MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	AAACG	2	10	1696	1705	60 %	0 %	20 %	20 %	425790162
2	NC_019561	GTGCA	2	10	2905	2914	20 %	20 %	40 %	20 %	425790163
3	NC_019561	TTGAG	2	10	3776	3785	20 %	40 %	40 %	0 %	425790164
4	NC_019561	ATAAG	2	10	4385	4394	60 %	20 %	20 %	0 %	425790164
5	NC_019561	AGAAA	2	10	6383	6392	80 %	0 %	20 %	0 %	425790166
6	NC_019561	ATTTG	2	10	7000	7009	20 %	60 %	20 %	0 %	425790166
7	NC_019561	TTATC	2	10	8609	8618	20 %	60 %	0 %	20 %	425790167
8	NC_019561	AAAAT	2	10	10425	10434	80 %	20 %	0 %	0 %	425790168
9	NC_019561	TTTTA	2	10	11820	11829	20 %	80 %	0 %	0 %	425790169
10	NC_019561	TGTGT	2	10	11851	11860	0 %	60 %	40 %	0 %	425790169
11	NC_019561	CAAAT	2	10	12796	12805	60 %	20 %	0 %	20 %	425790169
12	NC_019561	ATTTT	2	10	13373	13382	20 %	80 %	0 %	0 %	425790169
13	NC_019561	TTTGA	2	10	13890	13899	20 %	60 %	20 %	0 %	425790170
14	NC_019561	GTGTT	2	10	14790	14799	0 %	60 %	40 %	0 %	425790170
15	NC_019561	CCTTG	2	10	14970	14979	0 %	40 %	20 %	40 %	425790170
16	NC_019561	GATTT	2	10	15710	15719	20 %	60 %	20 %	0 %	425790171
17	NC_019561	AAATT	2	10	18189	18198	60 %	40 %	0 %	0 %	425790175

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.