MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	AAACAC	2	12	18069	18080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019560	TTTCTT	2	12	22690	22701	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019560	AAAGAG	2	12	63525	63536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019560	GAAAAA	2	12	65523	65534	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019560	TAGCGA	2	12	97369	97380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019560	GTTTTA	2	12	132973	132984	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019560	TAAAAA	2	12	169297	169308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019560	GTTTTG	2	12	188889	188900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019560	ATTTTA	2	12	248527	248538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019560	AAAATA	2	12	423734	423745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019560	ACTCAA	2	12	439524	439535	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019560	CCTAAT	2	12	439647	439658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019560	CTTTTT	2	12	439839	439850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019560	TTGGTT	2	12	442576	442587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019560	TAAAAA	2	12	482007	482018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019560	TATTTT	2	12	505083	505094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019560	TTTAAT	2	12	516070	516081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019560	TTTAAA	2	12	542093	542104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019560	TTAAAG	2	12	546356	546367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019560	ATTTTA	2	12	574789	574800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019560	AAAATC	2	12	580028	580039	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019560	GCTTCT	2	12	632934	632945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019560	GAAAAT	2	12	668225	668236	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019560	AAGAAA	2	12	675429	675440	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019560	AATGAG	2	12	675465	675476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019560	AAAAAT	2	12	681300	681311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019560	ATTAAA	2	12	727050	727061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019560	ACCATA	2	12	759410	759421	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019560	TTGATA	2	12	760151	760162	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019560	CTCTTA	2	12	831955	831966	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019560	AAAACT	2	12	837358	837369	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019560	TCAAAT	2	12	862640	862651	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019560	ATTTTT	2	12	867263	867274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019560	ATTATA	2	12	912335	912346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019560	TAAAAT	2	12	912360	912371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019560	ATTGAA	2	12	919721	919732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019560	TATGGG	2	12	969680	969691	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019560	TCATCT	2	12	992960	992971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019560	GACTTA	4	24	1006995	1007018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019560	ACAAAA	2	12	1101096	1101107	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019560	TGAGAA	2	12	1128298	1128309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019560	TACTGC	2	12	1129918	1129929	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019560	ACGCTA	2	12	1136029	1136040	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019560	ACCCTA	2	12	1182940	1182951	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019560	TTGATA	2	12	1184082	1184093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019560	TTGTAT	2	12	1186829	1186840	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019560	ACTTAA	2	12	1203913	1203924	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019560	TCATTT	2	12	1226068	1226079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019560	AAACTT	2	12	1226091	1226102	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019560	ATTTTT	2	12	1257368	1257379	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019560	TAAAAA	2	12	1285391	1285402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019560	TAAAGA	2	12	1352479	1352490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019560	TTTTCT	2	12	1396605	1396616	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019560	AGCGGG	2	12	1397543	1397554	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019560	GTTTTA	2	12	1407730	1407741	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019560	CTAAGT	2	12	1418014	1418025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019560	TGTTTA	2	12	1426594	1426605	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019560	TTAATA	2	12	1503167	1503178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019560	AGCATG	2	12	1540221	1540232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019560	TTTTTA	2	12	1550196	1550207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019560	AAAGAA	2	12	1560987	1560998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019560	TAAAAC	2	12	1561036	1561047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019560	CTAAAA	2	12	1561178	1561189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019560	TAGGTT	2	12	1592339	1592350	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019560	AATGAT	2	12	1612056	1612067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.