MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anabaena sp. 90 plasmid pANA03

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019440	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019440	GGA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079805
3	NC_019440	CAA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079805
4	NC_019440	GCT	2	6	367	372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019440	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079806
6	NC_019440	TAC	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079807
7	NC_019440	GTT	2	6	814	819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079807
8	NC_019440	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079807
9	NC_019440	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019440	ATA	2	6	1076	1081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019440	ATT	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019440	TAG	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019440	AAT	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019440	TTA	2	6	1536	1541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019440	AGT	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019440	ATT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019440	TGA	2	6	1915	1920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079809
18	NC_019440	GCA	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079809
19	NC_019440	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079809
20	NC_019440	CTA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079810
21	NC_019440	GTA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079810
22	NC_019440	ATT	2	6	2409	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079811
23	NC_019440	AAC	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
24	NC_019440	CAG	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
25	NC_019440	TTA	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079812
26	NC_019440	CAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
27	NC_019440	AAT	2	6	2979	2984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
28	NC_019440	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414079812
29	NC_019440	CAG	2	6	3044	3049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
30	NC_019440	ATC	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
31	NC_019440	GTA	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
32	NC_019440	TGA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
33	NC_019440	ATT	2	6	3316	3321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079812
34	NC_019440	GAT	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
35	NC_019440	CAA	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
36	NC_019440	TCA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
37	NC_019440	GGA	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
38	NC_019440	AGC	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
39	NC_019440	CAA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
40	NC_019440	GGA	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
41	NC_019440	ACA	2	6	4058	4063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
42	NC_019440	GAT	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
43	NC_019440	GGA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
44	NC_019440	TAA	2	6	4323	4328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
45	NC_019440	TTC	2	6	4364	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079812
46	NC_019440	TGA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
47	NC_019440	GGT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079812
48	NC_019440	GAC	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
49	NC_019440	AAT	2	6	4606	4611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
50	NC_019440	GAT	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
51	NC_019440	CTA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
52	NC_019440	ACT	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
53	NC_019440	AAG	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
54	NC_019440	AAG	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
55	NC_019440	CTG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079812
56	NC_019440	AAG	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
57	NC_019440	GGA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
58	NC_019440	TTG	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
59	NC_019440	TTG	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
60	NC_019440	TTG	2	6	5143	5148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
61	NC_019440	CAA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
62	NC_019440	CAA	2	6	5378	5383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
63	NC_019440	CAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
64	NC_019440	CAA	2	6	5476	5481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
65	NC_019440	CAA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
66	NC_019440	CAA	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
67	NC_019440	TAA	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
68	NC_019440	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079812
69	NC_019440	TGA	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
70	NC_019440	GTT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
71	NC_019440	TGC	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019440	ACA	2	6	5988	5993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
73	NC_019440	AGC	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079813
74	NC_019440	GCT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079813
75	NC_019440	TGC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079813
76	NC_019440	AAC	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
77	NC_019440	AAC	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
78	NC_019440	GGA	2	6	6444	6449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079813
79	NC_019440	CAG	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079813
80	NC_019440	GAT	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019440	AGT	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019440	AGT	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019440	TAA	2	6	6964	6969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019440	AGG	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079814
85	NC_019440	GTT	2	6	7280	7285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079814
86	NC_019440	GTT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079814
87	NC_019440	CAG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079814
88	NC_019440	ATA	2	6	7493	7498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019440	ATA	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019440	AAT	2	6	7621	7626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019440	TTG	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079815
92	NC_019440	TAC	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079815
93	NC_019440	AAT	2	6	7830	7835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079815
94	NC_019440	TAA	2	6	7843	7848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079815
95	NC_019440	TAA	2	6	7998	8003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019440	ACC	2	6	8167	8172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019440	CAT	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019440	GAA	2	6	8306	8311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019440	TGA	2	6	8317	8322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019440	ATA	2	6	8324	8329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019440	AAG	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
102	NC_019440	TCA	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
103	NC_019440	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
104	NC_019440	CAC	3	9	8671	8679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079816
105	NC_019440	AGC	3	9	9089	9097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
106	NC_019440	AGC	2	6	9242	9247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
107	NC_019440	TGA	2	6	9356	9361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
108	NC_019440	TGA	2	6	9407	9412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
109	NC_019440	TGA	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
110	NC_019440	GCA	2	6	9462	9467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
111	NC_019440	AGA	2	6	9518	9523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
112	NC_019440	TCG	2	6	9536	9541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079816
113	NC_019440	ACT	2	6	9571	9576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
114	NC_019440	ATA	2	6	9622	9627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079816
115	NC_019440	TGG	2	6	9654	9659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079816
116	NC_019440	ATG	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
117	NC_019440	GAA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
118	NC_019440	AGT	2	6	9971	9976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
119	NC_019440	AGA	2	6	10019	10024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
120	NC_019440	ATT	2	6	10035	10040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079816
121	NC_019440	GAA	2	6	10068	10073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
122	NC_019440	GAA	2	6	10137	10142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
123	NC_019440	CAT	2	6	10244	10249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
124	NC_019440	TGA	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
125	NC_019440	TGA	2	6	10343	10348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
126	NC_019440	TTC	2	6	10410	10415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079816
127	NC_019440	TTG	2	6	10468	10473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079816
128	NC_019440	TAA	2	6	10481	10486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079816
129	NC_019440	ATT	2	6	10594	10599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079816
130	NC_019440	GTA	2	6	10665	10670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
131	NC_019440	GAA	2	6	10785	10790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
132	NC_019440	GTT	2	6	10876	10881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079816
133	NC_019440	GTA	2	6	10941	10946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
134	NC_019440	GAA	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
135	NC_019440	TCA	2	6	11025	11030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
136	NC_019440	CAG	2	6	11051	11056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
137	NC_019440	CAG	2	6	11251	11256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
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141	NC_019440	GAC	2	6	11780	11785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079817
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147	NC_019440	GGA	2	6	12305	12310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079817
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151	NC_019440	ATT	2	6	12618	12623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019440	AGT	2	6	12631	12636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019440	TAC	2	6	12717	12722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019440	ATT	2	6	12728	12733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019440	AGT	2	6	12741	12746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_019440	GTC	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_019440	AAT	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_019440	ATA	2	6	13396	13401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019440	TGT	2	6	13416	13421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_019440	TAT	2	6	15205	15210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_019440	CAA	2	6	15211	15216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_019440	GAA	2	6	15294	15299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_019440	TAT	2	6	18590	18595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_019440	CCA	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079826
258	NC_019440	CAT	2	6	19784	19789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.