MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 14905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788639
2	NC_019560	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788639
3	NC_019560	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788639
4	NC_019560	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425788639
5	NC_019560	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788640
6	NC_019560	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788640
7	NC_019560	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788640
8	NC_019560	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788640
9	NC_019560	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788640
10	NC_019560	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788641
11	NC_019560	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788641
12	NC_019560	CTG	2	6	1043	1048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788641
13	NC_019560	CCG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788641
14	NC_019560	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425788641
15	NC_019560	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788641
16	NC_019560	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788641
17	NC_019560	ATA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788641
18	NC_019560	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425788641
19	NC_019560	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788641
20	NC_019560	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788641
21	NC_019560	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788641
22	NC_019560	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788642
23	NC_019560	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788642
24	NC_019560	GCT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788642
25	NC_019560	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788642
26	NC_019560	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788642
27	NC_019560	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788642
28	NC_019560	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788642
29	NC_019560	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788642
30	NC_019560	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	425788642
31	NC_019560	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788643
32	NC_019560	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788643
33	NC_019560	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788643
34	NC_019560	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788643
35	NC_019560	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788643
36	NC_019560	TGC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788644
37	NC_019560	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788644
38	NC_019560	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788644
39	NC_019560	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425788644
40	NC_019560	TGG	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788645
41	NC_019560	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788645
42	NC_019560	TGG	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788645
43	NC_019560	GTT	2	6	5590	5595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
44	NC_019560	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788645
45	NC_019560	TTA	2	6	5717	5722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788645
46	NC_019560	GTG	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788645
47	NC_019560	TCT	2	6	5930	5935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788645
48	NC_019560	ATG	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788645
49	NC_019560	AGT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788645
50	NC_019560	AGA	2	6	6136	6141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788645
51	NC_019560	CGA	2	6	6213	6218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788645
52	NC_019560	CTT	2	6	6384	6389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788645
53	NC_019560	TAG	6	18	6411	6428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788645
54	NC_019560	TGT	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
55	NC_019560	GTT	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
56	NC_019560	TTG	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
57	NC_019560	CAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788645
58	NC_019560	TTG	2	6	6664	6669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
59	NC_019560	CCG	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788645
60	NC_019560	GCT	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425788645
61	NC_019560	GTT	2	6	6880	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788645
62	NC_019560	CAT	2	6	7363	7368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
63	NC_019560	GCC	2	6	7369	7374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788646
64	NC_019560	TCT	2	6	7430	7435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
65	NC_019560	AAT	2	6	7528	7533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788646
66	NC_019560	CTT	2	6	7536	7541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
67	NC_019560	CAT	2	6	7626	7631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
68	NC_019560	ATG	2	6	7679	7684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788646
69	NC_019560	TCA	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
70	NC_019560	CCG	2	6	7757	7762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788646
71	NC_019560	CTT	2	6	7776	7781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
72	NC_019560	TCA	2	6	7811	7816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
73	NC_019560	CAT	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788646
74	NC_019560	GTG	2	6	8012	8017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788646
75	NC_019560	TTC	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
76	NC_019560	CCG	2	6	8111	8116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425788646
77	NC_019560	CAC	2	6	8212	8217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425788646
78	NC_019560	GAT	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788646
79	NC_019560	TAG	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788646
80	NC_019560	ACA	2	6	8435	8440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788646
81	NC_019560	CTT	2	6	8466	8471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
82	NC_019560	TCT	2	6	8576	8581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
83	NC_019560	TAA	2	6	8619	8624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788646
84	NC_019560	GCA	2	6	8750	8755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788646
85	NC_019560	CTT	2	6	8775	8780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788646
86	NC_019560	ACA	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788647
87	NC_019560	TCT	2	6	9128	9133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788647
88	NC_019560	CTT	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788647
89	NC_019560	GAT	3	9	9298	9306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788647
90	NC_019560	TCT	2	6	9326	9331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425788647
91	NC_019560	CTA	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425788647
92	NC_019560	TTG	2	6	9770	9775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788648
93	NC_019560	GAA	2	6	9786	9791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788648
94	NC_019560	TTA	2	6	9965	9970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788648
95	NC_019560	AGA	2	6	9980	9985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788648
96	NC_019560	ACC	2	6	9988	9993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425788648
97	NC_019560	AAG	2	6	10021	10026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788648
98	NC_019560	ATT	2	6	10054	10059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788648
99	NC_019560	GTG	2	6	10269	10274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788648
100	NC_019560	ATG	2	6	10549	10554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788648
101	NC_019560	AAC	2	6	10641	10646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788648
102	NC_019560	AGA	2	6	11027	11032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788648
103	NC_019560	TTG	2	6	11040	11045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788648
104	NC_019560	GAC	2	6	11127	11132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425788648
105	NC_019560	TTA	3	9	11148	11156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788648
106	NC_019560	TTG	2	6	11205	11210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788648
107	NC_019560	TGT	2	6	11391	11396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788649
108	NC_019560	TGT	2	6	11559	11564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788649
109	NC_019560	AAG	2	6	11718	11723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788649
110	NC_019560	GTT	2	6	11833	11838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788649
111	NC_019560	TGG	3	9	12129	12137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788649
112	NC_019560	GAA	3	9	12146	12154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788649
113	NC_019560	AGA	2	6	12250	12255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788649
114	NC_019560	GAA	2	6	12579	12584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788650
115	NC_019560	GTT	2	6	12646	12651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788650
116	NC_019560	ATT	2	6	12669	12674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788650
117	NC_019560	AAT	2	6	12951	12956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425788650
118	NC_019560	ACC	2	6	13045	13050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425788650
119	NC_019560	TTG	2	6	13195	13200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425788650
120	NC_019560	GTG	2	6	13672	13677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425788651
121	NC_019560	GAA	2	6	13763	13768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788652
122	NC_019560	ATT	3	9	13950	13958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788652
123	NC_019560	GAA	2	6	14089	14094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788653
124	NC_019560	AAC	2	6	14095	14100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788653
125	NC_019560	ATG	2	6	14114	14119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788653
126	NC_019560	TCC	2	6	14159	14164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425788653
127	NC_019560	CAA	2	6	14299	14304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425788653
128	NC_019560	AAG	2	6	14360	14365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425788653
129	NC_019560	TAG	2	6	14627	14632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425788653
130	NC_019560	ATT	2	6	14684	14689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425788653
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