MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 489

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	TAAA	2	8	4682	4689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019560	CAAA	2	8	7302	7309	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019560	TATT	2	8	9600	9607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019560	ATTC	2	8	9615	9622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019560	TTAA	2	8	13431	13438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019560	AGTT	2	8	16377	16384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019560	ATCA	2	8	22472	22479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019560	GTTG	2	8	22572	22579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019560	GATT	2	8	24952	24959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019560	TAAG	2	8	24990	24997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019560	TTTG	2	8	25365	25372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019560	TCGC	2	8	25388	25395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019560	GGTT	2	8	29860	29867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019560	TTGA	2	8	51841	51848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019560	TTTA	2	8	57205	57212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019560	GCGG	2	8	57243	57250	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019560	AATT	2	8	57306	57313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019560	TTGT	2	8	57383	57390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019560	CAAA	2	8	63958	63965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019560	GATA	2	8	64447	64454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019560	AGAA	2	8	64997	65004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019560	GAAA	2	8	65033	65040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019560	TACT	2	8	65856	65863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019560	TCTG	2	8	71316	71323	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019560	CAAA	2	8	72446	72453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019560	TAGA	2	8	77255	77262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019560	TTTA	2	8	78942	78949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019560	CATG	2	8	79085	79092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019560	AACT	2	8	84085	84092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019560	AAGC	2	8	92661	92668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019560	GGTG	2	8	94440	94447	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019560	TCCC	2	8	94510	94517	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_019560	AAAG	2	8	97117	97124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019560	TTTC	2	8	97381	97388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019560	CTAA	2	8	99307	99314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019560	TTCA	2	8	100296	100303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019560	TGAT	2	8	101941	101948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019560	GTGG	2	8	105218	105225	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019560	AATC	2	8	108568	108575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019560	CTAA	2	8	111158	111165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019560	CTTT	2	8	116269	116276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019560	AAAT	2	8	116279	116286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019560	ATTT	2	8	117802	117809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019560	TCAT	2	8	122502	122509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019560	TTAG	2	8	129683	129690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019560	AAAG	2	8	132589	132596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019560	AAAG	2	8	133084	133091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019560	GAAG	2	8	133141	133148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019560	ACAA	2	8	134147	134154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019560	AAAT	2	8	134201	134208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019560	AATC	2	8	134318	134325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019560	AAAT	2	8	136101	136108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019560	GAAT	2	8	136388	136395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019560	CTAA	2	8	136809	136816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019560	TCTT	2	8	141289	141296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019560	TAAG	2	8	145456	145463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019560	TAAA	2	8	151379	151386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019560	TTAA	2	8	163914	163921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019560	ATTT	2	8	163939	163946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019560	TCAA	2	8	165306	165313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019560	CACT	2	8	176072	176079	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019560	GAAT	2	8	176399	176406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019560	TTTA	2	8	179030	179037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019560	TTTA	2	8	179044	179051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019560	GCGT	2	8	179054	179061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019560	GATT	2	8	182094	182101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019560	TTGA	2	8	187386	187393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019560	TTGT	2	8	187427	187434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019560	GCTT	2	8	187698	187705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019560	TCTT	2	8	187768	187775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019560	TGCT	2	8	188384	188391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019560	CTTG	2	8	188955	188962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019560	TCGT	2	8	189015	189022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019560	ATAA	2	8	189273	189280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019560	TAAG	2	8	199746	199753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019560	TTAG	2	8	202904	202911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019560	CTTT	2	8	202919	202926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019560	ATGG	2	8	206055	206062	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019560	GAGC	2	8	208701	208708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019560	AATG	2	8	212154	212161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019560	TATT	2	8	221087	221094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019560	CGCT	2	8	226941	226948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019560	ATTT	2	8	226950	226957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019560	AAAT	2	8	227214	227221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019560	TGAT	2	8	227279	227286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019560	TCTT	2	8	228213	228220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019560	TTTA	2	8	233591	233598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019560	TAAA	2	8	251792	251799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019560	TAAT	2	8	254418	254425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019560	AAAG	2	8	254463	254470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019560	TGAT	2	8	262505	262512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019560	AACA	2	8	305994	306001	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019560	TCAG	2	8	314326	314333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019560	TTGG	2	8	324594	324601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019560	AAAT	2	8	332824	332831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019560	CAAT	2	8	338139	338146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019560	CTAG	2	8	342440	342447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019560	TTGA	2	8	351692	351699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019560	TAAA	2	8	351735	351742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019560	TAAA	2	8	352972	352979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019560	TTAA	2	8	364473	364480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019560	TAAA	2	8	364484	364491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019560	GATC	2	8	369252	369259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019560	CTTT	2	8	369300	369307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019560	TTTA	2	8	372452	372459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019560	TTCG	2	8	372735	372742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019560	CTTT	2	8	372773	372780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019560	TTTG	2	8	372816	372823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019560	CAAA	2	8	372905	372912	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019560	AAAC	2	8	376399	376406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019560	GTTT	2	8	379922	379929	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019560	TTTC	2	8	384266	384273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019560	GGGT	2	8	386156	386163	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019560	GAAA	2	8	386215	386222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019560	AACA	2	8	386228	386235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019560	CCAA	2	8	398253	398260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019560	TTAT	2	8	400528	400535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019560	TTAT	2	8	400539	400546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019560	TCAA	2	8	416108	416115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019560	CAAT	2	8	418337	418344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019560	GTTT	2	8	431251	431258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019560	CACC	2	8	431343	431350	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_019560	GTGG	2	8	431615	431622	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019560	TGAA	2	8	436777	436784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019560	AACA	2	8	439311	439318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019560	GAAA	2	8	439950	439957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019560	CTTT	2	8	439964	439971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019560	ATTT	2	8	440326	440333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019560	TTAG	2	8	441439	441446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019560	AATA	2	8	441479	441486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019560	AACA	2	8	441660	441667	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019560	TACT	2	8	441722	441729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019560	AACT	2	8	443446	443453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019560	TGTC	2	8	451940	451947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019560	GCAT	2	8	475610	475617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019560	TTTA	2	8	488764	488771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019560	AATC	2	8	501493	501500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019560	TCAA	2	8	502196	502203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019560	AGCG	2	8	506730	506737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019560	CACC	2	8	509740	509747	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_019560	AAAT	2	8	511403	511410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019560	CTTA	2	8	515962	515969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019560	TTTA	2	8	516044	516051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019560	GATT	2	8	525164	525171	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019560	CTAA	2	8	530810	530817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019560	TGAT	2	8	532835	532842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019560	ATGC	2	8	532902	532909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019560	ATTA	2	8	540525	540532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019560	ATTG	2	8	545722	545729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019560	TTTC	2	8	545994	546001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019560	TTCA	2	8	546054	546061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_019560	AGTA	2	8	546143	546150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.