MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis SK76 chromosome

Total Repeats: 554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019552	GAAAGA	2	12	1146	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423262556
2	NC_019552	GAAAAA	2	12	1382	1393	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262557
3	NC_019552	TTCAAA	2	12	1429	1440	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262557
4	NC_019552	GTTTAA	2	12	1860	1871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423262557
5	NC_019552	TCTTTT	2	12	10887	10898	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	423262566
6	NC_019552	CATTCA	2	12	15360	15371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423262569
7	NC_019552	AAATAA	2	12	15648	15659	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	423262569
8	NC_019552	AATTAA	2	12	16107	16118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423262569
9	NC_019552	TTTGAA	2	12	23972	23983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423262572
10	NC_019552	AAGATG	2	12	26615	26626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423262577
11	NC_019552	TGCAAA	2	12	27971	27982	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423262578
12	NC_019552	TCAAGT	2	12	29581	29592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423262579
13	NC_019552	TTTAGA	2	12	33366	33377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423262582
14	NC_019552	GAATTT	2	12	35596	35607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423262584
15	NC_019552	AATTTA	2	12	37225	37236	50 %	50 %	0 %	0 %	423262586
16	NC_019552	TTTATC	2	12	41094	41105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423262590
17	NC_019552	AAAGCA	2	12	45447	45458	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	423262594
18	NC_019552	ATTTCT	2	12	46315	46326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423262594
19	NC_019552	CTTATT	2	12	48126	48137	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423262598
20	NC_019552	ATTAAT	2	12	48238	48249	50 %	50 %	0 %	0 %	423262598
21	NC_019552	AATGAA	2	12	49042	49053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262599
22	NC_019552	AAATTT	2	12	49065	49076	50 %	50 %	0 %	0 %	423262599
23	NC_019552	TTTTGA	2	12	50095	50106	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423262600
24	NC_019552	ATGGTA	2	12	54244	54255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423262604
25	NC_019552	AAATTG	2	12	56722	56733	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423262604
26	NC_019552	AGAAAA	2	12	56795	56806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262604
27	NC_019552	TAAATA	2	12	59808	59819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423262607
28	NC_019552	ATTACA	2	12	62531	62542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262609
29	NC_019552	ATTTAA	2	12	62908	62919	50 %	50 %	0 %	0 %	423262610
30	NC_019552	AGGATT	2	12	68859	68870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423262615
31	NC_019552	TATATG	2	12	72283	72294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423262616
32	NC_019552	GAAAAA	2	12	73628	73639	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262617
33	NC_019552	AAGGTC	2	12	74637	74648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	423262617
34	NC_019552	CTTTGT	2	12	78364	78375	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	423262620
35	NC_019552	TCTAAA	2	12	78531	78542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262620
36	NC_019552	TCAAGT	2	12	78756	78767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423262620
37	NC_019552	GAAAAT	2	12	79521	79532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262621
38	NC_019552	AATTAA	2	12	80123	80134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423262622
39	NC_019552	AAAGAA	2	12	81787	81798	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262622
40	NC_019552	AAGCAA	2	12	82468	82479	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	423262623
41	NC_019552	TGAAAA	2	12	85400	85411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262624
42	NC_019552	TTTTAA	2	12	87960	87971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423262626
43	NC_019552	AAAAAC	2	12	91096	91107	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	423262630
44	NC_019552	TAAAAA	2	12	91541	91552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	423262630
45	NC_019552	TGAAAA	2	12	92815	92826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262633
46	NC_019552	ACAGAT	2	12	94043	94054	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423262633
47	NC_019552	AAAGAA	2	12	95601	95612	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262635
48	NC_019552	TAGGAA	2	12	96364	96375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423262636
49	NC_019552	GAAATG	2	12	97321	97332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423262636
50	NC_019552	TTTTAT	2	12	97785	97796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	423262637
51	NC_019552	CAAAAT	2	12	98352	98363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423262637
52	NC_019552	TTAAAT	2	12	98371	98382	50 %	50 %	0 %	0 %	423262637
53	NC_019552	ATTCAA	2	12	98657	98668	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262637
54	NC_019552	CAAAAA	2	12	99241	99252	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	423262637
55	NC_019552	TGCAGA	2	12	101567	101578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	423262639
56	NC_019552	ACAGCT	2	12	104979	104990	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	423262645
57	NC_019552	TAAAGA	2	12	105457	105468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262645
58	NC_019552	CAAAAA	2	12	107313	107324	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	423262649
59	NC_019552	CCAAAT	2	12	107964	107975	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	423262648
60	NC_019552	TCAAAA	2	12	108489	108500	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423262650
61	NC_019552	TAAAAT	2	12	108912	108923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423262651
62	NC_019552	TACAAA	2	12	109390	109401	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423262651
63	NC_019552	TTGGAG	2	12	109994	110005	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423262651
64	NC_019552	TAAAAG	2	12	112765	112776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262655
65	NC_019552	AGACAA	2	12	113350	113361	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	423262656
66	NC_019552	ATTCAA	2	12	114642	114653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262656
67	NC_019552	TTAATA	2	12	115116	115127	50 %	50 %	0 %	0 %	423262658
68	NC_019552	TTGTTA	2	12	116263	116274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423262659
69	NC_019552	ATTGAC	2	12	116835	116846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423262659
70	NC_019552	ATTACA	2	12	118374	118385	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262661
71	NC_019552	AAGGAA	2	12	121358	121369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423262665
72	NC_019552	CTCTTT	2	12	122577	122588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	423262666
73	NC_019552	AAAGAA	2	12	123848	123859	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262667
74	NC_019552	TTTTGA	2	12	128959	128970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423262674
75	NC_019552	TTTTGT	2	12	129473	129484	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	423262675
76	NC_019552	AAGAAA	2	12	131087	131098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262676
77	NC_019552	ATAATT	2	12	131342	131353	50 %	50 %	0 %	0 %	423262676
78	NC_019552	TTCATA	2	12	133835	133846	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423262678
79	NC_019552	TTAAAA	2	12	134413	134424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423262679
80	NC_019552	CTTCAT	2	12	136756	136767	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	423262679
81	NC_019552	TAAAAA	2	12	137850	137861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	423262681
82	NC_019552	AGAATT	2	12	141074	141085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423262684
83	NC_019552	AAATAG	2	12	142714	142725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262686
84	NC_019552	CAAAAT	2	12	143324	143335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423262686
85	NC_019552	ATAAAG	2	12	143765	143776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262687
86	NC_019552	GTTTTT	2	12	149158	149169	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	423262693
87	NC_019552	ATTGAA	2	12	153843	153854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423262696
88	NC_019552	AAAAGA	2	12	154676	154687	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262696
89	NC_019552	TTTTGT	2	12	154691	154702	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	423262696
90	NC_019552	GTTACT	2	12	156681	156692	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423262697
91	NC_019552	TGAAAA	2	12	163332	163343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262705
92	NC_019552	AAAAAC	2	12	165285	165296	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	423262709
93	NC_019552	AACTAA	2	12	166636	166647	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423262709
94	NC_019552	ATAGCA	2	12	169353	169364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423262712
95	NC_019552	TTGCAT	2	12	170017	170028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423262713
96	NC_019552	AAATTC	2	12	172613	172624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262716
97	NC_019552	GAAGGA	2	12	173128	173139	50 %	0 %	50 %	0 %	423262717
98	NC_019552	TCCAAA	2	12	173349	173360	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	423262717
99	NC_019552	ATTTTT	2	12	178552	178563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	423262720
100	NC_019552	TGAAAA	2	12	179651	179662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262720
101	NC_019552	TTTATT	2	12	181944	181955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	423262723
102	NC_019552	GTTTGA	2	12	182309	182320	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	423262723
103	NC_019552	AACAAT	2	12	184411	184422	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423262724
104	NC_019552	ACAAAA	2	12	188733	188744	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	423262727
105	NC_019552	AAGAAA	2	12	190416	190427	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423262727
106	NC_019552	ACACAA	2	12	193025	193036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423262727
107	NC_019552	AGTTGA	2	12	193192	193203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423262727
108	NC_019552	CAAGAA	2	12	193775	193786	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	423262727
109	NC_019552	ATTGAT	2	12	193826	193837	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423262727
110	NC_019552	CAAACA	2	12	193997	194008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423262727
111	NC_019552	AAATGA	2	12	194266	194277	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262727
112	NC_019552	TTACTA	2	12	194499	194510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423262727
113	NC_019552	CTAATT	2	12	194715	194726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423262727
114	NC_019552	AAAAGT	2	12	194941	194952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423262727
115	NC_019552	ACTAAT	2	12	196097	196108	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262727
116	NC_019552	TAAAAT	2	12	196233	196244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423262727
117	NC_019552	AAACCA	2	12	199577	199588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423262728
118	NC_019552	CAAAAA	2	12	200737	200748	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	423262728
119	NC_019552	TACTTT	2	12	202152	202163	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423262728
120	NC_019552	TCTAAA	2	12	204697	204708	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262728
121	NC_019552	CAAATG	2	12	205301	205312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423262728
122	NC_019552	TAAAAT	2	12	206282	206293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423262728
123	NC_019552	ATGATT	2	12	208145	208156	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423262728
124	NC_019552	AATCAT	2	12	209569	209580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423262729
125	NC_019552	ATTTTG	2	12	209822	209833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423262729
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127	NC_019552	AATTAG	2	12	211584	211595	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423262730
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135	NC_019552	TTAATA	2	12	230264	230275	50 %	50 %	0 %	0 %	423262748
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226	NC_019552	AAATTT	2	12	380181	380192	50 %	50 %	0 %	0 %	423262877
227	NC_019552	AAAATC	2	12	381960	381971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423262878
228	NC_019552	GCTGCA	2	12	382156	382167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	423262878
229	NC_019552	CTAAAG	2	12	383452	383463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423262880
230	NC_019552	TTTTTC	2	12	386152	386163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	423262881
231	NC_019552	TGGTTG	2	12	386182	386193	0 %	50 %	50 %	0 %	423262881
232	NC_019552	GAAAAG	2	12	389523	389534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423262883
233	NC_019552	TTCAGG	2	12	389872	389883	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	423262883
234	NC_019552	AGAAGC	2	12	389893	389904	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	423262883
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236	NC_019552	TTATAT	2	12	393905	393916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423262888
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241	NC_019552	TTAATA	2	12	408672	408683	50 %	50 %	0 %	0 %	423262902
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348	NC_019552	TTTTAT	2	12	545554	545565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	423263036
349	NC_019552	TTCAAC	2	12	546989	547000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423263036
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351	NC_019552	TATTCC	2	12	547532	547543	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	423263036
352	NC_019552	CAATAT	2	12	547774	547785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423263036
353	NC_019552	TAAAAT	2	12	549259	549270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423263037
354	NC_019552	TTTCAA	2	12	549777	549788	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423263037
355	NC_019552	AAGAAA	2	12	550472	550483	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423263038
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440	NC_019552	TTTCTG	2	12	655780	655791	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	423263141
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449	NC_019552	CTTTAC	2	12	669467	669478	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	423263152
450	NC_019552	TGGTTT	2	12	670040	670051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	423263152
451	NC_019552	CAAAAA	2	12	671138	671149	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	423263153
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453	NC_019552	AATGAT	2	12	673207	673218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423263154
454	NC_019552	CAAAAT	2	12	678329	678340	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423263158
455	NC_019552	TCATTA	2	12	679768	679779	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423263158
456	NC_019552	ACCTGA	2	12	683768	683779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	423263165
457	NC_019552	GAAATT	2	12	685846	685857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423263169
458	NC_019552	ATTACA	2	12	687136	687147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423263170
459	NC_019552	AACTTC	2	12	688103	688114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423263171
460	NC_019552	GTGGAT	2	12	689113	689124	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423263172
461	NC_019552	ATCAAA	2	12	689134	689145	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423263172
462	NC_019552	TTTTCT	2	12	689339	689350	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	423263172
463	NC_019552	CGATTT	2	12	689613	689624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423263172
464	NC_019552	TACCTG	2	12	690036	690047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	423263172
465	NC_019552	TAAAGA	2	12	691593	691604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423263173
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467	NC_019552	TAAGAT	2	12	692447	692458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423263174
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