MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019551	AAGAA	2	10	1455	1464	80 %	0 %	20 %	0 %	422937996
2	NC_019551	CAACA	2	10	7198	7207	60 %	0 %	0 %	40 %	422937998
3	NC_019551	TGTTT	2	10	8906	8915	0 %	80 %	20 %	0 %	422938000
4	NC_019551	CAAGA	2	10	11886	11895	60 %	0 %	20 %	20 %	422938004
5	NC_019551	TTGAT	2	10	14214	14223	20 %	60 %	20 %	0 %	422938006
6	NC_019551	ACGCA	2	10	20048	20057	40 %	0 %	20 %	40 %	422938008
7	NC_019551	TTGAA	2	10	20137	20146	40 %	40 %	20 %	0 %	422938008
8	NC_019551	GCAAA	2	10	20652	20661	60 %	0 %	20 %	20 %	422938008
9	NC_019551	ATTTT	2	10	23297	23306	20 %	80 %	0 %	0 %	422938009
10	NC_019551	ATATC	2	10	23369	23378	40 %	40 %	0 %	20 %	422938009
11	NC_019551	ATTTT	2	10	23464	23473	20 %	80 %	0 %	0 %	422938009
12	NC_019551	AGATA	2	10	23608	23617	60 %	20 %	20 %	0 %	422938009
13	NC_019551	ATTTG	2	10	26422	26431	20 %	60 %	20 %	0 %	422938011
14	NC_019551	AAAGA	2	10	27140	27149	80 %	0 %	20 %	0 %	422938011
15	NC_019551	CATTT	2	10	28784	28793	20 %	60 %	0 %	20 %	422938012
16	NC_019551	ATAGT	2	10	31114	31123	40 %	40 %	20 %	0 %	422938013
17	NC_019551	AAAAT	2	10	33355	33364	80 %	20 %	0 %	0 %	422938014
18	NC_019551	GTTTA	2	10	34046	34055	20 %	60 %	20 %	0 %	422938015
19	NC_019551	TCAAA	2	10	34300	34309	60 %	20 %	0 %	20 %	422938016
20	NC_019551	GAAAA	2	10	36131	36140	80 %	0 %	20 %	0 %	422938017
21	NC_019551	CTTGT	2	10	36204	36213	0 %	60 %	20 %	20 %	422938017
22	NC_019551	AAACA	2	10	36309	36318	80 %	0 %	0 %	20 %	422938017
23	NC_019551	AAATA	2	10	36417	36426	80 %	20 %	0 %	0 %	422938017
24	NC_019551	TTGAT	2	10	38393	38402	20 %	60 %	20 %	0 %	422938018
25	NC_019551	TACAA	2	10	39233	39242	60 %	20 %	0 %	20 %	422938019
26	NC_019551	CTAAC	2	10	39707	39716	40 %	20 %	0 %	40 %	422938020
27	NC_019551	TTTTA	2	10	40281	40290	20 %	80 %	0 %	0 %	422938020
28	NC_019551	TAATA	2	10	40962	40971	60 %	40 %	0 %	0 %	422938021
29	NC_019551	AGTTT	2	10	46223	46232	20 %	60 %	20 %	0 %	422938024
30	NC_019551	TAATA	2	10	56548	56557	60 %	40 %	0 %	0 %	422938028
31	NC_019551	TTATT	2	10	57228	57237	20 %	80 %	0 %	0 %	422938029
32	NC_019551	TACTT	2	10	57513	57522	20 %	60 %	0 %	20 %	422938029
33	NC_019551	TTCAA	2	10	60067	60076	40 %	40 %	0 %	20 %	422938032
34	NC_019551	AATTT	2	10	63094	63103	40 %	60 %	0 %	0 %	422938033
35	NC_019551	TTTGT	2	10	63373	63382	0 %	80 %	20 %	0 %	422938033
36	NC_019551	GTTTA	2	10	66862	66871	20 %	60 %	20 %	0 %	422938035
37	NC_019551	TGAAA	2	10	67891	67900	60 %	20 %	20 %	0 %	422938037
38	NC_019551	TTTTA	2	10	74957	74966	20 %	80 %	0 %	0 %	422938044
39	NC_019551	TATTT	2	10	75188	75197	20 %	80 %	0 %	0 %	422938044
40	NC_019551	TTTGT	2	10	81976	81985	0 %	80 %	20 %	0 %	422938047
41	NC_019551	AACTC	2	10	86060	86069	40 %	20 %	0 %	40 %	422938052
42	NC_019551	ATTAC	2	10	91097	91106	40 %	40 %	0 %	20 %	422938054
43	NC_019551	ATGTA	2	10	91639	91648	40 %	40 %	20 %	0 %	422938054
44	NC_019551	AAACT	2	10	93098	93107	60 %	20 %	0 %	20 %	422938055
45	NC_019551	TTTCT	2	10	94034	94043	0 %	80 %	0 %	20 %	422938056
46	NC_019551	CTTTT	2	10	94092	94101	0 %	80 %	0 %	20 %	422938057
47	NC_019551	TAGTA	2	10	96008	96017	40 %	40 %	20 %	0 %	422938058
48	NC_019551	TGAAA	2	10	103199	103208	60 %	20 %	20 %	0 %	422938063
49	NC_019551	GTCGA	2	10	104686	104695	20 %	20 %	40 %	20 %	422938064
50	NC_019551	TAAGT	2	10	105873	105882	40 %	40 %	20 %	0 %	422938066
51	NC_019551	TAAAT	2	10	106365	106374	60 %	40 %	0 %	0 %	422938066
52	NC_019551	TTATA	2	10	106810	106819	40 %	60 %	0 %	0 %	422938067
53	NC_019551	TTTTC	2	10	106824	106833	0 %	80 %	0 %	20 %	422938067
54	NC_019551	TAATA	2	10	108200	108209	60 %	40 %	0 %	0 %	422938068
55	NC_019551	TTTTA	2	10	108537	108546	20 %	80 %	0 %	0 %	422938068
56	NC_019551	GCTTG	2	10	109713	109722	0 %	40 %	40 %	20 %	422938068
57	NC_019551	ATTTT	2	10	110794	110803	20 %	80 %	0 %	0 %	422938068
58	NC_019551	TATAA	2	10	111600	111609	60 %	40 %	0 %	0 %	422938069
59	NC_019551	TATTT	2	10	112204	112213	20 %	80 %	0 %	0 %	422938070
60	NC_019551	ATTAA	2	10	114674	114683	60 %	40 %	0 %	0 %	422938072
61	NC_019551	TCTTT	2	10	115388	115397	0 %	80 %	0 %	20 %	422938072
62	NC_019551	TTCTA	2	10	117302	117311	20 %	60 %	0 %	20 %	422938074
63	NC_019551	TATAA	2	10	117613	117622	60 %	40 %	0 %	0 %	422938074
64	NC_019551	TATTC	2	10	120658	120667	20 %	60 %	0 %	20 %	422938077
65	NC_019551	TTGTT	2	10	123835	123844	0 %	80 %	20 %	0 %	422938078
66	NC_019551	CGTAT	2	10	133670	133679	20 %	40 %	20 %	20 %	422938079
67	NC_019551	CTAGC	2	10	134414	134423	20 %	20 %	20 %	40 %	422938080
68	NC_019551	TTTTC	2	10	135383	135392	0 %	80 %	0 %	20 %	422938080
69	NC_019551	GGGAT	2	10	145687	145696	20 %	20 %	60 %	0 %	422938083
70	NC_019551	TTGAT	2	10	145739	145748	20 %	60 %	20 %	0 %	422938083
71	NC_019551	AAATT	2	10	147744	147753	60 %	40 %	0 %	0 %	422938085
72	NC_019551	TTATT	2	10	149488	149497	20 %	80 %	0 %	0 %	422938087
73	NC_019551	TATTT	2	10	151238	151247	20 %	80 %	0 %	0 %	422938089
74	NC_019551	AGATG	2	10	152504	152513	40 %	20 %	40 %	0 %	422938090
75	NC_019551	ATTGT	2	10	164409	164418	20 %	60 %	20 %	0 %	422938099
76	NC_019551	AGTTT	2	10	168881	168890	20 %	60 %	20 %	0 %	422938102
77	NC_019551	ATCAC	2	10	169190	169199	40 %	20 %	0 %	40 %	422938102
78	NC_019551	ATTTT	2	10	169577	169586	20 %	80 %	0 %	0 %	422938103
79	NC_019551	AACTA	2	10	170254	170263	60 %	20 %	0 %	20 %	422938103
80	NC_019551	AGATA	2	10	170461	170470	60 %	20 %	20 %	0 %	422938103
81	NC_019551	CTTGA	2	10	170979	170988	20 %	40 %	20 %	20 %	422938103
82	NC_019551	CTGTA	2	10	171469	171478	20 %	40 %	20 %	20 %	422938103
83	NC_019551	AATAT	2	10	177321	177330	60 %	40 %	0 %	0 %	422938109
84	NC_019551	CTTTG	2	10	177755	177764	0 %	60 %	20 %	20 %	422938110
85	NC_019551	TCTAG	2	10	177824	177833	20 %	40 %	20 %	20 %	422938110
86	NC_019551	AAAAT	2	10	178264	178273	80 %	20 %	0 %	0 %	422938111
87	NC_019551	GGTTG	2	10	179771	179780	0 %	40 %	60 %	0 %	422938114
88	NC_019551	AAAAG	2	10	181202	181211	80 %	0 %	20 %	0 %	422938115
89	NC_019551	AGCAA	2	10	185483	185492	60 %	0 %	20 %	20 %	422938120
90	NC_019551	TTTAT	2	10	185741	185750	20 %	80 %	0 %	0 %	422938120
91	NC_019551	ATACG	2	10	186305	186314	40 %	20 %	20 %	20 %	422938120
92	NC_019551	TAAAG	2	10	187547	187556	60 %	20 %	20 %	0 %	422938122
93	NC_019551	AGCTA	2	10	187778	187787	40 %	20 %	20 %	20 %	422938122
94	NC_019551	CAAAC	2	10	188329	188338	60 %	0 %	0 %	40 %	422938122
95	NC_019551	TTTGG	2	10	195665	195674	0 %	60 %	40 %	0 %	422938127
96	NC_019551	TTTAT	2	10	201879	201888	20 %	80 %	0 %	0 %	422938135
97	NC_019551	TTGGT	2	10	202636	202645	0 %	60 %	40 %	0 %	422938136
98	NC_019551	AAGCA	2	10	204613	204622	60 %	0 %	20 %	20 %	422938138
99	NC_019551	TTTAT	2	10	207994	208003	20 %	80 %	0 %	0 %	422938142
100	NC_019551	ATCAC	2	10	209421	209430	40 %	20 %	0 %	40 %	422938144
101	NC_019551	AGATA	2	10	210041	210050	60 %	20 %	20 %	0 %	422938144
102	NC_019551	GAAGA	2	10	212197	212206	60 %	0 %	40 %	0 %	422938145
103	NC_019551	TTGGA	2	10	212635	212644	20 %	40 %	40 %	0 %	422938145
104	NC_019551	AAGAA	2	10	213269	213278	80 %	0 %	20 %	0 %	422938146
105	NC_019551	CCATT	2	10	214554	214563	20 %	40 %	0 %	40 %	422938147
106	NC_019551	TAAAT	2	10	215445	215454	60 %	40 %	0 %	0 %	422938148
107	NC_019551	GTAGA	2	10	216672	216681	40 %	20 %	40 %	0 %	422938150
108	NC_019551	CAAAG	2	10	217180	217189	60 %	0 %	20 %	20 %	422938150
109	NC_019551	TTGTT	2	10	223639	223648	0 %	80 %	20 %	0 %	422938152
110	NC_019551	AAAAT	2	10	225135	225144	80 %	20 %	0 %	0 %	422938154
111	NC_019551	TTAAG	2	10	226815	226824	40 %	40 %	20 %	0 %	422938156
112	NC_019551	AGGGT	2	10	227160	227169	20 %	20 %	60 %	0 %	422938156
113	NC_019551	GGGTA	2	10	227904	227913	20 %	20 %	60 %	0 %	422938157
114	NC_019551	TCTGG	2	10	232010	232019	0 %	40 %	40 %	20 %	422938164
115	NC_019551	TCGTA	2	10	232875	232884	20 %	40 %	20 %	20 %	422938164
116	NC_019551	TGAGA	2	10	236500	236509	40 %	20 %	40 %	0 %	422938169
117	NC_019551	GATCA	2	10	237157	237166	40 %	20 %	20 %	20 %	422938171
118	NC_019551	GCTTA	2	10	238170	238179	20 %	40 %	20 %	20 %	422938173
119	NC_019551	GAAAA	2	10	238530	238539	80 %	0 %	20 %	0 %	422938174
120	NC_019551	TTATT	2	10	243631	243640	20 %	80 %	0 %	0 %	422938186
121	NC_019551	ATCCT	2	10	246977	246986	20 %	40 %	0 %	40 %	422938191
122	NC_019551	CATTA	2	10	249606	249615	40 %	40 %	0 %	20 %	422938193
123	NC_019551	AATAT	2	10	250012	250021	60 %	40 %	0 %	0 %	422938193
124	NC_019551	TATGG	2	10	258545	258554	20 %	40 %	40 %	0 %	422938196
125	NC_019551	CTAAA	2	10	259392	259401	60 %	20 %	0 %	20 %	422938196
126	NC_019551	TATCA	2	10	263795	263804	40 %	40 %	0 %	20 %	422938201
127	NC_019551	TTGGT	2	10	264220	264229	0 %	60 %	40 %	0 %	422938202
128	NC_019551	TCGTT	2	10	264374	264383	0 %	60 %	20 %	20 %	422938202
129	NC_019551	GTTGA	2	10	264803	264812	20 %	40 %	40 %	0 %	422938203
130	NC_019551	TATTT	2	10	264868	264877	20 %	80 %	0 %	0 %	422938203
131	NC_019551	TTATT	2	10	264933	264942	20 %	80 %	0 %	0 %	422938203
132	NC_019551	AAAGA	2	10	266186	266195	80 %	0 %	20 %	0 %	422938205
133	NC_019551	TTTTA	2	10	268485	268494	20 %	80 %	0 %	0 %	422938207
134	NC_019551	GAGTA	2	10	268553	268562	40 %	20 %	40 %	0 %	422938207
135	NC_019551	GTTTG	2	10	268564	268573	0 %	60 %	40 %	0 %	422938207
136	NC_019551	ATGAT	2	10	269363	269372	40 %	40 %	20 %	0 %	422938208
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169	NC_019551	AATTA	2	10	346332	346341	60 %	40 %	0 %	0 %	422938264
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173	NC_019551	TTTAC	2	10	348214	348223	20 %	60 %	0 %	20 %	422938266
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