MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica F92 chromosome

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019537	AGCTA	2	10	19244	19253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019537	TTAAT	2	10	20485	20494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019537	TGATT	2	10	20672	20681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019537	CAAAG	2	10	25307	25316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019537	ATATT	2	10	25683	25692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019537	ATTTT	2	10	26087	26096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019537	CTGTA	2	10	36464	36473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019537	AGTTT	2	10	51776	51785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019537	TATTT	2	10	55673	55682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019537	AATTT	2	10	56707	56716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019537	TTATT	2	10	56961	56970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019537	TACTT	2	10	57246	57255	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019537	GATAA	2	10	61256	61265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019537	ATTTT	2	10	64169	64178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019537	CTAAA	2	10	65817	65826	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019537	AAAGT	2	10	71458	71467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019537	GCCCT	2	10	75587	75596	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_019537	TTTGG	2	10	77457	77466	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019537	ACTTT	2	10	77498	77507	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019537	ATTTT	2	10	84692	84701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019537	AGTTA	2	10	84816	84825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019537	TAAAA	2	10	92559	92568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019537	ATTAA	2	10	114404	114413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019537	TCTTT	2	10	115118	115127	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019537	GAATA	2	10	126012	126021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019537	GATTT	2	10	133633	133642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019537	TTTTA	2	10	136651	136660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019537	TATAG	2	10	139637	139646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019537	AAAAT	2	10	141129	141138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019537	ATAAA	2	10	141707	141716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019537	AATAA	2	10	141857	141866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019537	ATTTT	2	10	158365	158374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019537	AAATA	2	10	172815	172824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019537	TATAG	2	10	173429	173438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019537	CTAGC	2	10	176446	176455	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_019537	CTTGA	2	10	177342	177351	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019537	TTAAG	2	10	190304	190313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019537	AGATT	2	10	190398	190407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019537	AAAAC	2	10	196955	196964	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019537	GAAGA	2	10	211887	211896	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019537	TTGGA	2	10	212325	212334	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019537	AAGAA	2	10	212959	212968	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019537	TTGTT	4	20	213555	213574	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019537	AAAAT	2	10	215673	215682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019537	TAATA	2	10	234017	234026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019537	ATTTT	2	10	238691	238700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019537	ATTTC	2	10	247407	247416	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019537	CTTTT	2	10	249483	249492	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019537	TAATT	2	10	252329	252338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019537	AGTTT	2	10	253305	253314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019537	TTTGA	2	10	261830	261839	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019537	ATTTA	2	10	310579	310588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019537	AATCT	2	10	314980	314989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019537	ATTTT	2	10	322918	322927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019537	GCGAT	2	10	323846	323855	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019537	AGATA	2	10	338324	338333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019537	AATCT	2	10	346884	346893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019537	ATTTA	2	10	352783	352792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019537	AATAA	2	10	356878	356887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019537	TAGTT	2	10	358717	358726	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019537	TTAGA	2	10	358946	358955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019537	GATTT	2	10	360795	360804	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019537	TTTAG	2	10	370032	370041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019537	AGTTA	2	10	373881	373890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019537	CTGTC	2	10	382584	382593	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019537	TTTAT	2	10	385131	385140	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019537	AATAA	2	10	391341	391350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019537	TGTTA	2	10	413059	413068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019537	TTTTA	2	10	413073	413082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019537	TAAAT	2	10	413119	413128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019537	GAATA	2	10	415149	415158	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019537	TAATT	2	10	419748	419757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019537	TGAAA	2	10	433480	433489	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019537	TAATT	2	10	438243	438252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019537	TTTTA	2	10	448175	448184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019537	AGTTA	2	10	448194	448203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019537	TGATT	2	10	453233	453242	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019537	CATTT	2	10	471733	471742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019537	TTAAC	2	10	475510	475519	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019537	TTTAA	2	10	482599	482608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019537	GTTTG	2	10	500288	500297	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019537	CAATT	2	10	500299	500308	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019537	AATGA	2	10	503011	503020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019537	TAGAT	2	10	503023	503032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019537	ACTAT	2	10	504931	504940	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019537	AAATT	2	10	504976	504985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019537	GATAA	2	10	510566	510575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019537	GATAA	2	10	511745	511754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019537	TTCTT	2	10	518056	518065	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_019537	ATTTA	2	10	537752	537761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019537	TAATG	2	10	543599	543608	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019537	ATTTG	2	10	544309	544318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019537	AACTT	2	10	544890	544899	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019537	ATTTT	2	10	545021	545030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019537	ACTAA	2	10	546909	546918	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_019537	AGTTA	2	10	556702	556711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019537	ATTTA	2	10	557087	557096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019537	TTTAG	2	10	558879	558888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019537	AAAGC	2	10	560756	560765	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019537	TTTAG	2	10	582828	582837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019537	TATTT	2	10	583338	583347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019537	AAATT	2	10	583564	583573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019537	ATTAT	2	10	583933	583942	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019537	AATTT	2	10	593626	593635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019537	TAAGT	2	10	594769	594778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019537	AATTA	2	10	604005	604014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019537	AATCA	2	10	623517	623526	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019537	AACTA	2	10	626048	626057	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019537	TATTT	2	10	631529	631538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019537	AAAGT	2	10	632524	632533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019537	AGTAG	2	10	634249	634258	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019537	TTAAA	2	10	660699	660708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019537	ATTTA	2	10	678882	678891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019537	GCTTA	2	10	688101	688110	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019537	ATAAA	2	10	691555	691564	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019537	TTATA	2	10	691586	691595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019537	TAATA	2	10	693601	693610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019537	TAGTT	2	10	697064	697073	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019537	TGGCA	2	10	699837	699846	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019537	CTATG	2	10	699986	699995	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019537	TGTTT	2	10	700573	700582	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019537	TAAAT	2	10	710044	710053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019537	AAAAT	2	10	712649	712658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019537	GATTT	2	10	718729	718738	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019537	TATAA	2	10	719622	719631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019537	TGTTT	2	10	721522	721531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019537	ATATA	2	10	723214	723223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019537	CAAAA	2	10	730718	730727	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_019537	AAATT	2	10	746257	746266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019537	ACTAA	2	10	746289	746298	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019537	CATTG	2	10	747631	747640	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_019537	AAATA	2	10	757744	757753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019537	TCTAC	2	10	759999	760008	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019537	TTTGA	2	10	760601	760610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019537	AATCA	3	15	765965	765979	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019537	CAGTT	2	10	766275	766284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019537	AAATT	2	10	775675	775684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019537	CAAAA	2	10	777542	777551	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019537	ATTTT	2	10	778253	778262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019537	GTATA	2	10	786719	786728	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019537	AATTA	2	10	797576	797585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019537	GTTAA	2	10	799356	799365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019537	CTAAA	2	10	799809	799818	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019537	AAGTT	2	10	801057	801066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019537	TTTCT	2	10	801872	801881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019537	AATGA	2	10	820338	820347	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019537	ATTGG	2	10	821632	821641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019537	CTTTT	2	10	821717	821726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.