC_019563	GTTTT	2	10	144188	144197	0 %	80 %	20 %	0 %	425790321
113	NC_019563	ATTCA	2	10	148407	148416	40 %	40 %	0 %	20 %	425790326
114	NC_019563	AGCGT	2	10	148967	148976	20 %	20 %	40 %	20 %	425790327
115	NC_019563	TTTCA	2	10	153287	153296	20 %	60 %	0 %	20 %	425790332
116	NC_019563	GTGAT	2	10	154254	154263	20 %	40 %	40 %	0 %	425790333
117	NC_019563	AGCTT	2	10	154728	154737	20 %	40 %	20 %	20 %	425790333
118	NC_019563	TAGCC	2	10	156722	156731	20 %	20 %	20 %	40 %	425790335
119	NC_019563	TGAGC	2	10	160453	160462	20 %	20 %	40 %	20 %	425790338
120	NC_019563	TCCCA	2	10	161593	161602	20 %	20 %	0 %	60 %	425790339
121	NC_019563	TTAAA	2	10	162009	162018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019563	TTTAG	2	10	164328	164337	20 %	60 %	20 %	0 %	425790340
123	NC_019563	GATCT	2	10	164958	164967	20 %	40 %	20 %	20 %	425790340
124	NC_019563	AATGA	2	10	164997	165006	60 %	20 %	20 %	0 %	425790340
125	NC_019563	ACGCA	2	10	167262	167271	40 %	0 %	20 %	40 %	425790343
126	NC_019563	TGAAT	2	10	168254	168263	40 %	40 %	20 %	0 %	425790343
127	NC_019563	ATTTT	2	10	168689	168698	20 %	80 %	0 %	0 %	425790344
128	NC_019563	TTGCA	2	10	169216	169225	20 %	40 %	20 %	20 %	425790344
129	NC_019563	AGAAA	2	10	169385	169394	80 %	0 %	20 %	0 %	425790344
130	NC_019563	AAAAT	2	10	169816	169825	80 %	20 %	0 %	0 %	425790345
131	NC_019563	AATAA	2	10	169953	169962	80 %	20 %	0 %	0 %	425790345
132	NC_019563	AAGGC	2	10	171346	171355	40 %	0 %	40 %	20 %	425790347
133	NC_019563	TTAAT	2	10	171568	171577	40 %	60 %	0 %	0 %	425790347
134	NC_019563	TTTTC	2	10	171853	171862	0 %	80 %	0 %	20 %	425790347
135	NC_019563	TTTTA	2	10	172251	172260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019563	AATAT	2	10	173252	173261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019563	GTTAA	2	10	176933	176942	40 %	40 %	20 %	0 %	425790357
138	NC_019563	GCAAG	2	10	177092	177101	40 %	0 %	40 %	20 %	425790358
139	NC_019563	GTTTG	2	10	177927	177936	0 %	60 %	40 %	0 %	425790361
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186	NC_019563	GCGGT	2	10	247123	247132	0 %	20 %	60 %	20 %	425790438
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259	NC_019563	GAGCT	2	10	343917	343926	20 %	20 %	40 %	20 %	425790514
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267	NC_019563	GGCAT	2	10	350217	350226	20 %	20 %	40 %	20 %	425790519
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399	NC_019563	TTATT	2	10	514938	514947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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