MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019551	CAAGAT	2	12	995	1006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422937996
2	NC_019551	TAAGAG	2	12	7243	7254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422937998
3	NC_019551	TGGTTT	2	12	7675	7686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422937998
4	NC_019551	TAAAGG	2	12	9018	9029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422938000
5	NC_019551	GTTGAT	2	12	10107	10118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	422938002
6	NC_019551	ATTAAG	2	12	14768	14779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938006
7	NC_019551	TCTAGT	2	12	27119	27130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938011
8	NC_019551	CTAAAA	2	12	30679	30690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	422938012
9	NC_019551	TGGTGA	2	12	32665	32676	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	422938014
10	NC_019551	ACCAAT	2	12	32701	32712	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	422938014
11	NC_019551	TAAATT	2	12	41827	41838	50 %	50 %	0 %	0 %	422938022
12	NC_019551	TACCAG	2	12	45581	45592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	422938024
13	NC_019551	TAAAAA	2	12	56400	56411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	422938028
14	NC_019551	TTATGT	2	12	58162	58173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	422938030
15	NC_019551	AAGGAT	2	12	58704	58715	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422938030
16	NC_019551	GTTATT	2	12	63199	63210	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	422938033
17	NC_019551	ATCTTT	2	12	80660	80671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	422938046
18	NC_019551	TATGAA	2	12	81775	81786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938047
19	NC_019551	TGCAAA	2	12	86458	86469	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422938052
20	NC_019551	TCAAAA	2	12	87499	87510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	422938053
21	NC_019551	CAGCTT	2	12	88112	88123	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	422938053
22	NC_019551	CTTTCT	2	12	90618	90629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422938054
23	NC_019551	ATATAG	2	12	91770	91781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938054
24	NC_019551	AATATC	2	12	95732	95743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938058
25	NC_019551	GTGATT	2	12	95968	95979	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	422938058
26	NC_019551	TCCAGC	2	12	97692	97703	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	422938059
27	NC_019551	TTTTGA	2	12	103067	103078	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	422938063
28	NC_019551	TTTATC	2	12	103539	103550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	422938064
29	NC_019551	TAGTAT	2	12	105418	105429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	422938065
30	NC_019551	TCATTA	2	12	105961	105972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	422938066
31	NC_019551	GATAAG	2	12	107809	107820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422938068
32	NC_019551	ATTAAA	2	12	107974	107985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938068
33	NC_019551	CATTTG	2	12	109643	109654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938068
34	NC_019551	CTATTT	2	12	110465	110476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	422938068
35	NC_019551	CTTTCA	2	12	112637	112648	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	422938070
36	NC_019551	TCATTA	3	18	113879	113896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	422938071
37	NC_019551	TTTATA	2	12	117540	117551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938074
38	NC_019551	TTTATA	2	12	123741	123752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938078
39	NC_019551	ATCAAT	2	12	134616	134627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938080
40	NC_019551	AATACC	2	12	139441	139452	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	422938081
41	NC_019551	CTGATA	2	12	139707	139718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938081
42	NC_019551	TTGAGA	2	12	144320	144331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938083
43	NC_019551	TTAGGC	2	12	145177	145188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	422938083
44	NC_019551	TATTTT	2	12	148415	148426	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	422938086
45	NC_019551	TAAGTA	2	12	149359	149370	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938087
46	NC_019551	GATCTA	2	12	153327	153338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938091
47	NC_019551	AAATAT	2	12	156203	156214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938092
48	NC_019551	ACAGGT	2	12	158380	158391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	422938095
49	NC_019551	GCCATT	2	12	160839	160850	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	422938097
50	NC_019551	ACTGTT	2	12	162242	162253	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938098
51	NC_019551	ATCAAT	2	12	165501	165512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938100
52	NC_019551	AAACTT	2	12	165906	165917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938101
53	NC_019551	TATCAA	2	12	172609	172620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938104
54	NC_019551	AATTAT	2	12	172873	172884	50 %	50 %	0 %	0 %	422938104
55	NC_019551	GCTTTG	2	12	177114	177125	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	422938109
56	NC_019551	TAAAAA	2	12	178955	178966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	422938113
57	NC_019551	TAGCTT	2	12	179629	179640	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938114
58	NC_019551	CCAGCT	2	12	180461	180472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	422938114
59	NC_019551	GACAAA	2	12	180992	181003	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	422938115
60	NC_019551	CAAATT	2	12	190043	190054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938123
61	NC_019551	TTTTAT	2	12	190728	190739	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	422938124
62	NC_019551	TTAAGT	2	12	191469	191480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	422938124
63	NC_019551	ATTATA	2	12	196740	196751	50 %	50 %	0 %	0 %	422938129
64	NC_019551	CACCAA	2	12	198514	198525	50 %	0 %	0 %	50 %	422938131
65	NC_019551	ACTAGT	2	12	205848	205859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938140
66	NC_019551	AAGATG	2	12	210382	210393	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422938144
67	NC_019551	TACTGC	2	12	210998	211009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	422938144
68	NC_019551	TTTAGC	2	12	211196	211207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938144
69	NC_019551	ATTAGT	2	12	211799	211810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	422938144
70	NC_019551	ATAAGT	2	12	212884	212895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938146
71	NC_019551	TAGCTT	2	12	215804	215815	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938148
72	NC_019551	CATCAC	2	12	219063	219074	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	422938151
73	NC_019551	TTTTGA	2	12	219076	219087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	422938151
74	NC_019551	ATTTTT	2	12	224414	224425	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	422938153
75	NC_019551	TGAAGC	2	12	225376	225387	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	422938154
76	NC_019551	AAAGAA	2	12	226481	226492	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	422938155
77	NC_019551	AAAAGA	2	12	227964	227975	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	422938157
78	NC_019551	TGGTGT	2	12	228993	229004	0 %	50 %	50 %	0 %	422938159
79	NC_019551	GTTTTT	2	12	229693	229704	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	422938159
80	NC_019551	TGAAGT	2	12	231484	231495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938163
81	NC_019551	GCAAGA	2	12	231960	231971	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	422938164
82	NC_019551	CTGTTG	2	12	233042	233053	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	422938164
83	NC_019551	AGGTTG	2	12	233651	233662	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	422938164
84	NC_019551	AAGGGT	2	12	234697	234708	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	422938166
85	NC_019551	GTAAAG	2	12	238365	238376	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422938173
86	NC_019551	TGGGTG	2	12	239915	239926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422938178
87	NC_019551	TTGGTG	2	12	241044	241055	0 %	50 %	50 %	0 %	422938180
88	NC_019551	GGTATG	2	12	253441	253452	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	422938194
89	NC_019551	TGATAA	2	12	260375	260386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938197
90	NC_019551	AAATGC	2	12	261072	261083	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422938198
91	NC_019551	CATTAG	2	12	261509	261520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938199
92	NC_019551	CTAAAG	2	12	262338	262349	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422938200
93	NC_019551	ATAACA	2	12	262910	262921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	422938201
94	NC_019551	TTTATG	2	12	264670	264681	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	422938202
95	NC_019551	TGGTGA	2	12	266827	266838	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	422938205
96	NC_019551	GCTTTA	2	12	268882	268893	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938207
97	NC_019551	TTGCCT	2	12	275114	275125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	422938214
98	NC_019551	TCTTGT	2	12	280553	280564	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	422938218
99	NC_019551	ATCTAA	2	12	285281	285292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938222
100	NC_019551	GCTAAA	2	12	285837	285848	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422938222
101	NC_019551	ATGGTA	2	12	296315	296326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938230
102	NC_019551	TGCTGG	2	12	296355	296366	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	422938230
103	NC_019551	GTTGAG	2	12	298425	298436	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	422938231
104	NC_019551	AGTGGT	2	12	299046	299057	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	422938231
105	NC_019551	CATTAT	2	12	299689	299700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	422938231
106	NC_019551	TGAGAC	2	12	300885	300896	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	422938232
107	NC_019551	ACATCC	2	12	301125	301136	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	422938232
108	NC_019551	TTGGTT	2	12	310815	310826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422938240
109	NC_019551	TATCTT	2	12	311517	311528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	422938240
110	NC_019551	CTCTAA	2	12	312915	312926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938242
111	NC_019551	AAGCAA	2	12	317070	317081	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	422938249
112	NC_019551	TAGCTT	2	12	326088	326099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938252
113	NC_019551	CTTGAT	2	12	334331	334342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938256
114	NC_019551	TAAAAC	2	12	345475	345486	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	422938263
115	NC_019551	TTAAGA	2	12	345766	345777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938263
116	NC_019551	TCAAGC	2	12	347522	347533	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	422938265
117	NC_019551	ATCAAT	2	12	347716	347727	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938265
118	NC_019551	TGATCG	2	12	347997	348008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	422938266
119	NC_019551	TTCACT	2	12	348564	348575	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	422938266
120	NC_019551	GTTTTT	2	12	350660	350671	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	422938269
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122	NC_019551	AGCTAT	2	12	369908	369919	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938284
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217	NC_019551	CTTGTA	2	12	646588	646599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938490
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220	NC_019551	ATAAGC	2	12	652740	652751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422938494
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223	NC_019551	ACAAGC	2	12	656480	656491	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	422938497
224	NC_019551	TTGCCG	2	12	664475	664486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938503
225	NC_019551	AATGTA	2	12	668517	668528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938505
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228	NC_019551	CCCAAG	2	12	674902	674913	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	422938510
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232	NC_019551	AGCAAT	2	12	683340	683351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	422938516
233	NC_019551	TAAAAT	2	12	683753	683764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938516
234	NC_019551	ATTAAC	2	12	686909	686920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422938521
235	NC_019551	AACATA	2	12	694851	694862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	422938527
236	NC_019551	CATGTT	2	12	695429	695440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938527
237	NC_019551	CTTTTT	2	12	700410	700421	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	422938531
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239	NC_019551	AGATTT	2	12	701801	701812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	422938532
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243	NC_019551	ATGTTG	2	12	722273	722284	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	422938550
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323	NC_019551	AGCTAC	2	12	976844	976855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	422938748
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325	NC_019551	TACGAT	2	12	978710	978721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938751
326	NC_019551	GTTAAA	2	12	981800	981811	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	422938754
327	NC_019551	CTTTAG	2	12	982114	982125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938754
328	NC_019551	TATCAG	2	12	983113	983124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938755
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331	NC_019551	GGCATA	2	12	1004494	1004505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	422938776
332	NC_019551	TTATAC	2	12	1007206	1007217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	422938779
333	NC_019551	TGGTAT	2	12	1009082	1009093	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	422938780
334	NC_019551	TCTATT	2	12	1016073	1016084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	422938784
335	NC_019551	GATTTT	2	12	1025473	1025484	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	422938793
336	NC_019551	TCCTGG	2	12	1026631	1026642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938793
337	NC_019551	TTAGCT	2	12	1030164	1030175	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938797
338	NC_019551	TGATAT	2	12	1030900	1030911	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	422938798
339	NC_019551	TTGCTT	2	12	1033844	1033855	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	422938801
340	NC_019551	TTTGTG	2	12	1040746	1040757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422938804
341	NC_019551	CTGATG	2	12	1043692	1043703	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	422938806
342	NC_019551	GTCATA	2	12	1044301	1044312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938806
343	NC_019551	TATTTT	2	12	1048855	1048866	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	422938810
344	NC_019551	ATCAGT	2	12	1051224	1051235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	422938812
345	NC_019551	TTTAAA	2	12	1053271	1053282	50 %	50 %	0 %	0 %	422938813
346	NC_019551	GCAGGT	2	12	1062814	1062825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	422938819
347	NC_019551	TTTTGA	2	12	1063284	1063295	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	422938819
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453	NC_019551	TTTAGT	2	12	1354036	1354047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	422939044
454	NC_019551	GTTGCT	2	12	1354456	1354467	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	422939045
455	NC_019551	AAAATA	2	12	1356540	1356551	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	422939047
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457	NC_019551	ATAACT	2	12	1360456	1360467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	422939051
458	NC_019551	ATATGG	2	12	1362477	1362488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422939052
459	NC_019551	ATTTTC	2	12	1362757	1362768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	422939052
460	NC_019551	AAAATC	2	12	1363620	1363631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	422939053
461	NC_019551	TGGCAT	2	12	1367325	1367336	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	422939057
462	NC_019551	CATCAA	2	12	1369173	1369184	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	422939059
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481	NC_019551	TAGTGA	2	12	1415802	1415813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422939090
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