MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 496

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	ATGC	2	8	4273	4280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019563	TAAA	2	8	4683	4690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019563	AACC	2	8	17393	17400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019563	ATGC	2	8	24208	24215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019563	ATAA	2	8	30654	30661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019563	AATC	2	8	30713	30720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019563	AAAG	2	8	30795	30802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019563	GATT	2	8	30872	30879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019563	TTAA	2	8	31133	31140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019563	GGCT	2	8	31820	31827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019563	CCTG	2	8	31939	31946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019563	GGGA	2	8	32394	32401	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019563	AGCT	2	8	32692	32699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019563	CTTT	2	8	33049	33056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019563	GATT	2	8	33173	33180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019563	CACC	2	8	33185	33192	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_019563	GTTT	2	8	33345	33352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019563	TCGC	2	8	33922	33929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019563	GAAA	2	8	34609	34616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019563	TAAA	2	8	34673	34680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019563	TCAA	2	8	35005	35012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019563	TTTC	2	8	41645	41652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019563	TTGA	2	8	41830	41837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019563	AGCG	2	8	41982	41989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019563	CTTT	2	8	42082	42089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019563	TTTA	2	8	42170	42177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019563	GATA	2	8	42457	42464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019563	AAAC	2	8	43033	43040	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019563	TTTC	2	8	43228	43235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019563	CAAT	2	8	43305	43312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019563	GATC	2	8	43354	43361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019563	TTCA	2	8	46756	46763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019563	TTCA	2	8	46767	46774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019563	TTCA	2	8	46789	46796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019563	CCAC	2	8	48340	48347	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_019563	TCTA	2	8	48352	48359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019563	TGAC	2	8	51819	51826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019563	AATC	2	8	53995	54002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019563	AGCA	2	8	54007	54014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019563	TTTA	2	8	54127	54134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019563	ATTT	2	8	54471	54478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019563	TTTA	2	8	58646	58653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019563	TGGA	2	8	58935	58942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019563	TTTC	2	8	59604	59611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019563	GTTT	2	8	59769	59776	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019563	ACCC	2	8	61523	61530	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_019563	AAAG	2	8	61780	61787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019563	CCCA	2	8	61913	61920	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_019563	AAAT	3	12	69653	69664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019563	GTTG	2	8	70215	70222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019563	ATTC	2	8	70314	70321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019563	CTTT	2	8	70368	70375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019563	TTGT	2	8	74169	74176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019563	ATAA	2	8	81659	81666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019563	ACTG	2	8	81856	81863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019563	TACC	2	8	82285	82292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019563	ACTC	2	8	83939	83946	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019563	TCTT	2	8	83964	83971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019563	TGTT	2	8	84018	84025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019563	TCAA	2	8	87795	87802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019563	TGAT	2	8	95096	95103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019563	TTTG	2	8	114896	114903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019563	ATCA	2	8	114942	114949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019563	TTTG	2	8	115498	115505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019563	CGAG	2	8	115572	115579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019563	AAAC	2	8	115973	115980	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019563	TTGC	2	8	123476	123483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019563	CTTG	2	8	123495	123502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019563	CATT	2	8	123574	123581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019563	CTCA	2	8	123590	123597	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019563	AAAG	2	8	133396	133403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019563	CGCT	2	8	133494	133501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019563	CTTT	2	8	140383	140390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019563	AATT	2	8	140448	140455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019563	TTTA	2	8	148726	148733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019563	CAAT	2	8	151379	151386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019563	AAGA	3	12	160820	160831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019563	TTGG	2	8	186184	186191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019563	TTTA	2	8	186382	186389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019563	ATTT	2	8	186466	186473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019563	ATTG	2	8	201947	201954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019563	TGAT	2	8	201967	201974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019563	TTTC	2	8	202030	202037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019563	AGTC	2	8	202730	202737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019563	AGGT	2	8	202803	202810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019563	GATG	2	8	202957	202964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019563	TCTT	2	8	203777	203784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019563	TTCT	2	8	203807	203814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019563	TTGT	2	8	203862	203869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019563	TTGA	2	8	203918	203925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019563	TTGA	2	8	204013	204020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019563	GCTT	2	8	204056	204063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019563	TTGT	2	8	204065	204072	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019563	TGTT	2	8	204083	204090	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019563	TTGA	2	8	204331	204338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019563	AGCG	2	8	204682	204689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019563	CTTT	2	8	204781	204788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019563	ACAA	2	8	206153	206160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019563	AGAT	2	8	208421	208428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019563	ACCA	2	8	209923	209930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019563	ATTG	2	8	210071	210078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019563	AAAG	2	8	210398	210405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019563	CTTT	2	8	210808	210815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019563	ATTT	2	8	217749	217756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019563	AAGA	2	8	218269	218276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019563	GATT	2	8	222880	222887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019563	TTGT	2	8	234491	234498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019563	CTTG	2	8	240092	240099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019563	AATC	2	8	240846	240853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019563	AGGG	2	8	245498	245505	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019563	GAAA	2	8	246916	246923	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019563	CTTT	2	8	248685	248692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019563	CTTT	2	8	261447	261454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019563	GTTT	2	8	265614	265621	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019563	TTTG	2	8	265665	265672	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019563	CTGG	2	8	266252	266259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019563	AGTG	2	8	266268	266275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019563	ATAA	2	8	266293	266300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019563	ATTT	2	8	266581	266588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019563	TAAA	2	8	266652	266659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019563	TTTG	2	8	267236	267243	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019563	ATTT	2	8	267288	267295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019563	ATCT	2	8	267435	267442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019563	AGAA	2	8	277253	277260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019563	ACTG	2	8	277307	277314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019563	CTAA	2	8	277329	277336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019563	AGAC	2	8	277571	277578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019563	CAAG	2	8	279402	279409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019563	ATTT	2	8	280131	280138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019563	GAGC	3	12	280395	280406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019563	GAAA	2	8	280666	280673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019563	AGAT	2	8	280971	280978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019563	ACAA	2	8	281139	281146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019563	CATT	2	8	281169	281176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019563	CAAA	2	8	290901	290908	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019563	TTAA	2	8	293584	293591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019563	TTTG	2	8	302320	302327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019563	TATT	2	8	302502	302509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019563	GGTG	2	8	309574	309581	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019563	TCCC	2	8	309644	309651	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_019563	AAAG	2	8	311982	311989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019563	TTTC	2	8	312249	312256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019563	TTTA	2	8	312539	312546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019563	AATG	2	8	314496	314503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019563	GATT	2	8	314534	314541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019563	TTTG	2	8	322203	322210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019563	ATTT	2	8	323082	323089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019563	AAAG	2	8	328702	328709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019563	CCTT	2	8	331778	331785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_019563	TTCA	2	8	336305	336312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019563	TTTA	2	8	336332	336339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019563	TGAT	2	8	337950	337957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019563	TAAA	2	8	348876	348883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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