MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	AAT	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019561	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019561	AAG	2	6	391	396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019561	AGT	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019561	ATG	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019561	AGT	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019561	CAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019561	AAC	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019561	AAT	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019561	ATA	2	6	5753	5758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019561	TAA	2	6	5919	5924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019561	TAT	2	6	5949	5954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019561	ATG	2	6	5974	5979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019561	TTA	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019561	TAA	2	6	6169	6174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019561	TAT	2	6	6204	6209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019561	TGG	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019561	TTA	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019561	CTT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019561	ATT	2	6	8768	8773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019561	ATA	3	9	8789	8797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019561	TTA	2	6	8839	8844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019561	ACT	2	6	8895	8900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019561	CCT	2	6	8924	8929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019561	TAT	2	6	9037	9042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019561	TTA	2	6	9083	9088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019561	AAG	2	6	9099	9104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019561	TTA	2	6	9105	9110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019561	AAG	2	6	9121	9126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019561	TTA	2	6	9127	9132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019561	AAG	2	6	9143	9148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019561	TTA	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019561	AAG	2	6	9165	9170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019561	TTA	2	6	9171	9176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019561	GTT	2	6	9227	9232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019561	GTT	2	6	9290	9295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019561	AAC	2	6	9312	9317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019561	ATG	2	6	9322	9327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019561	GAA	2	6	9391	9396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019561	TTG	2	6	9422	9427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019561	AAG	2	6	9831	9836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019561	TGG	2	6	9968	9973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019561	TGT	2	6	9999	10004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019561	TTA	2	6	10025	10030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019561	TAA	2	6	10046	10051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019561	ATT	2	6	10164	10169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019561	TTG	2	6	10202	10207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019561	ATT	2	6	16134	16139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019561	CTG	2	6	16708	16713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019561	GTA	2	6	17354	17359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.