MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	425788642
2	NC_019560	GCGATA	2	12	3726	3737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788644
3	NC_019560	GAAACC	2	12	7478	7489	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	425788646
4	NC_019560	AGAAAA	2	12	18419	18430	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788655
5	NC_019560	GATAAA	2	12	21969	21980	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425788658
6	NC_019560	TTTTAG	2	12	29057	29068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788663
7	NC_019560	GCGTGG	2	12	30885	30896	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	425788667
8	NC_019560	ATTCTA	2	12	30978	30989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788667
9	NC_019560	TTGAAT	2	12	32075	32086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788667
10	NC_019560	TAAGGA	2	12	32374	32385	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	425788667
11	NC_019560	TAGGGG	2	12	33877	33888	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	425788670
12	NC_019560	GTTGTG	2	12	35032	35043	0 %	50 %	50 %	0 %	425788671
13	NC_019560	CAAGCG	2	12	35372	35383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788671
14	NC_019560	AAAGAA	2	12	35389	35400	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788671
15	NC_019560	AAAGAA	2	12	36953	36964	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788674
16	NC_019560	CAAAAT	2	12	39296	39307	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425788676
17	NC_019560	CGCAAA	2	12	42983	42994	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	425788679
18	NC_019560	TCTTTG	2	12	48459	48470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	425788684
19	NC_019560	TGAAAT	2	12	48964	48975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	425788684
20	NC_019560	TAAAAA	2	12	53525	53536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	425788688
21	NC_019560	AGAAAA	2	12	58355	58366	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788691
22	NC_019560	AAAAGA	2	12	58610	58621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788691
23	NC_019560	AGAAAA	2	12	58634	58645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788691
24	NC_019560	GAAAAC	2	12	59506	59517	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425788692
25	NC_019560	GATAAA	2	12	60709	60720	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425788694
26	NC_019560	GATGTG	2	12	60952	60963	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	425788694
27	NC_019560	CCAACA	2	12	62915	62926	50 %	0 %	0 %	50 %	425788694
28	NC_019560	TTTTGT	2	12	63247	63258	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425788695
29	NC_019560	GGACAA	2	12	67066	67077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	425788699
30	NC_019560	TATTAA	2	12	67939	67950	50 %	50 %	0 %	0 %	425788700
31	NC_019560	TAAGGG	2	12	78190	78201	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	425788711
32	NC_019560	CGCCCA	2	12	78727	78738	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	425788711
33	NC_019560	GCGCAT	2	12	82307	82318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	425788714
34	NC_019560	AGAAAA	2	12	82504	82515	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788714
35	NC_019560	GGAATG	2	12	82595	82606	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	425788714
36	NC_019560	GGCATG	2	12	82619	82630	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788714
37	NC_019560	ACCCTA	2	12	83412	83423	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	425788714
38	NC_019560	GCAACG	2	12	83637	83648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788714
39	NC_019560	ATATTG	2	12	84383	84394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788715
40	NC_019560	AACAGG	2	12	92285	92296	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	425788721
41	NC_019560	GAAAAA	2	12	94854	94865	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788724
42	NC_019560	AAAGAT	4	24	95486	95509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425788724
43	NC_019560	ATTAGA	2	12	96596	96607	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	425788725
44	NC_019560	GATTTT	2	12	98353	98364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788727
45	NC_019560	AAACTC	2	12	98470	98481	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788727
46	NC_019560	TCAAAA	2	12	99963	99974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425788728
47	NC_019560	GCGGTG	2	12	100663	100674	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	425788729
48	NC_019560	CAATAT	2	12	103873	103884	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788730
49	NC_019560	AGCGTT	2	12	110462	110473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425788735
50	NC_019560	TTTTCT	2	12	116382	116393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425788742
51	NC_019560	CGCTCG	2	12	121402	121413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	425788747
52	NC_019560	TAGGCA	2	12	123939	123950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788748
53	NC_019560	TTCTAT	2	12	126283	126294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788750
54	NC_019560	TGAATT	2	12	128454	128465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788751
55	NC_019560	TTTCAA	2	12	128613	128624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788751
56	NC_019560	AGCAAA	2	12	131961	131972	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425788754
57	NC_019560	TCATGA	2	12	134743	134754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425788758
58	NC_019560	AAAAAT	2	12	141479	141490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	425788766
59	NC_019560	TTAAAA	2	12	141944	141955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788768
60	NC_019560	TAGCGA	2	12	143884	143895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788771
61	NC_019560	TTAGCG	2	12	146776	146787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425788773
62	NC_019560	TATCGC	2	12	146988	146999	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	425788773
63	NC_019560	TTCAAA	2	12	147306	147317	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788774
64	NC_019560	ATCGCT	2	12	148704	148715	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	425788774
65	NC_019560	CCTAAA	2	12	150927	150938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788776
66	NC_019560	TTCTAT	2	12	152095	152106	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788777
67	NC_019560	TTGTTT	2	12	155083	155094	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425788782
68	NC_019560	CTTGGG	2	12	155744	155755	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	425788784
69	NC_019560	GAATCT	2	12	157239	157250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	425788786
70	NC_019560	TTGGGT	2	12	160519	160530	0 %	50 %	50 %	0 %	425788789
71	NC_019560	GATTTT	2	12	161031	161042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788790
72	NC_019560	AATTGA	2	12	161290	161301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	425788790
73	NC_019560	CTTTCT	2	12	164502	164513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788794
74	NC_019560	CCGCTC	2	12	166210	166221	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425788797
75	NC_019560	GCTCTC	2	12	168639	168650	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	425788799
76	NC_019560	TTCTAA	2	12	170952	170963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788802
77	NC_019560	TCAATA	2	12	172630	172641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788804
78	NC_019560	ATCGTT	2	12	173052	173063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788804
79	NC_019560	AATTTC	2	12	173398	173409	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788805
80	NC_019560	TAAAAT	2	12	174922	174933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788806
81	NC_019560	TTCTTT	2	12	175332	175343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	425788806
82	NC_019560	ATTTTG	2	12	176727	176738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788809
83	NC_019560	CGCTTT	2	12	177205	177216	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	425788809
84	NC_019560	GTTTAA	2	12	177989	178000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788810
85	NC_019560	CCGCTC	2	12	180641	180652	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425788813
86	NC_019560	AAAGCA	2	12	181837	181848	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425788814
87	NC_019560	GAAAAA	2	12	184279	184290	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788816
88	NC_019560	AGGCAT	2	12	184368	184379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425788816
89	NC_019560	GCATTT	2	12	186081	186092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788818
90	NC_019560	TCAAAC	2	12	186648	186659	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788819
91	NC_019560	ATAAAG	2	12	186821	186832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	425788819
92	NC_019560	GGTATT	2	12	190611	190622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	425788821
93	NC_019560	TCTAAA	2	12	190841	190852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788821
94	NC_019560	TGGGCA	2	12	191910	191921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788822
95	NC_019560	TTCTAA	2	12	192389	192400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788823
96	NC_019560	ATTTTC	2	12	194334	194345	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788823
97	NC_019560	TGGGGC	2	12	201880	201891	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	425788833
98	NC_019560	AAATCC	2	12	203254	203265	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	425788835
99	NC_019560	GGAAAA	2	12	207352	207363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788840
100	NC_019560	ATTCTA	2	12	212767	212778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788846
101	NC_019560	CATAGC	2	12	214523	214534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425788847
102	NC_019560	GTTTTG	2	12	215028	215039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788847
103	NC_019560	TTATTT	2	12	216660	216671	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	425788848
104	NC_019560	TAATTA	2	12	219531	219542	50 %	50 %	0 %	0 %	425788851
105	NC_019560	TTTCAT	2	12	220629	220640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788852
106	NC_019560	GCTAAA	2	12	223038	223049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	425788855
107	NC_019560	AATGCC	2	12	227420	227431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425788859
108	NC_019560	GGATTG	2	12	229708	229719	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	425788860
109	NC_019560	GGTGAT	2	12	231659	231670	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	425788861
110	NC_019560	TCAATA	2	12	232081	232092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788862
111	NC_019560	CACGCC	2	12	232561	232572	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	425788862
112	NC_019560	ATAACT	2	12	232687	232698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788862
113	NC_019560	GCTTTG	2	12	233793	233804	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	425788863
114	NC_019560	GCTAGG	2	12	235169	235180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788864
115	NC_019560	TGGAGG	2	12	235717	235728	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	425788865
116	NC_019560	TCTTTA	2	12	241479	241490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425788871
117	NC_019560	GTTTTT	2	12	247067	247078	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	425788878
118	NC_019560	ATTGTC	2	12	250227	250238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788881
119	NC_019560	TCCCGC	2	12	252423	252434	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425788883
120	NC_019560	TCCCGC	2	12	253236	253247	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	425788883
121	NC_019560	CAAAGC	2	12	254714	254725	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	425788885
122	NC_019560	TTTAGC	2	12	256469	256480	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788887
123	NC_019560	AAAGAA	2	12	259577	259588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425788890
124	NC_019560	TGAGCG	2	12	261089	261100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788892
125	NC_019560	GATTTT	2	12	266191	266202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788895
126	NC_019560	TGAGCG	2	12	269452	269463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788898
127	NC_019560	AGCTTT	2	12	269600	269611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788898
128	NC_019560	GATTTT	2	12	274138	274149	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425788905
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130	NC_019560	CCGAAC	2	12	275807	275818	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	425788906
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132	NC_019560	AAATAC	2	12	276680	276691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425788908
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134	NC_019560	GCGTTA	2	12	278803	278814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425788910
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137	NC_019560	TATGGA	2	12	292525	292536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788920
138	NC_019560	ATTTGA	2	12	293412	293423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425788920
139	NC_019560	TCAATT	2	12	293544	293555	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788920
140	NC_019560	TAACAT	2	12	295837	295848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425788920
141	NC_019560	ATTTCA	2	12	301695	301706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425788924
142	NC_019560	GTAGCG	2	12	303025	303036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	425788925
143	NC_019560	TTATCG	2	12	305267	305278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	425788926
144	NC_019560	GTTTGT	2	12	305409	305420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788926
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147	NC_019560	GAGCGG	2	12	310565	310576	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	425788932
148	NC_019560	GCTATG	2	12	310941	310952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	425788932
149	NC_019560	TTGCGT	2	12	313288	313299	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	425788935
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225	NC_019560	TTATTG	2	12	472675	472686	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	425789087
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229	NC_019560	TTGGCT	2	12	485622	485633	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	425789101
230	NC_019560	CATTTT	2	12	486714	486725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425789102
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232	NC_019560	TATTAG	2	12	491357	491368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	425789106
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343	NC_019560	CTTCCA	2	12	683278	683289	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	425789278
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461	NC_019560	CAAATT	2	12	975048	975059	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	425789543
462	NC_019560	GCTGAA	2	12	978677	978688	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	425789545
463	NC_019560	CTGAAA	2	12	980139	980150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	425789546
464	NC_019560	CGCATG	2	12	981383	981394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	425789548
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