MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA02

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019439	CATATC	2	12	2148	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019439	TAAAGG	2	12	2460	2471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019439	GGGGTT	2	12	15767	15778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019439	CCCTAG	2	12	23330	23341	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019439	ATTTTT	2	12	32254	32265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019439	ACTTCG	2	12	56034	56045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019439	AACAAT	2	12	61340	61351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019439	AACAAT	2	12	61421	61432	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_019439	AACAAT	2	12	61502	61513	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019439	AACAAT	2	12	61584	61595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019439	TATAAA	2	12	79413	79424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019439	AATTAG	2	12	102834	102845	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019439	AATTTC	2	12	124918	124929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019439	TCAAAA	2	12	127162	127173	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019439	ATTAGC	2	12	127466	127477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019439	AAAAGA	2	12	127844	127855	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019439	TAGGTT	2	12	128029	128040	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019439	AATATG	2	12	152895	152906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019439	AGTTAA	2	12	181445	181456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019439	ATTTCT	2	12	182649	182660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019439	ATTTTT	2	12	182661	182672	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019439	AAATAT	2	12	192866	192877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019439	TTAAAT	2	12	219852	219863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019439	AGTTTT	2	12	238261	238272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019439	CAGTTA	2	12	251452	251463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019439	AAACAA	2	12	257624	257635	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019439	AACCTA	2	12	258326	258337	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019439	ATATTT	2	12	260800	260811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019439	AAAATA	2	12	274951	274962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019439	TTTTGA	2	12	286276	286287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019439	CCAACT	2	12	288558	288569	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019439	TTTGAT	2	12	297782	297793	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019439	TTACAA	2	12	299852	299863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019439	TAAATA	2	12	331396	331407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019439	TAAAAA	2	12	332267	332278	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019439	AAATTA	2	12	332816	332827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019439	ATAAAA	2	12	349195	349206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019439	TATCAA	2	12	354555	354566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019439	GTGAAA	2	12	370736	370747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019439	TCTATT	2	12	376469	376480	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019439	GATTAT	2	12	380042	380053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019439	TGTCAT	2	12	380130	380141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019439	AAGCAT	2	12	391719	391730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019439	ACTAAA	2	12	396218	396229	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019439	AATTTA	2	12	396483	396494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019439	TAATCG	2	12	403642	403653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019439	AGGTAG	2	12	466713	466724	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019439	AGCAAC	2	12	468101	468112	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019439	TAAATC	2	12	468759	468770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019439	ATGTAA	2	12	469615	469626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019439	CCCTGC	2	12	474447	474458	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019439	CTGTAC	2	12	498087	498098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019439	AATAGA	2	12	511023	511034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019439	TAAAAT	2	12	511277	511288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019439	TTTTGA	2	12	517112	517123	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019439	TCTCTT	2	12	526940	526951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019439	GCCTAC	2	12	536064	536075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019439	ATTAAA	2	12	565360	565371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019439	ATAAAA	3	18	573248	573265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019439	AATCCT	2	12	601737	601748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019439	CATATA	2	12	614239	614250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019439	ACCAGA	2	12	645421	645432	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019439	TATTTA	2	12	648285	648296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019439	TTTTTA	2	12	648511	648522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019439	AAATAT	2	12	655067	655078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019439	CCTACT	2	12	661639	661650	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019439	TCAAAA	2	12	693249	693260	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019439	CGATGC	2	12	694827	694838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019439	GATTTC	2	12	715879	715890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019439	GATTTT	2	12	744830	744841	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019439	AAAATC	2	12	758721	758732	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019439	TTATCA	2	12	758882	758893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_019439	ATGATA	2	12	764782	764793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019439	GAAATC	2	12	765718	765729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019439	AAACTG	2	12	804818	804829	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.