MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anabaena sp. 90 plasmid pANA03

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019440	GGA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079805
2	NC_019440	CAA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079805
3	NC_019440	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079806
4	NC_019440	TAC	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079807
5	NC_019440	GTT	2	6	814	819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079807
6	NC_019440	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079807
7	NC_019440	TGA	2	6	1915	1920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079809
8	NC_019440	GCA	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079809
9	NC_019440	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079809
10	NC_019440	CTA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079810
11	NC_019440	GTA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079810
12	NC_019440	ATT	2	6	2409	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079811
13	NC_019440	AAC	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
14	NC_019440	CAG	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
15	NC_019440	TTA	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079812
16	NC_019440	CAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
17	NC_019440	AAT	2	6	2979	2984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
18	NC_019440	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414079812
19	NC_019440	CAG	2	6	3044	3049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
20	NC_019440	ATC	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
21	NC_019440	GTA	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
22	NC_019440	TGA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
23	NC_019440	ATT	2	6	3316	3321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079812
24	NC_019440	GAT	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
25	NC_019440	CAA	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
26	NC_019440	TCA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
27	NC_019440	GGA	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
28	NC_019440	AGC	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
29	NC_019440	CAA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
30	NC_019440	GGA	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
31	NC_019440	ACA	2	6	4058	4063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
32	NC_019440	GAT	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
33	NC_019440	GGA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
34	NC_019440	TAA	2	6	4323	4328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
35	NC_019440	TTC	2	6	4364	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079812
36	NC_019440	TGA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
37	NC_019440	GGT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079812
38	NC_019440	GAC	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
39	NC_019440	AAT	2	6	4606	4611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
40	NC_019440	GAT	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
41	NC_019440	CTA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
42	NC_019440	ACT	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
43	NC_019440	AAG	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
44	NC_019440	AAG	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
45	NC_019440	CTG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079812
46	NC_019440	AAG	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
47	NC_019440	GGA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
48	NC_019440	TTG	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
49	NC_019440	TTG	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
50	NC_019440	TTG	2	6	5143	5148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
51	NC_019440	CAA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
52	NC_019440	CAA	2	6	5378	5383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
53	NC_019440	CAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
54	NC_019440	CAA	2	6	5476	5481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
55	NC_019440	CAA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
56	NC_019440	CAA	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
57	NC_019440	TAA	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
58	NC_019440	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079812
59	NC_019440	TGA	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
60	NC_019440	GTT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
61	NC_019440	ACA	2	6	5988	5993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
62	NC_019440	AGC	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079813
63	NC_019440	GCT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079813
64	NC_019440	TGC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079813
65	NC_019440	AAC	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
66	NC_019440	AAC	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
67	NC_019440	GGA	2	6	6444	6449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079813
68	NC_019440	CAG	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079813
69	NC_019440	AGG	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079814
70	NC_019440	GTT	2	6	7280	7285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079814
71	NC_019440	GTT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079814
72	NC_019440	CAG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079814
73	NC_019440	TTG	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079815
74	NC_019440	TAC	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079815
75	NC_019440	AAT	2	6	7830	7835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079815
76	NC_019440	TAA	2	6	7843	7848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079815
77	NC_019440	AAG	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
78	NC_019440	TCA	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
79	NC_019440	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
80	NC_019440	CAC	3	9	8671	8679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079816
81	NC_019440	AGC	3	9	9089	9097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
82	NC_019440	AGC	2	6	9242	9247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
83	NC_019440	TGA	2	6	9356	9361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
84	NC_019440	TGA	2	6	9407	9412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
85	NC_019440	TGA	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
86	NC_019440	GCA	2	6	9462	9467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
87	NC_019440	AGA	2	6	9518	9523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
88	NC_019440	TCG	2	6	9536	9541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079816
89	NC_019440	ACT	2	6	9571	9576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
90	NC_019440	ATA	2	6	9622	9627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079816
91	NC_019440	TGG	2	6	9654	9659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079816
92	NC_019440	ATG	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
93	NC_019440	GAA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
94	NC_019440	AGT	2	6	9971	9976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
95	NC_019440	AGA	2	6	10019	10024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
96	NC_019440	ATT	2	6	10035	10040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079816
97	NC_019440	GAA	2	6	10068	10073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
98	NC_019440	GAA	2	6	10137	10142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
99	NC_019440	CAT	2	6	10244	10249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
100	NC_019440	TGA	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
101	NC_019440	TGA	2	6	10343	10348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
102	NC_019440	TTC	2	6	10410	10415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079816
103	NC_019440	TTG	2	6	10468	10473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079816
104	NC_019440	TAA	2	6	10481	10486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079816
105	NC_019440	ATT	2	6	10594	10599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079816
106	NC_019440	GTA	2	6	10665	10670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
107	NC_019440	GAA	2	6	10785	10790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
108	NC_019440	GTT	2	6	10876	10881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079816
109	NC_019440	GTA	2	6	10941	10946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079816
110	NC_019440	GAA	2	6	10950	10955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
111	NC_019440	TCA	2	6	11025	11030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079816
112	NC_019440	CAG	2	6	11051	11056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
113	NC_019440	CAG	2	6	11251	11256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079816
114	NC_019440	CAA	2	6	11271	11276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079816
115	NC_019440	ATC	2	6	11589	11594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079817
116	NC_019440	GAC	2	6	11624	11629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079817
117	NC_019440	GAC	2	6	11780	11785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079817
118	NC_019440	GCT	2	6	11869	11874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079817
119	NC_019440	GGT	2	6	12051	12056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079817
120	NC_019440	CAC	2	6	12186	12191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079817
121	NC_019440	AGC	2	6	12204	12209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079817
122	NC_019440	GAC	2	6	12212	12217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079817
123	NC_019440	GGA	2	6	12305	12310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079817
124	NC_019440	ACA	2	6	12319	12324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079817
125	NC_019440	TCA	2	6	12347	12352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079817
126	NC_019440	CCA	2	6	12804	12809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079818
127	NC_019440	TAA	2	6	12843	12848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079818
128	NC_019440	GTT	2	6	12861	12866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079818
129	NC_019440	ATC	2	6	12915	12920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079818
130	NC_019440	TGT	2	6	12967	12972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079818
131	NC_019440	TGC	2	6	13077	13082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079819
132	NC_019440	GTA	2	6	13095	13100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079819
133	NC_019440	GTA	2	6	13566	13571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079820
134	NC_019440	ATC	2	6	13720	13725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079820
135	NC_019440	ATC	2	6	13798	13803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079820
136	NC_019440	GAT	2	6	13848	13853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079820
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138	NC_019440	GCT	2	6	13946	13951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079820
139	NC_019440	GCT	2	6	14007	14012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079820
140	NC_019440	GAC	2	6	14141	14146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079820
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150	NC_019440	TTA	2	6	15585	15590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079822
151	NC_019440	TAA	2	6	15664	15669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079822
152	NC_019440	CTG	2	6	15697	15702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079822
153	NC_019440	TAC	2	6	15721	15726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079822
154	NC_019440	TAA	2	6	15835	15840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079822
155	NC_019440	TCA	2	6	15885	15890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079822
156	NC_019440	ATC	2	6	15914	15919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079822
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159	NC_019440	GTT	2	6	16255	16260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079822
160	NC_019440	GTT	2	6	16322	16327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079822
161	NC_019440	TGA	2	6	16365	16370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079822
162	NC_019440	GAT	2	6	16408	16413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079822
163	NC_019440	GCT	2	6	16441	16446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079822
164	NC_019440	GGT	2	6	16695	16700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079822
165	NC_019440	TCA	2	6	16725	16730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079822
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167	NC_019440	TTG	2	6	16931	16936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079822
168	NC_019440	ATT	3	9	17156	17164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079823
169	NC_019440	ACT	2	6	17264	17269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079823
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173	NC_019440	AAT	2	6	17501	17506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079823
174	NC_019440	AAC	2	6	17532	17537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079823
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176	NC_019440	ATA	2	6	17575	17580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079823
177	NC_019440	TTC	2	6	17675	17680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079823
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204	NC_019440	CCA	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414079826
205	NC_019440	CAT	2	6	19784	19789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.