MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 4534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	425788639
2	NC_019560	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	425788639
3	NC_019560	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	425788640
4	NC_019560	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	425788641
5	NC_019560	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	425788641
6	NC_019560	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	425788642
7	NC_019560	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	425788642
8	NC_019560	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	425788642
9	NC_019560	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	425788642
10	NC_019560	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	425788642
11	NC_019560	TCTT	2	8	2557	2564	0 %	75 %	0 %	25 %	425788643
12	NC_019560	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	425788643
13	NC_019560	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	425788644
14	NC_019560	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	425788644
15	NC_019560	CAAG	2	8	3823	3830	50 %	0 %	25 %	25 %	425788644
16	NC_019560	TAAA	2	8	4682	4689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019560	GCTT	2	8	5197	5204	0 %	50 %	25 %	25 %	425788645
18	NC_019560	ATTC	2	8	5224	5231	25 %	50 %	0 %	25 %	425788645
19	NC_019560	CATT	2	8	5268	5275	25 %	50 %	0 %	25 %	425788645
20	NC_019560	GTGC	2	8	5846	5853	0 %	25 %	50 %	25 %	425788645
21	NC_019560	ATCG	2	8	6814	6821	25 %	25 %	25 %	25 %	425788645
22	NC_019560	CGTT	2	8	6849	6856	0 %	50 %	25 %	25 %	425788645
23	NC_019560	CAAA	2	8	7302	7309	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019560	TTCA	2	8	7606	7613	25 %	50 %	0 %	25 %	425788646
25	NC_019560	TCTT	2	8	7900	7907	0 %	75 %	0 %	25 %	425788646
26	NC_019560	AAGC	2	8	8715	8722	50 %	0 %	25 %	25 %	425788646
27	NC_019560	TATT	2	8	9600	9607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019560	ATTC	2	8	9615	9622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019560	GATA	2	8	9704	9711	50 %	25 %	25 %	0 %	425788648
30	NC_019560	TCAA	2	8	9811	9818	50 %	25 %	0 %	25 %	425788648
31	NC_019560	GCTC	2	8	11254	11261	0 %	25 %	25 %	50 %	425788648
32	NC_019560	ATTG	2	8	11606	11613	25 %	50 %	25 %	0 %	425788649
33	NC_019560	GCAA	2	8	11797	11804	50 %	0 %	25 %	25 %	425788649
34	NC_019560	TGCT	2	8	12002	12009	0 %	50 %	25 %	25 %	425788649
35	NC_019560	GCCA	2	8	12242	12249	25 %	0 %	25 %	50 %	425788649
36	NC_019560	GGCC	2	8	12265	12272	0 %	0 %	50 %	50 %	425788649
37	NC_019560	TGCA	2	8	12483	12490	25 %	25 %	25 %	25 %	425788650
38	NC_019560	GAAA	2	8	12747	12754	75 %	0 %	25 %	0 %	425788650
39	NC_019560	TCTT	2	8	13283	13290	0 %	75 %	0 %	25 %	425788650
40	NC_019560	TTAA	2	8	13431	13438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019560	AGCG	2	8	13754	13761	25 %	0 %	50 %	25 %	425788652
42	NC_019560	GATT	2	8	13862	13869	25 %	50 %	25 %	0 %	425788652
43	NC_019560	CAAA	2	8	14031	14038	75 %	0 %	0 %	25 %	425788653
44	NC_019560	ATGC	2	8	14446	14453	25 %	25 %	25 %	25 %	425788653
45	NC_019560	GAGC	2	8	14751	14758	25 %	0 %	50 %	25 %	425788653
46	NC_019560	TTTA	2	8	15033	15040	25 %	75 %	0 %	0 %	425788653
47	NC_019560	CAGG	2	8	16191	16198	25 %	0 %	50 %	25 %	425788653
48	NC_019560	TGAT	2	8	16235	16242	25 %	50 %	25 %	0 %	425788653
49	NC_019560	AGTT	2	8	16363	16370	25 %	50 %	25 %	0 %	425788653
50	NC_019560	AGTT	2	8	16377	16384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019560	AACG	2	8	17059	17066	50 %	0 %	25 %	25 %	425788654
52	NC_019560	GCTT	2	8	17231	17238	0 %	50 %	25 %	25 %	425788654
53	NC_019560	ATCT	2	8	17788	17795	25 %	50 %	0 %	25 %	425788654
54	NC_019560	GTTT	2	8	18006	18013	0 %	75 %	25 %	0 %	425788654
55	NC_019560	TTGA	2	8	18348	18355	25 %	50 %	25 %	0 %	425788655
56	NC_019560	TGCT	2	8	18724	18731	0 %	50 %	25 %	25 %	425788655
57	NC_019560	AGCG	2	8	18896	18903	25 %	0 %	50 %	25 %	425788655
58	NC_019560	TAAA	2	8	20402	20409	75 %	25 %	0 %	0 %	425788657
59	NC_019560	GCGA	2	8	20411	20418	25 %	0 %	50 %	25 %	425788657
60	NC_019560	CTTT	2	8	21262	21269	0 %	75 %	0 %	25 %	425788658
61	NC_019560	AAGT	2	8	21574	21581	50 %	25 %	25 %	0 %	425788658
62	NC_019560	GCTT	2	8	21701	21708	0 %	50 %	25 %	25 %	425788658
63	NC_019560	CTTT	2	8	22333	22340	0 %	75 %	0 %	25 %	425788658
64	NC_019560	ATCA	2	8	22472	22479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019560	GTTG	2	8	22572	22579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019560	GTTT	2	8	23287	23294	0 %	75 %	25 %	0 %	425788659
67	NC_019560	ATTG	2	8	24227	24234	25 %	50 %	25 %	0 %	425788659
68	NC_019560	GATT	2	8	24952	24959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019560	TAAG	2	8	24990	24997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019560	TTTG	2	8	25365	25372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019560	TCGC	2	8	25388	25395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019560	ATAA	2	8	26206	26213	75 %	25 %	0 %	0 %	425788660
73	NC_019560	AAGG	2	8	27597	27604	50 %	0 %	50 %	0 %	425788661
74	NC_019560	GCTC	2	8	27731	27738	0 %	25 %	25 %	50 %	425788661
75	NC_019560	CCAC	2	8	28000	28007	25 %	0 %	0 %	75 %	425788661
76	NC_019560	GATG	2	8	28178	28185	25 %	25 %	50 %	0 %	425788661
77	NC_019560	GAAT	2	8	28440	28447	50 %	25 %	25 %	0 %	425788662
78	NC_019560	CTGT	2	8	28806	28813	0 %	50 %	25 %	25 %	425788662
79	NC_019560	TTGG	2	8	29333	29340	0 %	50 %	50 %	0 %	425788663
80	NC_019560	GGTT	2	8	29860	29867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019560	TTTA	2	8	29994	30001	25 %	75 %	0 %	0 %	425788665
82	NC_019560	TGAT	2	8	30139	30146	25 %	50 %	25 %	0 %	425788665
83	NC_019560	GCGA	2	8	30192	30199	25 %	0 %	50 %	25 %	425788665
84	NC_019560	ACCC	2	8	30332	30339	25 %	0 %	0 %	75 %	425788666
85	NC_019560	CATC	2	8	30458	30465	25 %	25 %	0 %	50 %	425788666
86	NC_019560	TCAA	2	8	30600	30607	50 %	25 %	0 %	25 %	425788667
87	NC_019560	TGCC	2	8	30822	30829	0 %	25 %	25 %	50 %	425788667
88	NC_019560	CATG	2	8	31717	31724	25 %	25 %	25 %	25 %	425788667
89	NC_019560	TTGC	2	8	32221	32228	0 %	50 %	25 %	25 %	425788667
90	NC_019560	GCTT	2	8	32732	32739	0 %	50 %	25 %	25 %	425788667
91	NC_019560	GAAA	2	8	32791	32798	75 %	0 %	25 %	0 %	425788667
92	NC_019560	GATC	2	8	32869	32876	25 %	25 %	25 %	25 %	425788668
93	NC_019560	ATGA	2	8	33072	33079	50 %	25 %	25 %	0 %	425788668
94	NC_019560	TTGT	2	8	34663	34670	0 %	75 %	25 %	0 %	425788671
95	NC_019560	CTTT	2	8	34810	34817	0 %	75 %	0 %	25 %	425788671
96	NC_019560	AATA	2	8	35487	35494	75 %	25 %	0 %	0 %	425788671
97	NC_019560	TAAA	2	8	35509	35516	75 %	25 %	0 %	0 %	425788671
98	NC_019560	GAAA	2	8	35639	35646	75 %	0 %	25 %	0 %	425788672
99	NC_019560	ATGA	2	8	36216	36223	50 %	25 %	25 %	0 %	425788673
100	NC_019560	TTTG	2	8	36269	36276	0 %	75 %	25 %	0 %	425788673
101	NC_019560	TGAT	2	8	36753	36760	25 %	50 %	25 %	0 %	425788674
102	NC_019560	TTGT	2	8	37069	37076	0 %	75 %	25 %	0 %	425788674
103	NC_019560	AACC	2	8	37437	37444	50 %	0 %	0 %	50 %	425788675
104	NC_019560	AAAC	2	8	37651	37658	75 %	0 %	0 %	25 %	425788675
105	NC_019560	CAAA	2	8	37727	37734	75 %	0 %	0 %	25 %	425788675
106	NC_019560	ATTG	2	8	38141	38148	25 %	50 %	25 %	0 %	425788675
107	NC_019560	ATCA	2	8	38316	38323	50 %	25 %	0 %	25 %	425788675
108	NC_019560	TCAA	2	8	38329	38336	50 %	25 %	0 %	25 %	425788675
109	NC_019560	GATT	2	8	38918	38925	25 %	50 %	25 %	0 %	425788676
110	NC_019560	TGTT	2	8	39100	39107	0 %	75 %	25 %	0 %	425788676
111	NC_019560	CTTT	2	8	39693	39700	0 %	75 %	0 %	25 %	425788676
112	NC_019560	GAGC	2	8	39719	39726	25 %	0 %	50 %	25 %	425788676
113	NC_019560	GAAA	2	8	39966	39973	75 %	0 %	25 %	0 %	425788677
114	NC_019560	GATC	2	8	40095	40102	25 %	25 %	25 %	25 %	425788677
115	NC_019560	TTTG	2	8	40497	40504	0 %	75 %	25 %	0 %	425788677
116	NC_019560	ATGA	2	8	41102	41109	50 %	25 %	25 %	0 %	425788677
117	NC_019560	TATT	2	8	41219	41226	25 %	75 %	0 %	0 %	425788678
118	NC_019560	AACG	2	8	41494	41501	50 %	0 %	25 %	25 %	425788678
119	NC_019560	CAAA	2	8	41941	41948	75 %	0 %	0 %	25 %	425788678
120	NC_019560	TGAT	2	8	42376	42383	25 %	50 %	25 %	0 %	425788679
121	NC_019560	AAAC	2	8	42389	42396	75 %	0 %	0 %	25 %	425788679
122	NC_019560	CATT	2	8	42517	42524	25 %	50 %	0 %	25 %	425788679
123	NC_019560	CGCT	2	8	42530	42537	0 %	25 %	25 %	50 %	425788679
124	NC_019560	GTTT	2	8	43152	43159	0 %	75 %	25 %	0 %	425788679
125	NC_019560	CAAA	2	8	43648	43655	75 %	0 %	0 %	25 %	425788680
126	NC_019560	AATC	2	8	44446	44453	50 %	25 %	0 %	25 %	425788680
127	NC_019560	TCGC	2	8	44463	44470	0 %	25 %	25 %	50 %	425788680
128	NC_019560	AGGG	2	8	44474	44481	25 %	0 %	75 %	0 %	425788680
129	NC_019560	ATGC	2	8	44686	44693	25 %	25 %	25 %	25 %	425788680
130	NC_019560	TTCC	2	8	44784	44791	0 %	50 %	0 %	50 %	425788680
131	NC_019560	CAAC	2	8	45259	45266	50 %	0 %	0 %	50 %	425788680
132	NC_019560	TAAA	2	8	45396	45403	75 %	25 %	0 %	0 %	425788680
133	NC_019560	TTCA	2	8	46439	46446	25 %	50 %	0 %	25 %	425788681
134	NC_019560	TGGT	2	8	47545	47552	0 %	50 %	50 %	0 %	425788683
135	NC_019560	TCTT	2	8	47838	47845	0 %	75 %	0 %	25 %	425788683
136	NC_019560	AAAT	2	8	48231	48238	75 %	25 %	0 %	0 %	425788683
137	NC_019560	CTTT	2	8	48555	48562	0 %	75 %	0 %	25 %	425788684
138	NC_019560	ATCC	2	8	48663	48670	25 %	25 %	0 %	50 %	425788684
139	NC_019560	TAAA	2	8	48899	48906	75 %	25 %	0 %	0 %	425788684
140	NC_019560	GTTG	2	8	48925	48932	0 %	50 %	50 %	0 %	425788684
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142	NC_019560	TGTA	2	8	50667	50674	25 %	50 %	25 %	0 %	425788685
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