MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	ATAA	2	8	159	166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019561	GATA	2	8	661	668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019561	TTTA	2	8	1096	1103	25 %	75 %	0 %	0 %	425790161
4	NC_019561	CAAA	2	8	1116	1123	75 %	0 %	0 %	25 %	425790161
5	NC_019561	TTTG	2	8	1541	1548	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
6	NC_019561	TTGT	2	8	1586	1593	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
7	NC_019561	CCTG	2	8	1604	1611	0 %	25 %	25 %	50 %	425790162
8	NC_019561	GTTT	2	8	1957	1964	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
9	NC_019561	AATA	2	8	2142	2149	75 %	25 %	0 %	0 %	425790162
10	NC_019561	TATT	2	8	2170	2177	25 %	75 %	0 %	0 %	425790162
11	NC_019561	AAAT	2	8	2190	2197	75 %	25 %	0 %	0 %	425790162
12	NC_019561	TCAG	2	8	2702	2709	25 %	25 %	25 %	25 %	425790163
13	NC_019561	AATT	2	8	4149	4156	50 %	50 %	0 %	0 %	425790164
14	NC_019561	AATC	2	8	4668	4675	50 %	25 %	0 %	25 %	425790164
15	NC_019561	ACTG	2	8	5110	5117	25 %	25 %	25 %	25 %	425790165
16	NC_019561	CTAA	2	8	5313	5320	50 %	25 %	0 %	25 %	425790165
17	NC_019561	ATCA	2	8	5354	5361	50 %	25 %	0 %	25 %	425790165
18	NC_019561	TGAT	2	8	6864	6871	25 %	50 %	25 %	0 %	425790166
19	NC_019561	CTTC	2	8	6969	6976	0 %	50 %	0 %	50 %	425790166
20	NC_019561	GCAT	2	8	7093	7100	25 %	25 %	25 %	25 %	425790166
21	NC_019561	GTTT	2	8	8144	8151	0 %	75 %	25 %	0 %	425790167
22	NC_019561	GGTT	2	8	8495	8502	0 %	50 %	50 %	0 %	425790167
23	NC_019561	CCAC	2	8	8939	8946	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_019561	ATGT	2	8	9260	9267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019561	TGAG	2	8	9865	9872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019561	GTAG	2	8	10105	10112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019561	AAAC	2	8	10480	10487	75 %	0 %	0 %	25 %	425790168
28	NC_019561	CATC	2	8	10918	10925	25 %	25 %	0 %	50 %	425790168
29	NC_019561	ATCA	2	8	11220	11227	50 %	25 %	0 %	25 %	425790168
30	NC_019561	ACAA	2	8	11328	11335	75 %	0 %	0 %	25 %	425790168
31	NC_019561	GGAT	2	8	11786	11793	25 %	25 %	50 %	0 %	425790168
32	NC_019561	ATTG	2	8	11925	11932	25 %	50 %	25 %	0 %	425790169
33	NC_019561	AAAG	2	8	12394	12401	75 %	0 %	25 %	0 %	425790169
34	NC_019561	AATT	2	8	12632	12639	50 %	50 %	0 %	0 %	425790169
35	NC_019561	AATA	2	8	12736	12743	75 %	25 %	0 %	0 %	425790169
36	NC_019561	GTTG	2	8	13703	13710	0 %	50 %	50 %	0 %	425790170
37	NC_019561	CTTG	2	8	13814	13821	0 %	50 %	25 %	25 %	425790170
38	NC_019561	TTTC	2	8	13964	13971	0 %	75 %	0 %	25 %	425790170
39	NC_019561	TAAC	2	8	15603	15610	50 %	25 %	0 %	25 %	425790170
40	NC_019561	AAGA	2	8	16295	16302	75 %	0 %	25 %	0 %	425790172
41	NC_019561	ATTT	2	8	17901	17908	25 %	75 %	0 %	0 %	425790175
42	NC_019561	AGAA	2	8	17988	17995	75 %	0 %	25 %	0 %	425790175
43	NC_019561	ATCA	2	8	18011	18018	50 %	25 %	0 %	25 %	425790175
44	NC_019561	GATT	2	8	18712	18719	25 %	50 %	25 %	0 %	425790175

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.