MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	TTTTA	2	10	2427	2436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019563	GAAAC	2	10	4642	4651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019563	ATGAA	2	10	24141	24150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019563	AAAGA	2	10	30880	30889	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019563	TATCT	2	10	31155	31164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019563	TTCAA	2	10	32273	32282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019563	CTCAT	2	10	32503	32512	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019563	TCACT	2	10	33981	33990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019563	TACTT	2	10	34280	34289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019563	AAAGT	2	10	43007	43016	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019563	AATTT	2	10	43208	43217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019563	CATTC	2	10	48281	48290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019563	CAAAA	2	10	48380	48389	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019563	CAAGC	2	10	49893	49902	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019563	TTATC	2	10	51766	51775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019563	GGGGA	2	10	54385	54394	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019563	CGATC	2	10	61986	61995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019563	CAATA	2	10	62253	62262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019563	TGATT	2	10	72400	72409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019563	CAAAA	2	10	74454	74463	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019563	CTTTT	2	10	81490	81499	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019563	TAAAA	2	10	90055	90064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019563	ATTTT	2	10	112772	112781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019563	TTTCA	2	10	115296	115305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019563	TTTCA	2	10	115937	115946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019563	CATGG	2	10	123108	123117	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019563	AATTT	2	10	123271	123280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019563	TAAAA	2	10	133207	133216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019563	TTAAA	2	10	162009	162018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019563	TTTTA	2	10	172251	172260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019563	AATAT	2	10	173252	173261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019563	GAAAG	2	10	179990	179999	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019563	AATAA	2	10	193084	193093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019563	TCGTG	2	10	203215	203224	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019563	TTTTA	2	10	204250	204259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019563	GAAAG	2	10	209206	209215	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019563	TGAAT	2	10	209667	209676	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019563	CAATA	2	10	210035	210044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019563	ATGAG	2	10	222841	222850	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019563	TTTAA	2	10	245640	245649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019563	GTCTA	2	10	247731	247740	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019563	GGATT	2	10	248274	248283	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019563	TTTGA	2	10	266041	266050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019563	TTGTT	2	10	267641	267650	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019563	AAACA	2	10	268683	268692	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019563	AACGA	2	10	276540	276549	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019563	TTAAA	2	10	276552	276561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019563	AAGAT	2	10	279587	279596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019563	AAAAG	3	15	279944	279958	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019563	TATCC	2	10	280260	280269	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_019563	TCATA	2	10	280816	280825	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019563	TATCT	2	10	289764	289773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019563	TTTTA	2	10	293822	293831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019563	TTACA	2	10	295707	295716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019563	TAAGA	2	10	307658	307667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019563	TAAAA	2	10	307729	307738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019563	GGCTT	2	10	312126	312135	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019563	AAATC	2	10	348840	348849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019563	AACGA	2	10	378412	378421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019563	ACTCT	2	10	388332	388341	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_019563	TAAGG	2	10	403054	403063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019563	CGCTT	2	10	403166	403175	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019563	AAAAT	2	10	410169	410178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019563	ATTTG	2	10	410746	410755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019563	CAACA	2	10	411688	411697	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019563	TAAAA	2	10	411721	411730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019563	AAATT	2	10	446079	446088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019563	TTAAA	2	10	451906	451915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019563	ATTTT	2	10	459866	459875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019563	TTTTA	2	10	463779	463788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019563	TTTAA	2	10	474595	474604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019563	ATTCA	2	10	479007	479016	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019563	TTAAG	2	10	486313	486322	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019563	ATTTT	2	10	488768	488777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019563	CTTTA	2	10	502852	502861	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019563	GATTT	2	10	508587	508596	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019563	GAAAT	2	10	512192	512201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019563	TTATT	2	10	514938	514947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019563	CTTAT	2	10	520387	520396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019563	AAATA	2	10	534241	534250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019563	GTTTT	2	10	539885	539894	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019563	GGAAA	2	10	581338	581347	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019563	TTTAA	2	10	596951	596960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019563	AAATA	2	10	597035	597044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019563	TAATT	2	10	597118	597127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019563	TTAAT	2	10	604502	604511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019563	AATCA	2	10	640822	640831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019563	TAAAG	2	10	653453	653462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019563	ATTGG	2	10	665168	665177	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019563	GTTTT	2	10	673252	673261	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019563	AAAGC	2	10	678315	678324	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_019563	TAACA	2	10	685912	685921	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019563	TTCTT	2	10	689047	689056	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019563	AAAAT	2	10	690564	690573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019563	ACTTG	2	10	706351	706360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_019563	TTATA	2	10	710458	710467	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019563	TATAA	2	10	730930	730939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019563	AAAAC	2	10	746258	746267	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019563	AAAGA	2	10	752232	752241	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019563	TATAG	2	10	757802	757811	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019563	AAATC	2	10	759306	759315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019563	ATACA	2	10	778152	778161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019563	AAAAT	2	10	791563	791572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019563	ATAAA	2	10	795555	795564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019563	TGAGA	2	10	795590	795599	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019563	AAAAT	2	10	798656	798665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019563	AGGCT	2	10	800059	800068	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019563	TAAAA	2	10	805523	805532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019563	TTAAA	2	10	817032	817041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019563	ATTTT	2	10	820886	820895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019563	TTGTA	2	10	821061	821070	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019563	AAAAC	2	10	832242	832251	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019563	TAAAA	2	10	841118	841127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019563	AGTTT	2	10	847963	847972	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019563	CAACG	2	10	855428	855437	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_019563	ATATA	2	10	862297	862306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019563	TATTT	2	10	873527	873536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019563	TAAAA	2	10	874740	874749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019563	TGCAA	2	10	890448	890457	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019563	GCTTT	2	10	890903	890912	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019563	TCTAT	2	10	891387	891396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019563	CAAAA	2	10	891692	891701	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019563	AGCAA	2	10	892824	892833	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019563	AAATC	2	10	893241	893250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019563	AAAAC	2	10	893260	893269	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019563	AAATC	2	10	904778	904787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_019563	CTTAT	2	10	906201	906210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019563	TATCG	2	10	909991	910000	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019563	TAAAT	2	10	910697	910706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019563	TTAAA	2	10	917276	917285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019563	TTTTA	2	10	923944	923953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019563	CAAAA	2	10	954838	954847	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019563	GATAA	2	10	958097	958106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019563	GAAAA	2	10	963414	963423	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019563	ATCTT	2	10	987020	987029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019563	TTTTC	2	10	987507	987516	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019563	ATGCG	2	10	988582	988591	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019563	CTTTC	2	10	988626	988635	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_019563	TCTTT	2	10	1042939	1042948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019563	TTTTA	2	10	1064386	1064395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019563	ACAAA	2	10	1069721	1069730	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019563	TTTAG	2	10	1073021	1073030	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019563	AAAGA	2	10	1073294	1073303	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019563	TATCT	2	10	1073569	1073578	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019563	TTCAA	2	10	1074688	1074697	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019563	CTCAT	2	10	1074918	1074927	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_019563	TCACT	2	10	1076396	1076405	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_019563	TACTT	2	10	1076695	1076704	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_019563	CAATT	2	10	1427152	1427161	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
194	NC_019563	GCAAC	2	10	1438515	1438524	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
195	NC_019563	TAAAA	2	10	1447891	1447900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_019563	TAATA	2	10	1454615	1454624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_019563	TATTT	2	10	1457335	1457344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_019563	GTATT	2	10	1458851	1458860	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
199	NC_019563	ATTAT	2	10	1474197	1474206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_019563	AGTGA	2	10	1494073	1494082	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.