MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Aklavik117 chromosome

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019560	AC	3	6	13363	13368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019560	CA	3	6	16438	16443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019560	GT	3	6	24981	24986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019560	AG	3	6	25283	25288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019560	CT	3	6	49586	49591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019560	GA	3	6	49663	49668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019560	GC	3	6	63551	63556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019560	CG	3	6	64045	64050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019560	GA	3	6	64258	64263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019560	AG	3	6	64336	64341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019560	AG	3	6	65127	65132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019560	AG	3	6	65229	65234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019560	GC	3	6	65429	65434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019560	GA	3	6	65816	65821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019560	AG	3	6	72579	72584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019560	TA	12	24	78897	78920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019560	TC	3	6	81836	81841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019560	AG	4	8	86273	86280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019560	AG	3	6	86300	86305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019560	GA	3	6	86333	86338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019560	AG	3	6	94647	94652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019560	TA	3	6	98237	98242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019560	AG	3	6	108679	108684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019560	CT	3	6	114263	114268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019560	CT	3	6	117872	117877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019560	AT	3	6	129570	129575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019560	CA	3	6	134174	134179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019560	AG	3	6	135141	135146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019560	TA	3	6	135180	135185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019560	CT	3	6	136151	136156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019560	CA	3	6	141713	141718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019560	TG	3	6	164002	164007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019560	TC	3	6	167128	167133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019560	AC	3	6	176521	176526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019560	AT	3	6	182242	182247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019560	GA	3	6	182248	182253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019560	AG	3	6	187502	187507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019560	GC	3	6	187511	187516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019560	TA	3	6	187989	187994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019560	GT	3	6	198002	198007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019560	TG	3	6	198020	198025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019560	AT	3	6	204624	204629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019560	CA	3	6	206001	206006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019560	TG	3	6	224329	224334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019560	GT	3	6	231989	231994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019560	AG	3	6	299627	299632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019560	TG	3	6	321768	321773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019560	AG	3	6	328102	328107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019560	CT	3	6	337002	337007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019560	AG	3	6	337033	337038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019560	AT	3	6	338075	338080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019560	CT	3	6	351969	351974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019560	TA	4	8	369275	369282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019560	AG	3	6	371029	371034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019560	GA	4	8	380637	380644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019560	TA	3	6	431267	431272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019560	GC	3	6	431359	431364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019560	AG	3	6	436071	436076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019560	CT	3	6	436832	436837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019560	CA	3	6	436932	436937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019560	GC	3	6	439440	439445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019560	AT	3	6	443492	443497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019560	CA	3	6	452088	452093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019560	AT	4	8	490205	490212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019560	AG	3	6	493502	493507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019560	CA	3	6	501689	501694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019560	GT	3	6	502019	502024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019560	GT	4	8	502097	502104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019560	GC	3	6	502136	502141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019560	CA	3	6	509787	509792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019560	TG	3	6	530751	530756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019560	CT	3	6	531236	531241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019560	GT	3	6	545821	545826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019560	AC	3	6	546345	546350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019560	TA	3	6	550450	550455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019560	AC	3	6	551880	551885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019560	TA	3	6	555742	555747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019560	AT	3	6	579612	579617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019560	TA	3	6	595184	595189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019560	CT	3	6	632497	632502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019560	CT	8	16	632505	632520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019560	CT	3	6	632849	632854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019560	GA	4	8	647321	647328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019560	CT	3	6	648699	648704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019560	TA	3	6	662937	662942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019560	TA	3	6	683320	683325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019560	TA	3	6	683372	683377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019560	AG	3	6	706863	706868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019560	CT	3	6	708128	708133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019560	GA	7	14	710508	710521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019560	TA	3	6	716800	716805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019560	CT	3	6	727120	727125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019560	TC	3	6	727436	727441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019560	CT	3	6	727648	727653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019560	TA	3	6	727838	727843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019560	GA	3	6	731497	731502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019560	AG	3	6	738231	738236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019560	TC	3	6	738949	738954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019560	CT	3	6	757378	757383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019560	GC	3	6	758530	758535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019560	CT	3	6	758550	758555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019560	CT	3	6	758658	758663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019560	CT	3	6	758861	758866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019560	CA	3	6	759298	759303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019560	CT	3	6	760266	760271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019560	GA	3	6	760354	760359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019560	GA	3	6	760372	760377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019560	GA	3	6	776529	776534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019560	TC	3	6	779524	779529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019560	TA	3	6	783611	783616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019560	TG	3	6	794042	794047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019560	CT	3	6	803200	803205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019560	AT	3	6	819767	819772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019560	TC	3	6	849062	849067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019560	AC	3	6	865372	865377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019560	GC	3	6	875796	875801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019560	CT	3	6	888025	888030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019560	AT	3	6	888084	888089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019560	CT	3	6	903266	903271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_019560	AT	3	6	912451	912456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019560	GA	3	6	940302	940307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019560	AG	3	6	940459	940464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019560	AG	3	6	940779	940784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019560	AT	3	6	948424	948429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019560	AT	3	6	949182	949187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019560	CT	3	6	949400	949405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019560	CT	3	6	962422	962427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019560	AG	9	18	969726	969743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019560	CT	3	6	982355	982360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019560	AT	3	6	992918	992923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019560	AT	3	6	992945	992950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019560	AG	3	6	1007634	1007639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019560	CT	3	6	1008958	1008963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019560	GT	3	6	1009183	1009188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019560	CA	3	6	1009504	1009509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019560	AT	3	6	1010613	1010618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019560	CA	3	6	1010853	1010858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019560	AT	3	6	1011065	1011070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019560	CT	3	6	1011750	1011755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019560	CT	3	6	1011870	1011875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019560	GA	3	6	1012963	1012968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019560	CT	3	6	1016350	1016355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_019560	TC	3	6	1016362	1016367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019560	CT	3	6	1016375	1016380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_019560	AT	3	6	1033435	1033440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019560	TA	3	6	1054824	1054829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019560	TA	3	6	1058668	1058673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019560	AT	3	6	1083043	1083048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019560	AT	3	6	1088518	1088523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019560	GT	3	6	1091562	1091567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019560	GC	3	6	1091572	1091577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019560	TG	3	6	1099688	1099693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_019560	GC	3	6	1589840	1589845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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254	NC_019560	TC	3	6	1613395	1613400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.