MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 13415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790180
2	NC_019563	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790180
3	NC_019563	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790180
4	NC_019563	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790180
5	NC_019563	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790180
6	NC_019563	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790181
7	NC_019563	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790181
8	NC_019563	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790181
9	NC_019563	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790181
10	NC_019563	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790181
11	NC_019563	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790182
12	NC_019563	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790182
13	NC_019563	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425790182
14	NC_019563	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790182
15	NC_019563	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790182
16	NC_019563	GCT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790182
17	NC_019563	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790182
18	NC_019563	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425790182
19	NC_019563	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790182
20	NC_019563	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790183
21	NC_019563	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790183
22	NC_019563	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790183
23	NC_019563	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790183
24	NC_019563	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790183
25	NC_019563	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790183
26	NC_019563	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790183
27	NC_019563	AGC	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790184
28	NC_019563	GTG	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790184
29	NC_019563	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790184
30	NC_019563	GTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790184
31	NC_019563	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425790184
32	NC_019563	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790185
33	NC_019563	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790185
34	NC_019563	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425790185
35	NC_019563	ATA	2	6	5209	5214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790186
36	NC_019563	CTT	2	6	5223	5228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790186
37	NC_019563	TGC	2	6	5300	5305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790186
38	NC_019563	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790186
39	NC_019563	TCA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790186
40	NC_019563	CCA	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790186
41	NC_019563	CAC	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790187
42	NC_019563	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790187
43	NC_019563	AAG	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790187
44	NC_019563	GAT	2	6	7117	7122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790187
45	NC_019563	AGA	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790187
46	NC_019563	ATT	2	6	7257	7262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790187
47	NC_019563	TCA	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790188
48	NC_019563	CAC	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790188
49	NC_019563	AAC	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790188
50	NC_019563	CAA	2	6	7646	7651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790188
51	NC_019563	GTT	2	6	7658	7663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790188
52	NC_019563	ATT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790188
53	NC_019563	CTT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790188
54	NC_019563	TTG	2	6	7946	7951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790188
55	NC_019563	TCT	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790188
56	NC_019563	TAG	2	6	8080	8085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790188
57	NC_019563	TCT	2	6	8391	8396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790188
58	NC_019563	TCT	2	6	8499	8504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790188
59	NC_019563	AGA	2	6	8811	8816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790189
60	NC_019563	CAC	2	6	8860	8865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790189
61	NC_019563	ACC	2	6	8906	8911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790189
62	NC_019563	TCA	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790189
63	NC_019563	CTT	2	6	8982	8987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790189
64	NC_019563	TGT	2	6	8997	9002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790189
65	NC_019563	TGA	2	6	9171	9176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790189
66	NC_019563	TTG	2	6	9221	9226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790189
67	NC_019563	TTC	2	6	9481	9486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790189
68	NC_019563	AGG	2	6	9565	9570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	425790189
69	NC_019563	GGA	2	6	9596	9601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	425790189
70	NC_019563	TCT	2	6	9614	9619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790189
71	NC_019563	AGA	2	6	9622	9627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790189
72	NC_019563	GGC	2	6	9658	9663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425790189
73	NC_019563	GCT	2	6	9669	9674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790189
74	NC_019563	TGA	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790189
75	NC_019563	TTC	2	6	10115	10120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790190
76	NC_019563	TCT	3	9	10266	10274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790190
77	NC_019563	TCT	2	6	10287	10292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790190
78	NC_019563	TCT	2	6	10296	10301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790190
79	NC_019563	TGT	2	6	10312	10317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790190
80	NC_019563	AAT	2	6	10372	10377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790190
81	NC_019563	TCT	2	6	10386	10391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790190
82	NC_019563	TTA	2	6	10467	10472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790190
83	NC_019563	TGA	2	6	10516	10521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790190
84	NC_019563	TAA	2	6	10610	10615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790190
85	NC_019563	GGT	2	6	10747	10752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790190
86	NC_019563	CTT	2	6	10780	10785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790190
87	NC_019563	ATC	2	6	10793	10798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790190
88	NC_019563	CAA	2	6	10820	10825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790190
89	NC_019563	TCA	2	6	10974	10979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790191
90	NC_019563	ATC	2	6	11212	11217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790191
91	NC_019563	TCA	2	6	11421	11426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790191
92	NC_019563	TGG	2	6	11540	11545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790191
93	NC_019563	AAT	2	6	11704	11709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790192
94	NC_019563	AGA	3	9	11890	11898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790193
95	NC_019563	TGA	2	6	12030	12035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790193
96	NC_019563	CCA	3	9	12078	12086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790193
97	NC_019563	CAA	2	6	12166	12171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790193
98	NC_019563	CTC	2	6	12230	12235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425790193
99	NC_019563	CAC	2	6	12281	12286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790193
100	NC_019563	ATG	2	6	12311	12316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790193
101	NC_019563	TCA	2	6	12801	12806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790193
102	NC_019563	TAA	2	6	12854	12859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790194
103	NC_019563	CTT	2	6	13090	13095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790194
104	NC_019563	CAC	2	6	13154	13159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790194
105	NC_019563	CCA	2	6	13261	13266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790194
106	NC_019563	TTA	2	6	13275	13280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790194
107	NC_019563	TCT	3	9	13281	13289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790194
108	NC_019563	ATA	2	6	13310	13315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790194
109	NC_019563	CTT	2	6	13498	13503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790194
110	NC_019563	CAA	2	6	13589	13594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790194
111	NC_019563	TGA	2	6	13621	13626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790194
112	NC_019563	AAT	2	6	13654	13659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790194
113	NC_019563	TCT	2	6	13859	13864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790195
114	NC_019563	TCA	2	6	13893	13898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790195
115	NC_019563	CTT	2	6	13914	13919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790195
116	NC_019563	TCT	2	6	13922	13927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790195
117	NC_019563	TCA	2	6	13937	13942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790195
118	NC_019563	TCC	2	6	13993	13998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425790195
119	NC_019563	TAA	2	6	14071	14076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790195
120	NC_019563	GCC	2	6	14077	14082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425790195
121	NC_019563	CAC	2	6	14210	14215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790196
122	NC_019563	GCT	2	6	14238	14243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790196
123	NC_019563	CTT	2	6	14666	14671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
124	NC_019563	TCC	2	6	14752	14757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425790197
125	NC_019563	CAA	3	9	14979	14987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790197
126	NC_019563	AGC	2	6	15028	15033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790197
127	NC_019563	CTT	2	6	15134	15139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
128	NC_019563	GCT	2	6	15384	15389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790197
129	NC_019563	CTT	2	6	15428	15433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
130	NC_019563	CAT	2	6	15437	15442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790197
131	NC_019563	TAA	2	6	15501	15506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790197
132	NC_019563	TAA	2	6	15544	15549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790197
133	NC_019563	TCA	2	6	15583	15588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790197
134	NC_019563	TGG	2	6	15598	15603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790197
135	NC_019563	TTC	2	6	15606	15611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
136	NC_019563	TTC	2	6	15729	15734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
137	NC_019563	CGC	2	6	15795	15800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425790197
138	NC_019563	TCA	2	6	15850	15855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790197
139	NC_019563	ATG	2	6	15865	15870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790197
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141	NC_019563	CTT	2	6	16001	16006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
142	NC_019563	TCT	3	9	16126	16134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
143	NC_019563	CTT	2	6	16220	16225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
144	NC_019563	TTC	2	6	16359	16364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790197
145	NC_019563	TAA	2	6	16413	16418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790197
146	NC_019563	CAA	2	6	16473	16478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790197
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148	NC_019563	GTG	2	6	16585	16590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790197
149	NC_019563	TCT	2	6	16680	16685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790198
150	NC_019563	AAT	2	6	16689	16694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790198
151	NC_019563	TGC	2	6	16736	16741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790198
152	NC_019563	TCA	2	6	16890	16895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790198
153	NC_019563	TGG	2	6	16915	16920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790198
154	NC_019563	TGC	2	6	16945	16950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790198
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158	NC_019563	TCT	3	9	17208	17216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790199
159	NC_019563	CAT	2	6	17240	17245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790199
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161	NC_019563	CAT	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790200
162	NC_019563	TTA	2	6	17842	17847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790201
163	NC_019563	CAA	2	6	18040	18045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790201
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168	NC_019563	CAA	2	6	18403	18408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790201
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189	NC_019563	AAT	2	6	20520	20525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790204
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239	NC_019563	ACC	2	6	25622	25627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790206
240	NC_019563	GCT	2	6	25664	25669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790206
241	NC_019563	CAA	2	6	25684	25689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790206
242	NC_019563	GAT	2	6	25708	25713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790206
243	NC_019563	GCG	2	6	25731	25736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425790206
244	NC_019563	TAT	2	6	25808	25813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790206
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247	NC_019563	AAT	2	6	26039	26044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790206
248	NC_019563	CCA	2	6	26175	26180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790206
249	NC_019563	ATT	3	9	26190	26198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790206
250	NC_019563	TGT	2	6	26449	26454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790207
251	NC_019563	TCA	2	6	26544	26549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790207
252	NC_019563	CAT	2	6	26581	26586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790207
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254	NC_019563	CAT	2	6	26912	26917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790207
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259	NC_019563	TTG	2	6	27000	27005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790207
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