MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	TTTA	2	8	1096	1103	25 %	75 %	0 %	0 %	425790161
2	NC_019561	CAAA	2	8	1116	1123	75 %	0 %	0 %	25 %	425790161
3	NC_019561	TTTG	2	8	1541	1548	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
4	NC_019561	TTGT	2	8	1586	1593	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
5	NC_019561	CCTG	2	8	1604	1611	0 %	25 %	25 %	50 %	425790162
6	NC_019561	GTTT	2	8	1957	1964	0 %	75 %	25 %	0 %	425790162
7	NC_019561	AATA	2	8	2142	2149	75 %	25 %	0 %	0 %	425790162
8	NC_019561	TATT	2	8	2170	2177	25 %	75 %	0 %	0 %	425790162
9	NC_019561	AAAT	2	8	2190	2197	75 %	25 %	0 %	0 %	425790162
10	NC_019561	TCAG	2	8	2702	2709	25 %	25 %	25 %	25 %	425790163
11	NC_019561	AATT	2	8	4149	4156	50 %	50 %	0 %	0 %	425790164
12	NC_019561	AATC	2	8	4668	4675	50 %	25 %	0 %	25 %	425790164
13	NC_019561	ACTG	2	8	5110	5117	25 %	25 %	25 %	25 %	425790165
14	NC_019561	CTAA	2	8	5313	5320	50 %	25 %	0 %	25 %	425790165
15	NC_019561	ATCA	2	8	5354	5361	50 %	25 %	0 %	25 %	425790165
16	NC_019561	TGAT	2	8	6864	6871	25 %	50 %	25 %	0 %	425790166
17	NC_019561	CTTC	2	8	6969	6976	0 %	50 %	0 %	50 %	425790166
18	NC_019561	GCAT	2	8	7093	7100	25 %	25 %	25 %	25 %	425790166
19	NC_019561	GTTT	2	8	8144	8151	0 %	75 %	25 %	0 %	425790167
20	NC_019561	GGTT	2	8	8495	8502	0 %	50 %	50 %	0 %	425790167
21	NC_019561	AAAC	2	8	10480	10487	75 %	0 %	0 %	25 %	425790168
22	NC_019561	CATC	2	8	10918	10925	25 %	25 %	0 %	50 %	425790168
23	NC_019561	ATCA	2	8	11220	11227	50 %	25 %	0 %	25 %	425790168
24	NC_019561	ACAA	2	8	11328	11335	75 %	0 %	0 %	25 %	425790168
25	NC_019561	GGAT	2	8	11786	11793	25 %	25 %	50 %	0 %	425790168
26	NC_019561	ATTG	2	8	11925	11932	25 %	50 %	25 %	0 %	425790169
27	NC_019561	AAAG	2	8	12394	12401	75 %	0 %	25 %	0 %	425790169
28	NC_019561	AATT	2	8	12632	12639	50 %	50 %	0 %	0 %	425790169
29	NC_019561	AATA	2	8	12736	12743	75 %	25 %	0 %	0 %	425790169
30	NC_019561	GTTG	2	8	13703	13710	0 %	50 %	50 %	0 %	425790170
31	NC_019561	CTTG	2	8	13814	13821	0 %	50 %	25 %	25 %	425790170
32	NC_019561	TTTC	2	8	13964	13971	0 %	75 %	0 %	25 %	425790170
33	NC_019561	TAAC	2	8	15603	15610	50 %	25 %	0 %	25 %	425790170
34	NC_019561	AAGA	2	8	16295	16302	75 %	0 %	25 %	0 %	425790172
35	NC_019561	ATTT	2	8	17901	17908	25 %	75 %	0 %	0 %	425790175
36	NC_019561	AGAA	2	8	17988	17995	75 %	0 %	25 %	0 %	425790175
37	NC_019561	ATCA	2	8	18011	18018	50 %	25 %	0 %	25 %	425790175
38	NC_019561	GATT	2	8	18712	18719	25 %	50 %	25 %	0 %	425790175

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.