MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 plasmid p1HPAKL117

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019561	A	6	6	142	147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019561	A	6	6	322	327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019561	A	6	6	601	606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019561	T	6	6	618	623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019561	T	7	7	1109	1115	0 %	100 %	0 %	0 %	425790161
6	NC_019561	A	7	7	1143	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	425790161
7	NC_019561	T	6	6	1415	1420	0 %	100 %	0 %	0 %	425790161
8	NC_019561	T	6	6	1474	1479	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
9	NC_019561	A	6	6	1849	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	425790162
10	NC_019561	T	7	7	1944	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
11	NC_019561	T	6	6	2095	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
12	NC_019561	T	6	6	2269	2274	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
13	NC_019561	T	6	6	2293	2298	0 %	100 %	0 %	0 %	425790162
14	NC_019561	A	6	6	2840	2845	100 %	0 %	0 %	0 %	425790163
15	NC_019561	T	6	6	2889	2894	0 %	100 %	0 %	0 %	425790163
16	NC_019561	T	6	6	3224	3229	0 %	100 %	0 %	0 %	425790163
17	NC_019561	A	6	6	3493	3498	100 %	0 %	0 %	0 %	425790164
18	NC_019561	A	7	7	3501	3507	100 %	0 %	0 %	0 %	425790164
19	NC_019561	T	6	6	3652	3657	0 %	100 %	0 %	0 %	425790164
20	NC_019561	T	6	6	3901	3906	0 %	100 %	0 %	0 %	425790164
21	NC_019561	T	6	6	4341	4346	0 %	100 %	0 %	0 %	425790164
22	NC_019561	T	6	6	4758	4763	0 %	100 %	0 %	0 %	425790165
23	NC_019561	A	6	6	5095	5100	100 %	0 %	0 %	0 %	425790165
24	NC_019561	T	7	7	5449	5455	0 %	100 %	0 %	0 %	425790165
25	NC_019561	T	7	7	5815	5821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019561	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019561	T	6	6	5896	5901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019561	A	6	6	5939	5944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019561	T	6	6	6038	6043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019561	A	6	6	6134	6139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019561	A	7	7	6358	6364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019561	T	6	6	6740	6745	0 %	100 %	0 %	0 %	425790166
33	NC_019561	T	6	6	6777	6782	0 %	100 %	0 %	0 %	425790166
34	NC_019561	T	7	7	6906	6912	0 %	100 %	0 %	0 %	425790166
35	NC_019561	T	7	7	7044	7050	0 %	100 %	0 %	0 %	425790166
36	NC_019561	T	6	6	7127	7132	0 %	100 %	0 %	0 %	425790167
37	NC_019561	T	6	6	7422	7427	0 %	100 %	0 %	0 %	425790167
38	NC_019561	T	6	6	7500	7505	0 %	100 %	0 %	0 %	425790167
39	NC_019561	T	6	6	8633	8638	0 %	100 %	0 %	0 %	425790167
40	NC_019561	A	6	6	8777	8782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019561	A	6	6	9277	9282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019561	T	6	6	9361	9366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019561	A	6	6	9367	9372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019561	A	6	6	9395	9400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019561	T	7	7	9526	9532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019561	A	7	7	9577	9583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019561	A	6	6	9609	9614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019561	A	8	8	9640	9647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019561	T	6	6	9736	9741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019561	T	8	8	9767	9774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019561	A	8	8	10096	10103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019561	T	6	6	10182	10187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019561	A	6	6	10549	10554	100 %	0 %	0 %	0 %	425790168
54	NC_019561	A	8	8	10685	10692	100 %	0 %	0 %	0 %	425790168
55	NC_019561	T	6	6	10700	10705	0 %	100 %	0 %	0 %	425790168
56	NC_019561	A	6	6	10774	10779	100 %	0 %	0 %	0 %	425790168
57	NC_019561	T	7	7	10859	10865	0 %	100 %	0 %	0 %	425790168
58	NC_019561	A	6	6	11531	11536	100 %	0 %	0 %	0 %	425790168
59	NC_019561	A	6	6	11641	11646	100 %	0 %	0 %	0 %	425790168
60	NC_019561	T	7	7	12138	12144	0 %	100 %	0 %	0 %	425790169
61	NC_019561	T	7	7	12224	12230	0 %	100 %	0 %	0 %	425790169
62	NC_019561	A	7	7	12354	12360	100 %	0 %	0 %	0 %	425790169
63	NC_019561	A	7	7	12539	12545	100 %	0 %	0 %	0 %	425790169
64	NC_019561	T	6	6	12601	12606	0 %	100 %	0 %	0 %	425790169
65	NC_019561	T	6	6	12724	12729	0 %	100 %	0 %	0 %	425790169
66	NC_019561	A	6	6	12812	12817	100 %	0 %	0 %	0 %	425790169
67	NC_019561	T	6	6	13293	13298	0 %	100 %	0 %	0 %	425790169
68	NC_019561	A	6	6	13384	13389	100 %	0 %	0 %	0 %	425790169
69	NC_019561	T	7	7	15858	15864	0 %	100 %	0 %	0 %	425790171
70	NC_019561	T	7	7	15942	15948	0 %	100 %	0 %	0 %	425790171
71	NC_019561	T	6	6	16022	16027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019561	A	6	6	16274	16279	100 %	0 %	0 %	0 %	425790172
73	NC_019561	A	7	7	16307	16313	100 %	0 %	0 %	0 %	425790172
74	NC_019561	A	7	7	16408	16414	100 %	0 %	0 %	0 %	425790172
75	NC_019561	T	7	7	16759	16765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019561	A	7	7	16824	16830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019561	A	6	6	16864	16869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019561	A	9	9	16892	16900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019561	A	6	6	16910	16915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019561	T	6	6	17014	17019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019561	T	6	6	17028	17033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019561	T	6	6	17145	17150	0 %	100 %	0 %	0 %	425790174
83	NC_019561	T	7	7	17264	17270	0 %	100 %	0 %	0 %	425790174
84	NC_019561	T	7	7	17770	17776	0 %	100 %	0 %	0 %	425790175
85	NC_019561	A	7	7	17796	17802	100 %	0 %	0 %	0 %	425790175
86	NC_019561	A	7	7	18243	18249	100 %	0 %	0 %	0 %	425790175
87	NC_019561	A	6	6	18263	18268	100 %	0 %	0 %	0 %	425790175
88	NC_019561	G	6	6	18310	18315	0 %	0 %	100 %	0 %	425790175
89	NC_019561	T	7	7	18325	18331	0 %	100 %	0 %	0 %	425790175

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.