MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195

Total Repeats: 2128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019556	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019556	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	424712852
3	NC_019556	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	424712852
4	NC_019556	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	424712853
5	NC_019556	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	424712856
6	NC_019556	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	424712858
7	NC_019556	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	424712859
8	NC_019556	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	424712861
9	NC_019556	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	424712862
10	NC_019556	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	424712865
11	NC_019556	ATTGT	2	10	17721	17730	20 %	60 %	20 %	0 %	424712866
12	NC_019556	ATGAA	2	10	19331	19340	60 %	20 %	20 %	0 %	424712867
13	NC_019556	GAATG	2	10	21073	21082	40 %	20 %	40 %	0 %	424712868
14	NC_019556	TAATT	2	10	22450	22459	40 %	60 %	0 %	0 %	424712871
15	NC_019556	ATTAA	2	10	23967	23976	60 %	40 %	0 %	0 %	424712872
16	NC_019556	AAATC	2	10	24428	24437	60 %	20 %	0 %	20 %	424712872
17	NC_019556	ATTTT	2	10	25205	25214	20 %	80 %	0 %	0 %	424712873
18	NC_019556	GGATT	2	10	25550	25559	20 %	40 %	40 %	0 %	424712873
19	NC_019556	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019556	ATGGA	2	10	30908	30917	40 %	20 %	40 %	0 %	424712880
21	NC_019556	AATAA	2	10	33746	33755	80 %	20 %	0 %	0 %	424712882
22	NC_019556	GGTTT	2	10	34291	34300	0 %	60 %	40 %	0 %	424712883
23	NC_019556	CATAT	2	10	34623	34632	40 %	40 %	0 %	20 %	424712883
24	NC_019556	TTTCT	2	10	34906	34915	0 %	80 %	0 %	20 %	424712884
25	NC_019556	CCATA	2	10	35591	35600	40 %	20 %	0 %	40 %	424712885
26	NC_019556	GAAAA	2	10	36436	36445	80 %	0 %	20 %	0 %	424712886
27	NC_019556	AGATA	2	10	36693	36702	60 %	20 %	20 %	0 %	424712886
28	NC_019556	AATTG	2	10	37004	37013	40 %	40 %	20 %	0 %	424712887
29	NC_019556	TAAAA	2	10	37256	37265	80 %	20 %	0 %	0 %	424712887
30	NC_019556	AAAGG	2	10	37664	37673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019556	CTATT	2	10	38160	38169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019556	GAAAA	2	10	39246	39255	80 %	0 %	20 %	0 %	424712890
33	NC_019556	TGAAA	2	10	40401	40410	60 %	20 %	20 %	0 %	424712891
34	NC_019556	GAATG	2	10	42272	42281	40 %	20 %	40 %	0 %	424712893
35	NC_019556	AAATT	2	10	42399	42408	60 %	40 %	0 %	0 %	424712893
36	NC_019556	ATTTT	2	10	43005	43014	20 %	80 %	0 %	0 %	424712893
37	NC_019556	AAAAC	2	10	46632	46641	80 %	0 %	0 %	20 %	424712895
38	NC_019556	TTATT	2	10	48118	48127	20 %	80 %	0 %	0 %	424712897
39	NC_019556	GAAAA	2	10	49331	49340	80 %	0 %	20 %	0 %	424712897
40	NC_019556	ATAAA	2	10	50156	50165	80 %	20 %	0 %	0 %	424712898
41	NC_019556	ATTTT	2	10	51960	51969	20 %	80 %	0 %	0 %	424712900
42	NC_019556	GACAT	2	10	53173	53182	40 %	20 %	20 %	20 %	424712901
43	NC_019556	GACTT	2	10	53457	53466	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019556	ATTTT	2	10	53543	53552	20 %	80 %	0 %	0 %	424712902
45	NC_019556	AAATG	2	10	54672	54681	60 %	20 %	20 %	0 %	424712903
46	NC_019556	ATGGT	2	10	55709	55718	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019556	GTAGA	2	10	55758	55767	40 %	20 %	40 %	0 %	424712904
48	NC_019556	TTACT	2	10	56740	56749	20 %	60 %	0 %	20 %	424712906
49	NC_019556	CAAAA	2	10	57247	57256	80 %	0 %	0 %	20 %	424712907
50	NC_019556	GAAAT	2	10	57397	57406	60 %	20 %	20 %	0 %	424712907
51	NC_019556	CTTAG	2	10	57496	57505	20 %	40 %	20 %	20 %	424712907
52	NC_019556	AAATA	2	10	57765	57774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019556	TAAAA	2	10	58747	58756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019556	TGCTA	2	10	58921	58930	20 %	40 %	20 %	20 %	424712910
55	NC_019556	TTTTA	2	10	59089	59098	20 %	80 %	0 %	0 %	424712910
56	NC_019556	AGTTA	2	10	60405	60414	40 %	40 %	20 %	0 %	424712911
57	NC_019556	TTATG	2	10	60954	60963	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019556	AGTCT	2	10	61870	61879	20 %	40 %	20 %	20 %	424712912
59	NC_019556	TTTTA	2	10	64866	64875	20 %	80 %	0 %	0 %	424712915
60	NC_019556	AAACG	2	10	69235	69244	60 %	0 %	20 %	20 %	424712919
61	NC_019556	CAAAA	2	10	70735	70744	80 %	0 %	0 %	20 %	424712920
62	NC_019556	AACAA	2	10	72154	72163	80 %	0 %	0 %	20 %	424712922
63	NC_019556	GAGAG	2	10	77213	77222	40 %	0 %	60 %	0 %	424712924
64	NC_019556	GCAAA	2	10	78395	78404	60 %	0 %	20 %	20 %	424712927
65	NC_019556	CAATA	2	10	78460	78469	60 %	20 %	0 %	20 %	424712927
66	NC_019556	GCCTT	2	10	79263	79272	0 %	40 %	20 %	40 %	424712928
67	NC_019556	CAAAA	2	10	79640	79649	80 %	0 %	0 %	20 %	424712928
68	NC_019556	TAATT	2	10	81843	81852	40 %	60 %	0 %	0 %	424712932
69	NC_019556	AAATG	2	10	82260	82269	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019556	GCCTT	2	10	83040	83049	0 %	40 %	20 %	40 %	424712933
71	NC_019556	CAAAA	2	10	83417	83426	80 %	0 %	0 %	20 %	424712933
72	NC_019556	AATTA	2	10	84359	84368	60 %	40 %	0 %	0 %	424712934
73	NC_019556	AATAG	2	10	84799	84808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019556	ATAAA	2	10	85611	85620	80 %	20 %	0 %	0 %	424712935
75	NC_019556	GAAAT	2	10	85937	85946	60 %	20 %	20 %	0 %	424712936
76	NC_019556	ATAGC	2	10	85957	85966	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019556	GCTTT	2	10	86735	86744	0 %	60 %	20 %	20 %	424712938
78	NC_019556	AGTAG	2	10	88080	88089	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019556	AGTAA	2	10	88331	88340	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019556	TTATA	2	10	88580	88589	40 %	60 %	0 %	0 %	424712941
81	NC_019556	TATTT	2	10	88675	88684	20 %	80 %	0 %	0 %	424712942
82	NC_019556	GCTTG	2	10	90656	90665	0 %	40 %	40 %	20 %	424712944
83	NC_019556	GCGCT	2	10	92710	92719	0 %	20 %	40 %	40 %	424712946
84	NC_019556	ATTTG	2	10	94686	94695	20 %	60 %	20 %	0 %	424712947
85	NC_019556	TAAAA	2	10	95930	95939	80 %	20 %	0 %	0 %	424712949
86	NC_019556	TTTGT	2	10	97035	97044	0 %	80 %	20 %	0 %	424712952
87	NC_019556	TTTCT	2	10	97773	97782	0 %	80 %	0 %	20 %	424712952
88	NC_019556	ATTTT	2	10	98022	98031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019556	CTAAA	2	10	100134	100143	60 %	20 %	0 %	20 %	424712954
90	NC_019556	GAAAA	2	10	101477	101486	80 %	0 %	20 %	0 %	424712954
91	NC_019556	TGAAA	2	10	101719	101728	60 %	20 %	20 %	0 %	424712954
92	NC_019556	AAATT	2	10	102063	102072	60 %	40 %	0 %	0 %	424712954
93	NC_019556	AGCGG	2	10	102647	102656	20 %	0 %	60 %	20 %	424712954
94	NC_019556	GGAAA	2	10	103826	103835	60 %	0 %	40 %	0 %	424712954
95	NC_019556	CGAAA	2	10	105142	105151	60 %	0 %	20 %	20 %	424712955
96	NC_019556	AAAAG	2	10	105455	105464	80 %	0 %	20 %	0 %	424712955
97	NC_019556	TGCAT	2	10	109115	109124	20 %	40 %	20 %	20 %	424712958
98	NC_019556	TTACT	2	10	109361	109370	20 %	60 %	0 %	20 %	424712958
99	NC_019556	GTTTT	2	10	110959	110968	0 %	80 %	20 %	0 %	424712960
100	NC_019556	TGGCT	2	10	111110	111119	0 %	40 %	40 %	20 %	424712960
101	NC_019556	AGCGG	2	10	112559	112568	20 %	0 %	60 %	20 %	424712961
102	NC_019556	ATATC	2	10	119970	119979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019556	AAAAG	2	10	122658	122667	80 %	0 %	20 %	0 %	424712974
104	NC_019556	ACGGT	2	10	124202	124211	20 %	20 %	40 %	20 %	424712975
105	NC_019556	GAAAT	2	10	125441	125450	60 %	20 %	20 %	0 %	424712976
106	NC_019556	GAATT	2	10	126082	126091	40 %	40 %	20 %	0 %	424712976
107	NC_019556	CTTTA	2	10	130286	130295	20 %	60 %	0 %	20 %	424712979
108	NC_019556	AGAGA	2	10	130796	130805	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019556	CTCGA	2	10	131637	131646	20 %	20 %	20 %	40 %	424712981
110	NC_019556	TTCCA	2	10	131971	131980	20 %	40 %	0 %	40 %	424712981
111	NC_019556	TTACT	2	10	132235	132244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019556	TTTTA	2	10	133169	133178	20 %	80 %	0 %	0 %	424712983
113	NC_019556	AAAAG	2	10	133438	133447	80 %	0 %	20 %	0 %	424712984
114	NC_019556	AAAGT	2	10	134476	134485	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019556	TTAGT	2	10	135598	135607	20 %	60 %	20 %	0 %	424712988
116	NC_019556	TGAAC	2	10	136280	136289	40 %	20 %	20 %	20 %	424712990
117	NC_019556	AGATG	2	10	136322	136331	40 %	20 %	40 %	0 %	424712990
118	NC_019556	TTTAT	2	10	138598	138607	20 %	80 %	0 %	0 %	424712991
119	NC_019556	AAGTG	2	10	140620	140629	40 %	20 %	40 %	0 %	424712994
120	NC_019556	AGTCT	2	10	140900	140909	20 %	40 %	20 %	20 %	424712994
121	NC_019556	TGTAA	2	10	141980	141989	40 %	40 %	20 %	0 %	424712996
122	NC_019556	AATTT	2	10	142362	142371	40 %	60 %	0 %	0 %	424712997
123	NC_019556	TTGTT	2	10	144728	144737	0 %	80 %	20 %	0 %	424712999
124	NC_019556	ATTTT	2	10	146530	146539	20 %	80 %	0 %	0 %	424713001
125	NC_019556	AAAAT	2	10	148032	148041	80 %	20 %	0 %	0 %	424713001
126	NC_019556	AACTT	2	10	149341	149350	40 %	40 %	0 %	20 %	424713004
127	NC_019556	ACAAA	2	10	149443	149452	80 %	0 %	0 %	20 %	424713004
128	NC_019556	ACTTG	2	10	150237	150246	20 %	40 %	20 %	20 %	424713004
129	NC_019556	CCACA	2	10	150578	150587	40 %	0 %	0 %	60 %	424713004
130	NC_019556	TTGGT	2	10	151033	151042	0 %	60 %	40 %	0 %	424713005
131	NC_019556	TGTTT	2	10	151376	151385	0 %	80 %	20 %	0 %	424713005
132	NC_019556	TATGA	2	10	154011	154020	40 %	40 %	20 %	0 %	424713010
133	NC_019556	TAACG	2	10	155860	155869	40 %	20 %	20 %	20 %	424713013
134	NC_019556	AGTAG	2	10	156182	156191	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019556	ATAAA	2	10	157393	157402	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019556	ATCCG	2	10	158525	158534	20 %	20 %	20 %	40 %	424713019
137	NC_019556	ACGGC	2	10	159146	159155	20 %	0 %	40 %	40 %	424713019
138	NC_019556	TTTAA	2	10	159218	159227	40 %	60 %	0 %	0 %	424713019
139	NC_019556	AATTT	2	10	159404	159413	40 %	60 %	0 %	0 %	424713019
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146	NC_019556	ATATG	2	10	166551	166560	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_019556	ACTAA	2	10	304380	304389	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
251	NC_019556	ATTGC	2	10	304538	304547	20 %	40 %	20 %	20 %	424713138
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253	NC_019556	GTTTT	2	10	308882	308891	0 %	80 %	20 %	0 %	424713142
254	NC_019556	ATTTT	2	10	309247	309256	20 %	80 %	0 %	0 %	424713142
255	NC_019556	TATAA	2	10	309606	309615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_019556	AGGTA	2	10	310171	310180	40 %	20 %	40 %	0 %	424713143
257	NC_019556	AAAGA	2	10	312834	312843	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_019556	ATTGT	2	10	314001	314010	20 %	60 %	20 %	0 %	424713147
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263	NC_019556	AGTTA	2	10	317123	317132	40 %	40 %	20 %	0 %	424713151
264	NC_019556	CGATG	2	10	319329	319338	20 %	20 %	40 %	20 %	424713152
265	NC_019556	AGAAA	2	10	327342	327351	80 %	0 %	20 %	0 %	424713161
266	NC_019556	TGCAA	2	10	328306	328315	40 %	20 %	20 %	20 %	424713162
267	NC_019556	CGAAT	2	10	328660	328669	40 %	20 %	20 %	20 %	424713162
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269	NC_019556	ATGGC	2	10	331067	331076	20 %	20 %	40 %	20 %	424713163
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