MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019556	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019556	ATTTAT	2	12	87400	87411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019556	CAGGTT	2	12	150686	150697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019556	ACACTT	2	12	178577	178588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019556	AATAAA	2	12	204906	204917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019556	GAAAAC	2	12	231821	231832	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019556	ATTCAA	2	12	242714	242725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019556	AAGGAA	2	12	244285	244296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019556	TAGGCG	2	12	245938	245949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019556	ATTCAA	2	12	248733	248744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019556	AAGGAA	2	12	250304	250315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019556	TAGGCG	2	12	251957	251968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019556	AGTCAA	2	12	253771	253782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019556	TTATAT	2	12	268556	268567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019556	AACTTT	2	12	304271	304282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019556	TAAAAA	2	12	309640	309651	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019556	AATACA	2	12	314089	314100	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019556	CATAGA	2	12	362417	362428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019556	CAGAAA	2	12	375799	375810	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019556	AGAAGC	2	12	375872	375883	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019556	AAATTT	2	12	385993	386004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019556	AAAAGA	2	12	399315	399326	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019556	TAGTTT	2	12	405924	405935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019556	TTGTTT	2	12	421430	421441	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019556	TAATTA	2	12	467261	467272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019556	AAGTCA	2	12	475844	475855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019556	TTAAAT	2	12	518711	518722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019556	CTATAA	2	12	520481	520492	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019556	AAATGT	2	12	569305	569316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019556	AGATTT	2	12	577436	577447	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019556	AAATAA	2	12	617739	617750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019556	ATCATT	2	12	646094	646105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019556	ATCATT	2	12	687851	687862	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019556	GAATAA	2	12	717575	717586	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019556	TATAGG	2	12	740486	740497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019556	AATTAG	2	12	767933	767944	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019556	TGTTGA	2	12	778990	779001	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019556	TTACTT	2	12	853936	853947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019556	AAATAG	2	12	890339	890350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019556	GTAATC	2	12	897142	897153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019556	TTACAA	2	12	897160	897171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019556	ATGAAA	2	12	905764	905775	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019556	TTGACT	2	12	1029703	1029714	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019556	AGGAAG	2	12	1039894	1039905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019556	AACAAT	2	12	1078897	1078908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019556	CTTTTT	2	12	1095200	1095211	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019556	TATATT	2	12	1108056	1108067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019556	ATTTAT	2	12	1119005	1119016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019556	CATGTA	2	12	1126799	1126810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019556	GTGCAT	2	12	1126895	1126906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019556	TTAATT	2	12	1135678	1135689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019556	AAATAA	2	12	1138689	1138700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019556	CTTTTT	2	12	1180917	1180928	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019556	CTTTTT	2	12	1213720	1213731	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019556	GAAAAA	2	12	1243685	1243696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019556	TATTAA	2	12	1275373	1275384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019556	GTACAA	2	12	1388668	1388679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019556	TAATCA	2	12	1422033	1422044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019556	CTCTTC	2	12	1568811	1568822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019556	TCATTA	2	12	1605134	1605145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019556	GAATAA	2	12	1621011	1621022	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019556	GTAAAC	2	12	1622162	1622173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019556	ACAAAA	2	12	1630786	1630797	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019556	AAAATA	2	12	1635106	1635117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019556	TAAAAA	2	12	1636016	1636027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019556	CTTATT	2	12	1722008	1722019	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019556	CGCCTA	2	12	1725518	1725529	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019556	TTTCCT	2	12	1727170	1727181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019556	TTGAAT	2	12	1728742	1728753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019556	CGCCTA	2	12	1830195	1830206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019556	TTTCCT	2	12	1831847	1831858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019556	TTGAAT	2	12	1833419	1833430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019556	GTTTTG	2	12	1841371	1841382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019556	CCCCTG	2	12	1852593	1852604	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_019556	AAAAGA	2	12	1923866	1923877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019556	CTCTAT	2	12	1943190	1943201	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019556	TCATTT	2	12	1944388	1944399	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019556	GTTTTC	2	12	1971557	1971568	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019556	GAAAAA	2	12	1993141	1993152	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019556	ATTTCG	2	12	2035019	2035030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019556	TTCACT	2	12	2143316	2143327	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019556	ATTCAA	2	12	2154045	2154056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019556	TTTAAT	2	12	2189858	2189869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019556	TATATT	2	12	2216945	2216956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019556	AATTTT	2	12	2274910	2274921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019556	ACGTTG	2	12	2275451	2275462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019556	GAATAC	2	12	2275576	2275587	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019556	AAATTG	2	12	2281086	2281097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019556	CTCTGT	2	12	2287930	2287941	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019556	TTTTAT	2	12	2310695	2310706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019556	CCTTTT	2	12	2327798	2327809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019556	TTATTT	2	12	2342949	2342960	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019556	TAATAC	2	12	2371693	2371704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019556	CGCCTA	2	12	2392488	2392499	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019556	TTTCCT	2	12	2394391	2394402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019556	TTGAAT	2	12	2395963	2395974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019556	CTTTTT	2	12	2547039	2547050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019556	CTTTTG	2	12	2556564	2556575	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019556	ATCCCA	2	12	2566952	2566963	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019556	TTTTTA	2	12	2578779	2578790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019556	CGCCTA	2	12	2622767	2622778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019556	TTTCCT	2	12	2624670	2624681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019556	TTGAAT	2	12	2626242	2626253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019556	CCTCTT	2	12	2668713	2668724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019556	AGCTAG	2	12	2683708	2683719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019556	TAAATC	2	12	2695748	2695759	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019556	TTTTTC	2	12	2753051	2753062	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019556	TATCAA	2	12	2843318	2843329	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019556	AAATGA	2	12	2843332	2843343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019556	TAAAAA	2	12	2843402	2843413	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019556	AAGTAT	2	12	2844269	2844280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.