MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195

Total Repeats: 37948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019556	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712851
2	NC_019556	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712851
3	NC_019556	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712851
4	NC_019556	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
5	NC_019556	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
6	NC_019556	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712851
7	NC_019556	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	424712851
8	NC_019556	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712851
9	NC_019556	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712851
10	NC_019556	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712851
11	NC_019556	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
12	NC_019556	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712851
13	NC_019556	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
14	NC_019556	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712851
15	NC_019556	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712851
16	NC_019556	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	424712851
17	NC_019556	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712851
18	NC_019556	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712851
19	NC_019556	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712851
20	NC_019556	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712851
21	NC_019556	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712851
22	NC_019556	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
23	NC_019556	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712851
24	NC_019556	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712851
25	NC_019556	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712851
26	NC_019556	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712851
27	NC_019556	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712852
28	NC_019556	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
29	NC_019556	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
30	NC_019556	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712852
31	NC_019556	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712852
32	NC_019556	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712852
33	NC_019556	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
34	NC_019556	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712852
35	NC_019556	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
36	NC_019556	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712852
37	NC_019556	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712852
38	NC_019556	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712852
39	NC_019556	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712852
40	NC_019556	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712852
41	NC_019556	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
42	NC_019556	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712852
43	NC_019556	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
44	NC_019556	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712853
45	NC_019556	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
46	NC_019556	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712853
47	NC_019556	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
48	NC_019556	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
49	NC_019556	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712853
50	NC_019556	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
51	NC_019556	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
52	NC_019556	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712853
53	NC_019556	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712853
54	NC_019556	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712853
55	NC_019556	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712853
56	NC_019556	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712853
57	NC_019556	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	424712853
58	NC_019556	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424712853
59	NC_019556	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712853
60	NC_019556	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712853
61	NC_019556	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
62	NC_019556	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712853
63	NC_019556	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
64	NC_019556	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712853
65	NC_019556	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712853
66	NC_019556	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712853
67	NC_019556	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712854
68	NC_019556	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712854
69	NC_019556	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712855
70	NC_019556	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712855
71	NC_019556	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712855
72	NC_019556	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712855
73	NC_019556	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	424712855
74	NC_019556	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712855
75	NC_019556	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712855
76	NC_019556	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712855
77	NC_019556	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712855
78	NC_019556	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712855
79	NC_019556	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712855
80	NC_019556	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712855
81	NC_019556	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712855
82	NC_019556	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712855
83	NC_019556	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712856
84	NC_019556	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712856
85	NC_019556	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712856
86	NC_019556	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712856
87	NC_019556	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712856
88	NC_019556	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	424712856
89	NC_019556	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712856
90	NC_019556	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712856
91	NC_019556	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712856
92	NC_019556	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712856
93	NC_019556	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712856
94	NC_019556	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	424712856
95	NC_019556	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712856
96	NC_019556	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712856
97	NC_019556	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712856
98	NC_019556	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712856
99	NC_019556	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712856
100	NC_019556	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712856
101	NC_019556	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712856
102	NC_019556	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712856
103	NC_019556	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712856
104	NC_019556	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424712856
105	NC_019556	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712856
106	NC_019556	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	424712856
107	NC_019556	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712856
108	NC_019556	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712856
109	NC_019556	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712856
110	NC_019556	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712856
111	NC_019556	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712856
112	NC_019556	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712857
113	NC_019556	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712857
114	NC_019556	TCG	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712857
115	NC_019556	GGC	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	424712857
116	NC_019556	CTT	2	6	8467	8472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712857
117	NC_019556	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712857
118	NC_019556	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712857
119	NC_019556	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	424712857
120	NC_019556	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712857
121	NC_019556	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712857
122	NC_019556	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712857
123	NC_019556	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712857
124	NC_019556	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712857
125	NC_019556	TCG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424712857
126	NC_019556	AAT	2	6	9016	9021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424712857
127	NC_019556	ACT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712857
128	NC_019556	ATC	2	6	9083	9088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712857
129	NC_019556	ATT	2	6	9122	9127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712857
130	NC_019556	AGT	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712857
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256	NC_019556	GTA	2	6	18548	18553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712867
257	NC_019556	GAA	2	6	18640	18645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424712867
258	NC_019556	CAA	2	6	18689	18694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424712867
259	NC_019556	GTA	2	6	18961	18966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712867
260	NC_019556	TTA	2	6	19025	19030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424712867
261	NC_019556	TTG	2	6	19106	19111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712867
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263	NC_019556	TGA	2	6	19209	19214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712867
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272	NC_019556	ATC	2	6	19762	19767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424712868
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277	NC_019556	TGA	2	6	20009	20014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712868
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280	NC_019556	ATG	2	6	20221	20226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712868
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284	NC_019556	GAT	3	9	20460	20468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424712868
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287	NC_019556	CTT	2	6	20646	20651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712868
288	NC_019556	TTC	2	6	20770	20775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424712868
289	NC_019556	GTT	2	6	20785	20790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424712868
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