MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis SK76 chromosome

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019552	TAAT	2	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019552	CAAA	2	8	6988	6995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019552	TTTG	2	8	7004	7011	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019552	ATTT	2	8	9375	9382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019552	CGCT	2	8	18303	18310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019552	CATG	2	8	18323	18330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019552	TTAT	2	8	18441	18448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019552	TTAG	2	8	18509	18516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019552	TAAG	2	8	20063	20070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019552	GCGA	2	8	20306	20313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019552	GAAC	2	8	21697	21704	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019552	GCGA	2	8	21732	21739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019552	ATCT	2	8	38684	38691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019552	AGAA	2	8	41277	41284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019552	TCCC	2	8	42436	42443	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_019552	TGCT	2	8	42566	42573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019552	AAAT	2	8	58439	58446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019552	ATTA	2	8	58643	58650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019552	ATAC	2	8	59280	59287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019552	AAAC	2	8	59318	59325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019552	ACTT	2	8	59364	59371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019552	AATT	2	8	59403	59410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019552	ATTA	2	8	64803	64810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019552	ATAA	2	8	64892	64899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019552	TTTA	2	8	65878	65885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019552	AATA	2	8	65923	65930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019552	ATAA	2	8	91580	91587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019552	CAAA	2	8	91598	91605	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019552	ATAG	2	8	101784	101791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019552	TAAA	2	8	104629	104636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019552	ACAA	2	8	105493	105500	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019552	TTTA	2	8	105591	105598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019552	TAAA	2	8	105717	105724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019552	CAAA	2	8	115023	115030	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019552	CAAA	2	8	116970	116977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019552	TAAA	2	8	145767	145774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019552	ATTA	2	8	145820	145827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019552	ATAA	2	8	146984	146991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019552	TCTT	2	8	147046	147053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019552	GTTT	2	8	151085	151092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019552	TTAA	2	8	160661	160668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019552	ATTT	2	8	160786	160793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019552	TTTC	2	8	164553	164560	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019552	TTTG	2	8	167754	167761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019552	AATT	2	8	169774	169781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019552	ATTA	2	8	170302	170309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019552	ATTT	2	8	170318	170325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019552	CAAA	2	8	170361	170368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019552	ATAA	2	8	180006	180013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019552	CTGT	2	8	180122	180129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019552	AATA	2	8	180328	180335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019552	TATT	2	8	184900	184907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019552	GTTT	3	12	186551	186562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019552	TATT	2	8	208477	208484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019552	ATAG	2	8	208562	208569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019552	CATA	2	8	208612	208619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019552	CATA	2	8	208629	208636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019552	ACAT	2	8	208870	208877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019552	TAAA	2	8	209086	209093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019552	TCTT	2	8	209117	209124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019552	TAAA	3	12	209236	209247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019552	TAAA	2	8	210717	210724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019552	ATTA	2	8	210738	210745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019552	ATTT	2	8	210784	210791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019552	ATTA	2	8	210794	210801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019552	TTAA	3	12	211124	211135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019552	ATTT	2	8	211293	211300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019552	TTAA	2	8	211386	211393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019552	AATT	2	8	217046	217053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019552	TAAA	2	8	217103	217110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019552	AAAT	2	8	229288	229295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019552	ATTT	3	12	229323	229334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019552	ATTT	2	8	232454	232461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019552	CTTT	2	8	232463	232470	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019552	TGTT	2	8	232554	232561	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019552	TAAT	2	8	244814	244821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019552	GAAT	2	8	244831	244838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019552	CATT	2	8	244862	244869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019552	AATA	2	8	244903	244910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019552	CTTT	2	8	264777	264784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019552	CAAA	2	8	270095	270102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019552	ATTT	2	8	271400	271407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019552	TTAA	2	8	274606	274613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019552	TAAA	2	8	277389	277396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019552	TAAA	2	8	279425	279432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019552	CTTT	2	8	279542	279549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019552	TAAA	2	8	293100	293107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019552	CTTG	2	8	295591	295598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019552	AATT	2	8	295769	295776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019552	CTTT	2	8	299558	299565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019552	TTTA	2	8	299566	299573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019552	AAAT	2	8	302054	302061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019552	AATG	2	8	304588	304595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019552	AAGA	2	8	311070	311077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019552	AAAT	2	8	311135	311142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019552	ACAA	2	8	312625	312632	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019552	TTAA	2	8	313420	313427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019552	AGGT	2	8	313822	313829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019552	TGTT	2	8	314108	314115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019552	ATAA	2	8	314207	314214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019552	GATT	2	8	323745	323752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019552	ATTA	2	8	324881	324888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019552	AGTT	2	8	326179	326186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019552	TGTT	2	8	328550	328557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019552	AATT	2	8	336527	336534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019552	GTTT	2	8	340337	340344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019552	TTTA	2	8	348289	348296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019552	ATTT	2	8	349678	349685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019552	AAAT	2	8	351612	351619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019552	TAAA	2	8	351650	351657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019552	AAAG	2	8	351664	351671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019552	TATT	2	8	352260	352267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019552	ATTA	2	8	352751	352758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019552	TTTA	2	8	352807	352814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019552	TGTT	2	8	352822	352829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019552	TTTA	2	8	354682	354689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019552	TTTA	2	8	358814	358821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019552	TAAA	2	8	358828	358835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019552	AATT	2	8	364849	364856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019552	TTTA	2	8	370126	370133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019552	TTAA	2	8	373347	373354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019552	TATT	2	8	374245	374252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019552	CTTA	2	8	374426	374433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019552	AAAG	2	8	374518	374525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019552	ATTT	2	8	374562	374569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019552	TAAA	2	8	389036	389043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019552	ATTT	3	12	389183	389194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019552	AAAT	2	8	399661	399668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019552	ACAT	2	8	401427	401434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019552	AATG	2	8	401526	401533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019552	TCAA	2	8	401541	401548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019552	ATTA	2	8	403109	403116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019552	ATTT	2	8	403388	403395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019552	CAAA	2	8	403476	403483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019552	AAAG	2	8	419264	419271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019552	CAAA	2	8	420519	420526	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019552	TGAA	2	8	427800	427807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019552	TTTC	2	8	428384	428391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019552	AATT	2	8	428487	428494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019552	AATA	2	8	429054	429061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019552	ATTA	2	8	429579	429586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019552	ATTA	2	8	434058	434065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019552	ATTA	2	8	434076	434083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019552	ATAA	2	8	434089	434096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019552	AAAT	4	16	434167	434182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019552	TTAG	2	8	434268	434275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019552	TAAA	2	8	434561	434568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019552	TAAA	2	8	435223	435230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019552	TTAA	2	8	435268	435275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019552	TAAA	2	8	435462	435469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019552	AATT	2	8	436234	436241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019552	TAAA	2	8	436528	436535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_019552	CATT	2	8	763367	763374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
303	NC_019552	TAAT	2	8	763383	763390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_019552	TAAT	2	8	767155	767162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.