MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 4235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	425790180
2	NC_019563	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	425790180
3	NC_019563	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	425790181
4	NC_019563	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	425790182
5	NC_019563	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	425790182
6	NC_019563	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	425790183
7	NC_019563	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	425790183
8	NC_019563	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	425790183
9	NC_019563	TCTT	2	8	2556	2563	0 %	75 %	0 %	25 %	425790184
10	NC_019563	CAAA	2	8	3099	3106	75 %	0 %	0 %	25 %	425790184
11	NC_019563	GAAA	2	8	3246	3253	75 %	0 %	25 %	0 %	425790185
12	NC_019563	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	425790185
13	NC_019563	CAAG	2	8	3822	3829	50 %	0 %	25 %	25 %	425790185
14	NC_019563	ATGC	2	8	4273	4280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019563	TAAA	2	8	4683	4690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019563	AATA	2	8	5996	6003	75 %	25 %	0 %	0 %	425790186
17	NC_019563	TCAT	2	8	6113	6120	25 %	50 %	0 %	25 %	425790186
18	NC_019563	GCTC	2	8	7510	7517	0 %	25 %	25 %	50 %	425790188
19	NC_019563	AAAG	2	8	7536	7543	75 %	0 %	25 %	0 %	425790188
20	NC_019563	AAAC	2	8	8128	8135	75 %	0 %	0 %	25 %	425790188
21	NC_019563	TGAT	2	8	8912	8919	25 %	50 %	25 %	0 %	425790189
22	NC_019563	CAAT	2	8	9021	9028	50 %	25 %	0 %	25 %	425790189
23	NC_019563	TCAA	2	8	9086	9093	50 %	25 %	0 %	25 %	425790189
24	NC_019563	TTTG	2	8	9501	9508	0 %	75 %	25 %	0 %	425790189
25	NC_019563	TGTT	2	8	9576	9583	0 %	75 %	25 %	0 %	425790189
26	NC_019563	AGAA	2	8	10447	10454	75 %	0 %	25 %	0 %	425790190
27	NC_019563	CAAA	2	8	10962	10969	75 %	0 %	0 %	25 %	425790191
28	NC_019563	GTTT	2	8	11007	11014	0 %	75 %	25 %	0 %	425790191
29	NC_019563	TCAC	2	8	11495	11502	25 %	25 %	0 %	50 %	425790191
30	NC_019563	TTTC	2	8	11592	11599	0 %	75 %	0 %	25 %	425790191
31	NC_019563	CAAC	2	8	11680	11687	50 %	0 %	0 %	50 %	425790192
32	NC_019563	TTTA	2	8	11744	11751	25 %	75 %	0 %	0 %	425790193
33	NC_019563	AAAG	2	8	12443	12450	75 %	0 %	25 %	0 %	425790193
34	NC_019563	TTCA	2	8	14180	14187	25 %	50 %	0 %	25 %	425790196
35	NC_019563	GATC	2	8	14384	14391	25 %	25 %	25 %	25 %	425790196
36	NC_019563	TTTC	2	8	14462	14469	0 %	75 %	0 %	25 %	425790197
37	NC_019563	AGCA	2	8	14518	14525	50 %	0 %	25 %	25 %	425790197
38	NC_019563	CATG	2	8	15536	15543	25 %	25 %	25 %	25 %	425790197
39	NC_019563	TTGA	2	8	16653	16660	25 %	50 %	25 %	0 %	425790197
40	NC_019563	GATA	2	8	16765	16772	50 %	25 %	25 %	0 %	425790198
41	NC_019563	GATG	2	8	16795	16802	25 %	25 %	50 %	0 %	425790198
42	NC_019563	GGGT	2	8	16921	16928	0 %	25 %	75 %	0 %	425790198
43	NC_019563	AAAC	2	8	17036	17043	75 %	0 %	0 %	25 %	425790199
44	NC_019563	TCGC	2	8	17061	17068	0 %	25 %	25 %	50 %	425790199
45	NC_019563	CAAT	2	8	17071	17078	50 %	25 %	0 %	25 %	425790199
46	NC_019563	ATCA	2	8	17114	17121	50 %	25 %	0 %	25 %	425790199
47	NC_019563	TAAA	2	8	17259	17266	75 %	25 %	0 %	0 %	425790199
48	NC_019563	AACC	2	8	17393	17400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019563	TGCT	2	8	17522	17529	0 %	50 %	25 %	25 %	425790200
50	NC_019563	CAAC	2	8	17918	17925	50 %	0 %	0 %	50 %	425790201
51	NC_019563	AACG	2	8	18370	18377	50 %	0 %	25 %	25 %	425790201
52	NC_019563	TAAA	2	8	18438	18445	75 %	25 %	0 %	0 %	425790201
53	NC_019563	TGTT	2	8	18725	18732	0 %	75 %	25 %	0 %	425790202
54	NC_019563	TTCA	2	8	18802	18809	25 %	50 %	0 %	25 %	425790202
55	NC_019563	TTCT	2	8	19506	19513	0 %	75 %	0 %	25 %	425790203
56	NC_019563	GAGC	2	8	19514	19521	25 %	0 %	50 %	25 %	425790203
57	NC_019563	TGTC	2	8	20494	20501	0 %	50 %	25 %	25 %	425790204
58	NC_019563	GATG	2	8	21512	21519	25 %	25 %	50 %	0 %	425790204
59	NC_019563	TTCT	2	8	23047	23054	0 %	75 %	0 %	25 %	425790205
60	NC_019563	AATC	2	8	23444	23451	50 %	25 %	0 %	25 %	425790205
61	NC_019563	AATG	2	8	23549	23556	50 %	25 %	25 %	0 %	425790205
62	NC_019563	AATC	2	8	23885	23892	50 %	25 %	0 %	25 %	425790205
63	NC_019563	AACC	2	8	23903	23910	50 %	0 %	0 %	50 %	425790205
64	NC_019563	ATGC	2	8	24208	24215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019563	GCAG	2	8	24878	24885	25 %	0 %	50 %	25 %	425790206
66	NC_019563	AAAC	2	8	25121	25128	75 %	0 %	0 %	25 %	425790206
67	NC_019563	AGTC	2	8	25435	25442	25 %	25 %	25 %	25 %	425790206
68	NC_019563	ATCT	2	8	26240	26247	25 %	50 %	0 %	25 %	425790206
69	NC_019563	CAAA	2	8	26731	26738	75 %	0 %	0 %	25 %	425790207
70	NC_019563	AGCG	2	8	27149	27156	25 %	0 %	50 %	25 %	425790207
71	NC_019563	ATTG	2	8	27193	27200	25 %	50 %	25 %	0 %	425790207
72	NC_019563	CTTG	2	8	27683	27690	0 %	50 %	25 %	25 %	425790208
73	NC_019563	AATG	2	8	28001	28008	50 %	25 %	25 %	0 %	425790208
74	NC_019563	TCTT	3	12	28406	28417	0 %	75 %	0 %	25 %	425790209
75	NC_019563	TCAT	2	8	28751	28758	25 %	50 %	0 %	25 %	425790209
76	NC_019563	CAAG	2	8	29229	29236	50 %	0 %	25 %	25 %	425790209
77	NC_019563	AGCC	2	8	29635	29642	25 %	0 %	25 %	50 %	425790210
78	NC_019563	CTTA	2	8	29749	29756	25 %	50 %	0 %	25 %	425790210
79	NC_019563	ATAA	2	8	30654	30661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019563	AATC	2	8	30713	30720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019563	AAAG	2	8	30795	30802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019563	GATT	2	8	30872	30879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019563	TTAA	2	8	31133	31140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019563	GGCT	2	8	31820	31827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019563	CCTG	2	8	31939	31946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019563	GGGA	2	8	32394	32401	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019563	AGCT	2	8	32692	32699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019563	CTTT	2	8	33049	33056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019563	GATT	2	8	33173	33180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019563	CACC	2	8	33185	33192	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_019563	GTTT	2	8	33345	33352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019563	TCGC	2	8	33922	33929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019563	GAAA	2	8	34609	34616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019563	TAAA	2	8	34673	34680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019563	TAAA	2	8	34684	34691	75 %	25 %	0 %	0 %	425790212
96	NC_019563	TGAA	2	8	34701	34708	50 %	25 %	25 %	0 %	425790212
97	NC_019563	TAAA	2	8	34718	34725	75 %	25 %	0 %	0 %	425790212
98	NC_019563	TAAA	2	8	34730	34737	75 %	25 %	0 %	0 %	425790212
99	NC_019563	TAAA	2	8	34745	34752	75 %	25 %	0 %	0 %	425790212
100	NC_019563	TAAA	2	8	34767	34774	75 %	25 %	0 %	0 %	425790212
101	NC_019563	TAAA	2	8	34800	34807	75 %	25 %	0 %	0 %	425790212
102	NC_019563	TAAA	2	8	34817	34824	75 %	25 %	0 %	0 %	425790212
103	NC_019563	TCAA	2	8	35005	35012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019563	ATTG	2	8	35599	35606	25 %	50 %	25 %	0 %	425790213
105	NC_019563	GATC	2	8	36211	36218	25 %	25 %	25 %	25 %	425790214
106	NC_019563	TCTT	2	8	36565	36572	0 %	75 %	0 %	25 %	425790214
107	NC_019563	AAAG	2	8	37308	37315	75 %	0 %	25 %	0 %	425790214
108	NC_019563	AAAG	2	8	37385	37392	75 %	0 %	25 %	0 %	425790214
109	NC_019563	TGAA	2	8	37833	37840	50 %	25 %	25 %	0 %	425790215
110	NC_019563	AAGA	2	8	37868	37875	75 %	0 %	25 %	0 %	425790215
111	NC_019563	AGAA	2	8	37944	37951	75 %	0 %	25 %	0 %	425790215
112	NC_019563	AATA	2	8	38408	38415	75 %	25 %	0 %	0 %	425790215
113	NC_019563	AATA	2	8	38870	38877	75 %	25 %	0 %	0 %	425790216
114	NC_019563	CTTT	2	8	39305	39312	0 %	75 %	0 %	25 %	425790217
115	NC_019563	ATCC	2	8	39945	39952	25 %	25 %	0 %	50 %	425790218
116	NC_019563	CCAC	2	8	39997	40004	25 %	0 %	0 %	75 %	425790218
117	NC_019563	TTTA	2	8	40228	40235	25 %	75 %	0 %	0 %	425790218
118	NC_019563	CCTT	2	8	40932	40939	0 %	50 %	0 %	50 %	425790219
119	NC_019563	CATC	2	8	41025	41032	25 %	25 %	0 %	50 %	425790219
120	NC_019563	TTTC	2	8	41645	41652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019563	TTGA	2	8	41830	41837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019563	AGCG	2	8	41982	41989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019563	CTTT	2	8	42082	42089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019563	TTTA	2	8	42170	42177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019563	GATA	2	8	42457	42464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019563	AAAC	2	8	43033	43040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019563	TTTC	2	8	43228	43235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019563	CAAT	2	8	43305	43312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019563	GATC	2	8	43354	43361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019563	CAAA	2	8	43426	43433	75 %	0 %	0 %	25 %	425790220
131	NC_019563	GCTC	2	8	43618	43625	0 %	25 %	25 %	50 %	425790220
132	NC_019563	AGCG	2	8	44435	44442	25 %	0 %	50 %	25 %	425790221
133	NC_019563	TCGC	2	8	44886	44893	0 %	25 %	25 %	50 %	425790221
134	NC_019563	CAAA	2	8	44929	44936	75 %	0 %	0 %	25 %	425790221
135	NC_019563	TTCA	2	8	44990	44997	25 %	50 %	0 %	25 %	425790221
136	NC_019563	GATC	2	8	45016	45023	25 %	25 %	25 %	25 %	425790221
137	NC_019563	TTCA	2	8	45941	45948	25 %	50 %	0 %	25 %	425790222
138	NC_019563	TTTG	2	8	46163	46170	0 %	75 %	25 %	0 %	425790223
139	NC_019563	TGAA	2	8	46414	46421	50 %	25 %	25 %	0 %	425790223
140	NC_019563	TTCC	2	8	46648	46655	0 %	50 %	0 %	50 %	425790223
141	NC_019563	TTCA	2	8	46756	46763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019563	TTCA	2	8	46767	46774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019563	TTCA	2	8	46789	46796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019563	CAAA	2	8	46867	46874	75 %	0 %	0 %	25 %	425790224
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