MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis SK76 chromosome

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019552	ATAAA	2	10	1332	1341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019552	AAATA	2	10	7014	7023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019552	GAAAC	2	10	18196	18205	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019552	AAAAC	2	10	18241	18250	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019552	ACCTA	2	10	18381	18390	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019552	TCGTG	2	10	19325	19334	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019552	TTAAG	2	10	19389	19398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019552	GCTAC	2	10	19614	19623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019552	TAAAT	2	10	19964	19973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019552	GAAAA	2	10	20272	20281	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019552	AAATT	2	10	23074	23083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019552	TAATT	2	10	25654	25663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019552	ATTAA	2	10	32593	32602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019552	AGATT	2	10	35838	35847	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019552	ATCAA	2	10	36121	36130	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019552	TTTTA	2	10	42492	42501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019552	TAAAA	2	10	56821	56830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019552	ATTTA	2	10	58456	58465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019552	ATTTA	2	10	58559	58568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019552	AAAAG	2	10	58738	58747	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019552	TTTAA	2	10	65087	65096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019552	AATTT	2	10	65771	65780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019552	ATTTT	2	10	77130	77139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019552	ATTTT	2	10	94084	94093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019552	TATAA	2	10	102809	102818	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019552	CTTAC	2	10	104850	104859	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019552	ATTAA	2	10	118520	118529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019552	ATTAT	2	10	134191	134200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019552	TTTAA	2	10	136922	136931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019552	TAATA	2	10	138892	138901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019552	CATTT	2	10	146806	146815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019552	TTATT	2	10	150546	150555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019552	ATTAA	2	10	150556	150565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019552	ATATA	2	10	151035	151044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019552	TTGAA	2	10	161083	161092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019552	TTTAA	2	10	164891	164900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019552	ATATA	2	10	180283	180292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019552	ATTTA	2	10	208697	208706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019552	AATCA	2	10	208968	208977	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019552	AACTA	2	10	210839	210848	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019552	ATTTT	2	10	210904	210913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019552	AATTA	2	10	210974	210983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019552	ACTAA	2	10	215667	215676	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019552	ATTAA	2	10	217076	217085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019552	CTTTC	2	10	222737	222746	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_019552	AAAAG	2	10	229337	229346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019552	TTGTA	2	10	229353	229362	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019552	TAAAT	2	10	229416	229425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019552	ATTAA	2	10	229446	229455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019552	ATTTT	2	10	232537	232546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019552	TTAGT	2	10	264815	264824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019552	AAATT	2	10	270130	270139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019552	ATTTT	2	10	271286	271295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019552	TTTTA	2	10	289900	289909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019552	CAAAT	2	10	289964	289973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019552	TAAAA	2	10	293051	293060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019552	AATTT	2	10	313446	313455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019552	AAAAT	2	10	314240	314249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019552	TTTAT	2	10	326143	326152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019552	ATTTT	2	10	334572	334581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019552	TAAAA	2	10	342927	342936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019552	CAATT	2	10	354605	354614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019552	AATTA	2	10	354619	354628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019552	ATTAA	2	10	358757	358766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019552	ATTTT	2	10	373337	373346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019552	TAAAA	2	10	374233	374242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019552	ATTTT	2	10	380141	380150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019552	GAAAA	2	10	401492	401501	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019552	TTTTA	2	10	403236	403245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019552	ATAAA	2	10	403433	403442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019552	ATTTT	2	10	404880	404889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019552	TAATA	2	10	420577	420586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019552	AAACC	2	10	434237	434246	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_019552	TTTTA	2	10	434547	434556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019552	TTTTA	2	10	435448	435457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019552	TTTTA	2	10	436514	436523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019552	TTTTA	2	10	438962	438971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019552	TCACC	2	10	443219	443228	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_019552	AATTA	2	10	474710	474719	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019552	ATTAG	2	10	474762	474771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019552	TAATT	2	10	475584	475593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019552	TAAAA	2	10	477922	477931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019552	TTTGT	2	10	494995	495004	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019552	GGATT	2	10	506143	506152	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019552	TTTTG	2	10	512732	512741	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019552	TAAAA	2	10	518864	518873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019552	TAAAA	2	10	520265	520274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019552	TAAAT	2	10	529342	529351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019552	CTTTC	2	10	545504	545513	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019552	ATAAA	2	10	554816	554825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019552	TTGAA	2	10	557464	557473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019552	TGAAA	2	10	558895	558904	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019552	ATAAA	2	10	562789	562798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019552	AACAA	2	10	582275	582284	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019552	AACTG	2	10	583053	583062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_019552	TAAAA	2	10	583147	583156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019552	TAAAT	2	10	585281	585290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019552	AAAAT	2	10	592677	592686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019552	AAAAG	2	10	616521	616530	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019552	AAAAT	2	10	635199	635208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019552	CAAAA	2	10	636750	636759	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019552	AATTT	2	10	636981	636990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019552	AAAAT	2	10	645047	645056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019552	TTTCC	2	10	649625	649634	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_019552	TAAAA	2	10	649656	649665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019552	ATTTT	2	10	655455	655464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019552	GTTTT	2	10	659765	659774	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019552	ATTAT	2	10	666466	666475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019552	ATTTT	2	10	680037	680046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019552	TAATT	2	10	680153	680162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019552	AATTA	2	10	682048	682057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019552	TTGTT	2	10	685447	685456	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019552	TTAAT	2	10	688603	688612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019552	TTAAT	2	10	695604	695613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019552	TTTTA	2	10	699104	699113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019552	AAAAT	2	10	699147	699156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019552	TTAAT	2	10	699392	699401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019552	TAAAA	2	10	699521	699530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019552	TTATT	2	10	699719	699728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019552	TTATT	2	10	702071	702080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019552	TTATT	2	10	702259	702268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019552	AATAA	2	10	746088	746097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019552	GTGTG	2	10	748616	748625	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019552	TACAA	2	10	749670	749679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019552	TTTTA	2	10	750045	750054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019552	ATTAT	2	10	755125	755134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019552	ATAAA	2	10	763328	763337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019552	TAAAT	2	10	767300	767309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019552	AAGAA	2	10	773928	773937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019552	AAAAT	2	10	776365	776374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019552	CAAAA	2	10	785367	785376	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019552	AACAC	2	10	789030	789039	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019552	TATAT	2	10	795604	795613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019552	ATTTT	2	10	795807	795816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019552	AAAAT	2	10	800425	800434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019552	AAAAT	2	10	816143	816152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019552	ACTAA	2	10	816255	816264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019552	TAAAA	2	10	820541	820550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019552	AGTTG	2	10	829412	829421	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019552	AAGAA	2	10	834154	834163	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.