MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica F92 chromosome

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019537	AAGGTT	2	12	24392	24403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019537	ATAAGT	2	12	37606	37617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019537	TTAATT	2	12	50272	50283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019537	CTTGAG	2	12	64185	64196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019537	AAAAAG	2	12	97982	97993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019537	AGAATA	2	12	125941	125952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019537	TGAAAT	2	12	128247	128258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019537	GATGGT	2	12	129827	129838	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019537	TTTTAT	2	12	136798	136809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019537	TTATAA	2	12	142528	142539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019537	ATAAAT	2	12	149463	149474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019537	ATTTAA	2	12	172774	172785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019537	ATAAGT	2	12	212574	212585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019537	ATTTTT	2	12	215747	215758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019537	TTTTGT	2	12	216264	216275	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019537	ATTAAT	2	12	323400	323411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019537	TTAGAT	2	12	333584	333595	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019537	ATTGAT	2	12	351363	351374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019537	GTCTTG	2	12	356402	356413	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019537	TTTAAA	2	12	373383	373394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019537	AGGTTT	2	12	402348	402359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019537	AGTAAC	2	12	406016	406027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019537	AGAATA	2	12	415078	415089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019537	TGAAAT	2	12	417384	417395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019537	TAAAAT	2	12	422101	422112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019537	ATTTTT	2	12	422680	422691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019537	AAGTTA	2	12	443639	443650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019537	TAATGA	2	12	487660	487671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019537	AGTTGG	2	12	488062	488073	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019537	TAGAAG	2	12	493059	493070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019537	TAAATT	2	12	523504	523515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019537	ATTAAG	2	12	543921	543932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019537	ACTTTA	2	12	557030	557041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019537	CTTGAG	2	12	560610	560621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019537	TCTTGC	2	12	560918	560929	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019537	TATATT	2	12	582796	582807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019537	CTTTTT	2	12	582959	582970	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019537	AGCCAT	2	12	599957	599968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019537	TTTGTA	2	12	603978	603989	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019537	TGGATT	2	12	606547	606558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019537	TTAATG	2	12	610657	610668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019537	TAAAAA	2	12	631024	631035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019537	ATGTTA	2	12	639796	639807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019537	GATGTT	2	12	697194	697205	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019537	ATTTTG	2	12	746372	746383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019537	TTAAAA	2	12	747724	747735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019537	ACAGGT	2	12	760256	760267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019537	TTGCAG	2	12	762034	762045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019537	ATGAAA	2	12	765175	765186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019537	TAGTTT	2	12	769240	769251	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019537	AACAAA	2	12	777206	777217	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019537	GATTAT	2	12	777229	777240	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019537	TAATTT	2	12	803108	803119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019537	TATAAT	2	12	820427	820438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019537	TTAGTT	2	12	821841	821852	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019537	TAAATA	2	12	834727	834738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019537	TATAGT	2	12	864543	864554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019537	AAAATA	2	12	865866	865877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019537	TAACAG	2	12	883576	883587	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019537	ATATTT	2	12	887383	887394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019537	TTATAT	2	12	904102	904113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019537	TTTACT	2	12	911721	911732	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019537	TTAGTT	2	12	926807	926818	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019537	AAATCA	2	12	932504	932515	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019537	TTTAAA	2	12	934862	934873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019537	ATTAGA	2	12	937548	937559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019537	TAGATA	2	12	946816	946827	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019537	ATTTGA	2	12	946973	946984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019537	AAAATA	2	12	947358	947369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019537	CCTAGA	2	12	953912	953923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019537	TATAAT	4	24	956222	956245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019537	TTTGCT	2	12	962723	962734	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019537	AAGAAA	2	12	988121	988132	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019537	TTGATT	2	12	989186	989197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019537	AAAATT	2	12	993667	993678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019537	AGTATT	2	12	1008724	1008735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019537	CCAAAT	2	12	1009852	1009863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019537	TTTGGC	2	12	1033467	1033478	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019537	TTGATA	2	12	1038869	1038880	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019537	AGATAT	2	12	1039046	1039057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019537	ATTAAT	2	12	1039657	1039668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019537	ACATTA	2	12	1039835	1039846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019537	GTACTT	2	12	1040100	1040111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019537	TTTAGA	2	12	1044934	1044945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019537	TCAAAT	2	12	1045117	1045128	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019537	ATATCA	2	12	1056058	1056069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019537	TAAGAA	2	12	1064603	1064614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019537	AGAATA	2	12	1117320	1117331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019537	TGAAAT	2	12	1119626	1119637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019537	ACAATT	2	12	1121754	1121765	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019537	AGATTA	2	12	1158905	1158916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019537	CTAAAT	2	12	1161352	1161363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019537	ATAAAG	2	12	1162769	1162780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019537	TAAATT	2	12	1164417	1164428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019537	TAATTA	2	12	1179975	1179986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019537	AATTTA	2	12	1206289	1206300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019537	CTTATT	2	12	1206659	1206670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019537	TATAGG	2	12	1206871	1206882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019537	ATATTA	2	12	1217193	1217204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019537	AGAATC	2	12	1254900	1254911	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019537	TATAGA	2	12	1255413	1255424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019537	TAATTT	2	12	1255676	1255687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019537	TACGAT	2	12	1256063	1256074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019537	TTTATT	2	12	1256325	1256336	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019537	TATTTT	4	24	1257107	1257130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019537	ATCAAA	2	12	1258546	1258557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019537	AAAATT	2	12	1258564	1258575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019537	CTATTG	2	12	1259331	1259342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019537	AAAATC	2	12	1259503	1259514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_019537	TAAATC	2	12	1267510	1267521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019537	TAAAAA	2	12	1268237	1268248	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019537	AATCAA	2	12	1274623	1274634	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019537	GTACCA	2	12	1286400	1286411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019537	CTATTA	2	12	1295958	1295969	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019537	GTATAT	2	12	1297593	1297604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019537	ATATTG	2	12	1302532	1302543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019537	AATATG	2	12	1302928	1302939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019537	GATTTA	2	12	1309611	1309622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019537	TAAAAA	2	12	1331629	1331640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019537	TATTTT	2	12	1334442	1334453	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019537	CTGCTT	2	12	1369891	1369902	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019537	ATCAAA	2	12	1386378	1386389	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019537	TTTTGT	2	12	1406066	1406077	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019537	TATAAA	2	12	1409371	1409382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019537	TTATTT	2	12	1412293	1412304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019537	ATATTT	2	12	1414788	1414799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019537	TTTATG	2	12	1439347	1439358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019537	ATCTTT	2	12	1439364	1439375	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019537	TAAAGC	2	12	1443486	1443497	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_019537	ATGCAA	2	12	1482145	1482156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.