MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 1290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	425788641
2	NC_019560	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	425788642
3	NC_019560	TTTTA	2	10	2428	2437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019560	ATTAA	2	10	2924	2933	60 %	40 %	0 %	0 %	425788643
5	NC_019560	GAAAC	2	10	4642	4651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019560	TTTCT	2	10	8142	8151	0 %	80 %	0 %	20 %	425788646
7	NC_019560	AGGAG	2	10	10614	10623	40 %	0 %	60 %	0 %	425788648
8	NC_019560	TTGAA	2	10	11652	11661	40 %	40 %	20 %	0 %	425788649
9	NC_019560	TTTTG	2	10	11668	11677	0 %	80 %	20 %	0 %	425788649
10	NC_019560	TGGTG	2	10	12506	12515	0 %	40 %	60 %	0 %	425788650
11	NC_019560	GCTTT	2	10	13333	13342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019560	TCGAT	2	10	17468	17477	20 %	40 %	20 %	20 %	425788654
13	NC_019560	CAAAA	2	10	18384	18393	80 %	0 %	0 %	20 %	425788655
14	NC_019560	TGAAA	2	10	20728	20737	60 %	20 %	20 %	0 %	425788657
15	NC_019560	GGCAT	2	10	22625	22634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019560	CCATG	2	10	22930	22939	20 %	20 %	20 %	40 %	425788659
17	NC_019560	CTCTT	2	10	22960	22969	0 %	60 %	0 %	40 %	425788659
18	NC_019560	CCGTC	2	10	24061	24070	0 %	20 %	20 %	60 %	425788659
19	NC_019560	TAATA	2	10	25018	25027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019560	CAAGC	2	10	27653	27662	40 %	0 %	20 %	40 %	425788661
21	NC_019560	TTTTA	2	10	28583	28592	20 %	80 %	0 %	0 %	425788662
22	NC_019560	TAGCG	2	10	29245	29254	20 %	20 %	40 %	20 %	425788663
23	NC_019560	GATAA	2	10	30581	30590	60 %	20 %	20 %	0 %	425788666
24	NC_019560	GTGGG	2	10	32037	32046	0 %	20 %	80 %	0 %	425788667
25	NC_019560	TGGGG	2	10	33288	33297	0 %	20 %	80 %	0 %	425788669
26	NC_019560	AAGCC	2	10	39036	39045	40 %	0 %	20 %	40 %	425788676
27	NC_019560	AGAAA	2	10	40335	40344	80 %	0 %	20 %	0 %	425788677
28	NC_019560	TACTC	2	10	41188	41197	20 %	40 %	0 %	40 %	425788678
29	NC_019560	ATTTT	2	10	42181	42190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019560	TAAAA	2	10	42918	42927	80 %	20 %	0 %	0 %	425788679
31	NC_019560	TCCCA	2	10	43930	43939	20 %	20 %	0 %	60 %	425788680
32	NC_019560	GCTCC	2	10	44251	44260	0 %	20 %	20 %	60 %	425788680
33	NC_019560	AGGCT	2	10	46668	46677	20 %	20 %	40 %	20 %	425788682
34	NC_019560	TGCCT	2	10	47043	47052	0 %	40 %	20 %	40 %	425788682
35	NC_019560	GCTTT	2	10	49332	49341	0 %	60 %	20 %	20 %	425788684
36	NC_019560	TAAAA	2	10	50518	50527	80 %	20 %	0 %	0 %	425788685
37	NC_019560	ATTTC	2	10	50593	50602	20 %	60 %	0 %	20 %	425788685
38	NC_019560	TGAAA	2	10	52444	52453	60 %	20 %	20 %	0 %	425788688
39	NC_019560	CAGCA	2	10	53645	53654	40 %	0 %	20 %	40 %	425788689
40	NC_019560	TCGCC	2	10	55441	55450	0 %	20 %	20 %	60 %	425788689
41	NC_019560	TAAAA	2	10	55737	55746	80 %	20 %	0 %	0 %	425788689
42	NC_019560	TCAAA	2	10	56453	56462	60 %	20 %	0 %	20 %	425788689
43	NC_019560	TTAAA	2	10	57474	57483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019560	ATCGC	2	10	60446	60455	20 %	20 %	20 %	40 %	425788693
45	NC_019560	AGAGA	2	10	61144	61153	60 %	0 %	40 %	0 %	425788694
46	NC_019560	TATCC	2	10	61655	61664	20 %	40 %	0 %	40 %	425788694
47	NC_019560	TCTAC	2	10	64317	64326	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019560	AATAT	2	10	64458	64467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019560	ATTTG	2	10	64832	64841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019560	AAGAT	2	10	65068	65077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019560	CGATC	2	10	66721	66730	20 %	20 %	20 %	40 %	425788699
52	NC_019560	GGTGG	2	10	67612	67621	0 %	20 %	80 %	0 %	425788700
53	NC_019560	CTTCT	2	10	71640	71649	0 %	60 %	0 %	40 %	425788704
54	NC_019560	TCCAA	2	10	72129	72138	40 %	20 %	0 %	40 %	425788705
55	NC_019560	CAATG	2	10	72964	72973	40 %	20 %	20 %	20 %	425788706
56	NC_019560	TTTTA	2	10	75391	75400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019560	TTTTG	2	10	75422	75431	0 %	80 %	20 %	0 %	425788708
58	NC_019560	ACGCC	2	10	75728	75737	20 %	0 %	20 %	60 %	425788708
59	NC_019560	AAAGC	2	10	76494	76503	60 %	0 %	20 %	20 %	425788709
60	NC_019560	TTACA	2	10	77276	77285	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019560	ATCTT	2	10	85538	85547	20 %	60 %	0 %	20 %	425788715
62	NC_019560	TGGCT	2	10	86079	86088	0 %	40 %	40 %	20 %	425788715
63	NC_019560	ATGCC	2	10	86492	86501	20 %	20 %	20 %	40 %	425788716
64	NC_019560	TTGAT	2	10	87507	87516	20 %	60 %	20 %	0 %	425788718
65	NC_019560	GGCGT	2	10	89320	89329	0 %	20 %	60 %	20 %	425788720
66	NC_019560	TAAGA	2	10	92528	92537	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019560	TAAAA	2	10	92599	92608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019560	CTTTC	2	10	92882	92891	0 %	60 %	0 %	40 %	425788722
69	NC_019560	ATGGG	2	10	94826	94835	20 %	20 %	60 %	0 %	425788724
70	NC_019560	TTTGA	2	10	95940	95949	20 %	60 %	20 %	0 %	425788725
71	NC_019560	TCTTT	2	10	96151	96160	0 %	80 %	0 %	20 %	425788725
72	NC_019560	CGGCA	2	10	99929	99938	20 %	0 %	40 %	40 %	425788728
73	NC_019560	ACGAT	2	10	102411	102420	40 %	20 %	20 %	20 %	425788730
74	NC_019560	AATTG	2	10	104256	104265	40 %	40 %	20 %	0 %	425788731
75	NC_019560	TCGTT	2	10	106052	106061	0 %	60 %	20 %	20 %	425788732
76	NC_019560	ATCTT	2	10	106664	106673	20 %	60 %	0 %	20 %	425788733
77	NC_019560	CAAAA	2	10	108642	108651	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019560	TCTTT	2	10	109352	109361	0 %	80 %	0 %	20 %	425788735
79	NC_019560	AAAGC	2	10	112311	112320	60 %	0 %	20 %	20 %	425788737
80	NC_019560	ATTTT	2	10	113581	113590	20 %	80 %	0 %	0 %	425788739
81	NC_019560	TATTT	2	10	114236	114245	20 %	80 %	0 %	0 %	425788740
82	NC_019560	TGTCT	2	10	114509	114518	0 %	60 %	20 %	20 %	425788741
83	NC_019560	CAAAT	2	10	114902	114911	60 %	20 %	0 %	20 %	425788741
84	NC_019560	ACCCT	2	10	116331	116340	20 %	20 %	0 %	60 %	425788742
85	NC_019560	ATGCC	2	10	116463	116472	20 %	20 %	20 %	40 %	425788742
86	NC_019560	TTAAT	2	10	117840	117849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019560	TGATT	2	10	118458	118467	20 %	60 %	20 %	0 %	425788744
88	NC_019560	GGATC	2	10	122968	122977	20 %	20 %	40 %	20 %	425788748
89	NC_019560	AGCTC	2	10	122988	122997	20 %	20 %	20 %	40 %	425788748
90	NC_019560	AAGCC	2	10	124876	124885	40 %	0 %	20 %	40 %	425788749
91	NC_019560	GTTTG	2	10	126242	126251	0 %	60 %	40 %	0 %	425788750
92	NC_019560	TGATC	2	10	126871	126880	20 %	40 %	20 %	20 %	425788750
93	NC_019560	CGCTG	2	10	127792	127801	0 %	20 %	40 %	40 %	425788751
94	NC_019560	TTTGA	2	10	127939	127948	20 %	60 %	20 %	0 %	425788751
95	NC_019560	GACTT	2	10	128473	128482	20 %	40 %	20 %	20 %	425788751
96	NC_019560	ATCTC	2	10	129224	129233	20 %	40 %	0 %	40 %	425788751
97	NC_019560	CGCTT	2	10	129382	129391	0 %	40 %	20 %	40 %	425788751
98	NC_019560	TTTGT	2	10	129739	129748	0 %	80 %	20 %	0 %	425788752
99	NC_019560	GAAAA	2	10	131933	131942	80 %	0 %	20 %	0 %	425788754
100	NC_019560	GAAAA	2	10	132251	132260	80 %	0 %	20 %	0 %	425788754
101	NC_019560	ATTTT	2	10	135212	135221	20 %	80 %	0 %	0 %	425788760
102	NC_019560	ATGTT	2	10	135294	135303	20 %	60 %	20 %	0 %	425788760
103	NC_019560	AAAAG	2	10	135706	135715	80 %	0 %	20 %	0 %	425788760
104	NC_019560	CGCTG	2	10	137533	137542	0 %	20 %	40 %	40 %	425788762
105	NC_019560	AAATC	2	10	138162	138171	60 %	20 %	0 %	20 %	425788762
106	NC_019560	AAAAT	2	10	139634	139643	80 %	20 %	0 %	0 %	425788763
107	NC_019560	TGAGT	2	10	139695	139704	20 %	40 %	40 %	0 %	425788763
108	NC_019560	TTTTC	2	10	142248	142257	0 %	80 %	0 %	20 %	425788769
109	NC_019560	GTAAA	2	10	142800	142809	60 %	20 %	20 %	0 %	425788770
110	NC_019560	TCTTT	2	10	144698	144707	0 %	80 %	0 %	20 %	425788772
111	NC_019560	TTTTG	2	10	145861	145870	0 %	80 %	20 %	0 %	425788773
112	NC_019560	GCGAT	2	10	146654	146663	20 %	20 %	40 %	20 %	425788773
113	NC_019560	GCTTG	2	10	146910	146919	0 %	40 %	40 %	20 %	425788773
114	NC_019560	TTTTG	2	10	147570	147579	0 %	80 %	20 %	0 %	425788774
115	NC_019560	CCAAA	2	10	149410	149419	60 %	0 %	0 %	40 %	425788775
116	NC_019560	ACGCC	2	10	152940	152949	20 %	0 %	20 %	60 %	425788777
117	NC_019560	TTATT	2	10	154836	154845	20 %	80 %	0 %	0 %	425788781
118	NC_019560	CGTTT	2	10	155195	155204	0 %	60 %	20 %	20 %	425788783
119	NC_019560	GATTT	2	10	156168	156177	20 %	60 %	20 %	0 %	425788784
120	NC_019560	CAAAT	2	10	158065	158074	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019560	AAAAC	2	10	158789	158798	80 %	0 %	0 %	20 %	425788787
122	NC_019560	AAGCC	2	10	162025	162034	40 %	0 %	20 %	40 %	425788792
123	NC_019560	GGGTG	2	10	164426	164435	0 %	20 %	80 %	0 %	425788794
124	NC_019560	ATTCA	2	10	165518	165527	40 %	40 %	0 %	20 %	425788796
125	NC_019560	CACTT	2	10	165722	165731	20 %	40 %	0 %	40 %	425788796
126	NC_019560	AAAAC	2	10	167857	167866	80 %	0 %	0 %	20 %	425788798
127	NC_019560	ATCTT	2	10	168922	168931	20 %	60 %	0 %	20 %	425788799
128	NC_019560	GCACT	2	10	176787	176796	20 %	20 %	20 %	40 %	425788809
129	NC_019560	TATCA	2	10	177263	177272	40 %	40 %	0 %	20 %	425788809
130	NC_019560	ATTTG	2	10	178271	178280	20 %	60 %	20 %	0 %	425788810
131	NC_019560	AATTG	2	10	178427	178436	40 %	40 %	20 %	0 %	425788811
132	NC_019560	TTTCT	2	10	179090	179099	0 %	80 %	0 %	20 %	425788812
133	NC_019560	AAATG	2	10	179427	179436	60 %	20 %	20 %	0 %	425788812
134	NC_019560	TGTAA	2	10	180217	180226	40 %	40 %	20 %	0 %	425788813
135	NC_019560	AGCTT	2	10	181255	181264	20 %	40 %	20 %	20 %	425788814
136	NC_019560	ATAAA	2	10	181713	181722	80 %	20 %	0 %	0 %	425788814
137	NC_019560	TTTAA	2	10	182076	182085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019560	AAAAG	2	10	182877	182886	80 %	0 %	20 %	0 %	425788815
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168	NC_019560	TGGGG	2	10	224649	224658	0 %	20 %	80 %	0 %	425788857
169	NC_019560	GATTG	2	10	224768	224777	20 %	40 %	40 %	0 %	425788857
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197	NC_019560	TGCAT	2	10	261744	261753	20 %	40 %	20 %	20 %	425788892
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401	NC_019560	TATCC	2	10	503290	503299	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
402	NC_019560	TGGAT	2	10	504068	504077	20 %	40 %	40 %	0 %	425789116
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432	NC_019560	ATTTT	2	10	542035	542044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_019560	TACGC	2	10	542392	542401	20 %	20 %	20 %	40 %	425789152
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