MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	AAT	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019561	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019561	AAG	2	6	391	396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019561	AGT	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019561	ATG	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019561	AGT	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019561	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790161
8	NC_019561	TAA	2	6	954	959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
9	NC_019561	ATA	2	6	1013	1018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
10	NC_019561	AAT	2	6	1237	1242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
11	NC_019561	TTG	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790161
12	NC_019561	TGT	2	6	1260	1265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790161
13	NC_019561	TCT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790161
14	NC_019561	AAT	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790161
15	NC_019561	ATG	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790162
16	NC_019561	AAT	2	6	1575	1580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
17	NC_019561	TTG	2	6	1639	1644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790162
18	NC_019561	TGG	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790162
19	NC_019561	ATG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790162
20	NC_019561	TTG	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790162
21	NC_019561	AAC	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790162
22	NC_019561	GCT	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790162
23	NC_019561	AAT	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
24	NC_019561	TAA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790162
25	NC_019561	TCC	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425790163
26	NC_019561	TGA	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790163
27	NC_019561	ATC	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
28	NC_019561	GTT	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790163
29	NC_019561	GAT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790163
30	NC_019561	AAC	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790163
31	NC_019561	GCA	2	6	2857	2862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790163
32	NC_019561	TCA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
33	NC_019561	TGT	3	9	2952	2960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790163
34	NC_019561	CTG	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790163
35	NC_019561	ATT	2	6	3188	3193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790163
36	NC_019561	CAT	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790163
37	NC_019561	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790163
38	NC_019561	ATA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790163
39	NC_019561	CTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
40	NC_019561	AAC	2	6	3585	3590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790164
41	NC_019561	TTG	2	6	3741	3746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790164
42	NC_019561	CTT	2	6	3847	3852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
43	NC_019561	ACC	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790164
44	NC_019561	TTC	2	6	4047	4052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
45	NC_019561	AAT	2	6	4099	4104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790164
46	NC_019561	TCT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
47	NC_019561	AGC	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790164
48	NC_019561	TCT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
49	NC_019561	TTG	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790164
50	NC_019561	CTT	3	9	4514	4522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790164
51	NC_019561	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790164
52	NC_019561	CAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790165
53	NC_019561	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790165
54	NC_019561	TCT	2	6	4986	4991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
55	NC_019561	CTT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
56	NC_019561	AAG	2	6	5122	5127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790165
57	NC_019561	AAT	2	6	5146	5151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790165
58	NC_019561	TGT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
59	NC_019561	GTT	2	6	5375	5380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
60	NC_019561	AAT	2	6	5412	5417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790165
61	NC_019561	AAC	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790165
62	NC_019561	GTT	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
63	NC_019561	CAC	2	6	5443	5448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790165
64	NC_019561	TTG	2	6	5574	5579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790165
65	NC_019561	GAA	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790165
66	NC_019561	TTC	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790165
67	NC_019561	CAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019561	AAC	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019561	AAT	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019561	ATA	2	6	5753	5758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019561	TAA	2	6	5919	5924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019561	TAT	2	6	5949	5954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019561	ATG	2	6	5974	5979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019561	TTA	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019561	TAA	2	6	6169	6174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019561	TAT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019561	TGG	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019561	TTA	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019561	TGT	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
80	NC_019561	TTG	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
81	NC_019561	TTG	2	6	6706	6711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790166
82	NC_019561	AAT	2	6	6755	6760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790166
83	NC_019561	ATT	2	6	6773	6778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790166
84	NC_019561	AAT	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790166
85	NC_019561	ATC	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790166
86	NC_019561	CTT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019561	TTC	2	6	7156	7161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
88	NC_019561	AGT	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790167
89	NC_019561	TCT	2	6	7405	7410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
90	NC_019561	CTT	2	6	7657	7662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
91	NC_019561	GTT	2	6	7674	7679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
92	NC_019561	GTT	2	6	7763	7768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
93	NC_019561	AAG	2	6	8054	8059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790167
94	NC_019561	TTG	2	6	8080	8085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
95	NC_019561	AAC	2	6	8259	8264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790167
96	NC_019561	GTT	2	6	8430	8435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790167
97	NC_019561	TTC	2	6	8682	8687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790167
98	NC_019561	TAA	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790167
99	NC_019561	ATT	2	6	8768	8773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019561	ATA	3	9	8789	8797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019561	TTA	2	6	8839	8844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019561	ACT	2	6	8895	8900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019561	CCT	2	6	8924	8929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019561	TAT	2	6	9037	9042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019561	TTA	2	6	9083	9088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019561	AAG	2	6	9099	9104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019561	TTA	2	6	9105	9110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019561	AAG	2	6	9121	9126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019561	TTA	2	6	9127	9132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019561	AAG	2	6	9143	9148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019561	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019561	AAG	2	6	9165	9170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019561	TTA	2	6	9171	9176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019561	GTT	2	6	9227	9232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019561	GTT	2	6	9290	9295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019561	AAC	2	6	9312	9317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019561	ATG	2	6	9322	9327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019561	GAA	2	6	9391	9396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019561	TTG	2	6	9422	9427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019561	AAG	2	6	9831	9836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019561	TGG	2	6	9968	9973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019561	TGT	2	6	9999	10004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019561	TTA	2	6	10025	10030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019561	TAA	2	6	10046	10051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019561	ATT	2	6	10164	10169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019561	TTG	2	6	10202	10207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019561	GAA	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790168
128	NC_019561	CAA	2	6	10294	10299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790168
129	NC_019561	TAC	2	6	10451	10456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790168
130	NC_019561	AAT	2	6	10471	10476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790168
131	NC_019561	ATT	2	6	10595	10600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
132	NC_019561	AAT	2	6	10957	10962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790168
133	NC_019561	ATT	2	6	10978	10983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
134	NC_019561	TCT	2	6	11000	11005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790168
135	NC_019561	ATT	2	6	11044	11049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790168
136	NC_019561	AAC	2	6	11078	11083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790168
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.