MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA02

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019439	TTCTCA	2	12	1211	1222	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414079099
2	NC_019439	GCTGTG	2	12	12959	12970	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079104
3	NC_019439	TAGCAT	2	12	17170	17181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079109
4	NC_019439	CACAAA	2	12	17256	17267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079109
5	NC_019439	AAAGTG	2	12	18794	18805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079110
6	NC_019439	AGCTGT	2	12	23931	23942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414079117
7	NC_019439	ATCACC	2	12	24823	24834	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414079117
8	NC_019439	ACCGAA	2	12	25006	25017	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079117
9	NC_019439	GATTAC	2	12	25480	25491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079117
10	NC_019439	ATACTG	2	12	25673	25684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079118
11	NC_019439	TAGATT	2	12	26555	26566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079119
12	NC_019439	ACAACC	2	12	26601	26612	50 %	0 %	0 %	50 %	414079119
13	NC_019439	AAACCA	2	12	29217	29228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079121
14	NC_019439	AGCCAT	2	12	29858	29869	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414079121
15	NC_019439	AAATTG	2	12	29973	29984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079121
16	NC_019439	AAAGTT	2	12	32683	32694	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079125
17	NC_019439	GTTCCT	2	12	34177	34188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414079126
18	NC_019439	GCTTCA	2	12	40197	40208	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079129
19	NC_019439	TTACGA	2	12	45800	45811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079134
20	NC_019439	AAAACC	2	12	48869	48880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079138
21	NC_019439	ATTGTG	2	12	52154	52165	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414079142
22	NC_019439	ATAGCT	2	12	52750	52761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079142
23	NC_019439	TCAGAA	2	12	58367	58378	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079145
24	NC_019439	ATTTAC	2	12	60324	60335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079145
25	NC_019439	AAAGAT	2	12	60893	60904	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414079145
26	NC_019439	GTATCA	2	12	61974	61985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079146
27	NC_019439	AAATCA	2	12	63927	63938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079147
28	NC_019439	TTAATT	2	12	66366	66377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079148
29	NC_019439	TTTTGA	2	12	72306	72317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414079152
30	NC_019439	GCAGAA	2	12	74650	74661	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414079156
31	NC_019439	ACCGTT	2	12	74698	74709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079156
32	NC_019439	CGGGTT	2	12	75695	75706	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079156
33	NC_019439	AATTGA	2	12	76173	76184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079156
34	NC_019439	AGATAA	2	12	78362	78373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414079158
35	NC_019439	GAAAAA	2	12	79866	79877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414079161
36	NC_019439	TCTAAT	2	12	81800	81811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079164
37	NC_019439	AAGAAA	2	12	83919	83930	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414079166
38	NC_019439	TGGGCT	2	12	86448	86459	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079169
39	NC_019439	CAGAAT	2	12	87096	87107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079170
40	NC_019439	CCAGAA	2	12	92440	92451	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079174
41	NC_019439	GGGAAA	2	12	95948	95959	50 %	0 %	50 %	0 %	414079175
42	NC_019439	CAGAAA	2	12	98472	98483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414079179
43	NC_019439	TACCCA	2	12	99543	99554	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414079179
44	NC_019439	TAGCCT	2	12	99582	99593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079179
45	NC_019439	AACTCA	2	12	99660	99671	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414079179
46	NC_019439	CGAAAG	2	12	101424	101435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414079181
47	NC_019439	GTTGAA	2	12	101835	101846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079182
48	NC_019439	TGGTAA	2	12	105755	105766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079184
49	NC_019439	GGCATC	2	12	107093	107104	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414079184
50	NC_019439	GTGATT	2	12	114656	114667	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414079191
51	NC_019439	AAAGAC	2	12	116034	116045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414079193
52	NC_019439	AATCTC	2	12	116592	116603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079193
53	NC_019439	AGGTTT	2	12	117028	117039	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414079193
54	NC_019439	TCCAAT	2	12	117942	117953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079194
55	NC_019439	CTAATT	2	12	122566	122577	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079198
56	NC_019439	GGAAAT	2	12	123575	123586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079198
57	NC_019439	GCTAAA	2	12	123899	123910	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079199
58	NC_019439	ATCGAA	2	12	130162	130173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079205
59	NC_019439	ATAGGT	2	12	131878	131889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079207
60	NC_019439	GGTTTG	2	12	132379	132390	0 %	50 %	50 %	0 %	414079207
61	NC_019439	CAATTG	2	12	134157	134168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079209
62	NC_019439	CAGATA	2	12	134358	134369	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079209
63	NC_019439	CTACAG	2	12	134393	134404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414079209
64	NC_019439	ATAGTA	2	12	136383	136394	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079209
65	NC_019439	TAGTAA	2	12	138217	138228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079210
66	NC_019439	AAATAC	2	12	138715	138726	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079210
67	NC_019439	TGGAAT	2	12	142031	142042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079214
68	NC_019439	CTTCAC	2	12	144388	144399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414079217
69	NC_019439	TCTAAT	2	12	144549	144560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079217
70	NC_019439	TAGCAG	2	12	151024	151035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414079221
71	NC_019439	AAAACT	2	12	155739	155750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079224
72	NC_019439	GCGGTA	2	12	160596	160607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414079228
73	NC_019439	ACCAAA	2	12	163324	163335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079230
74	NC_019439	GAATTG	2	12	166934	166945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079232
75	NC_019439	TCTACT	2	12	168194	168205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414079233
76	NC_019439	TCAGCT	2	12	171479	171490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079237
77	NC_019439	CTACAT	2	12	172284	172295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079237
78	NC_019439	CCAGAA	2	12	174667	174678	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079239
79	NC_019439	ATTAAT	2	12	176855	176866	50 %	50 %	0 %	0 %	414079241
80	NC_019439	AATAAC	2	12	181976	181987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079247
81	NC_019439	TAGATA	2	12	184199	184210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079249
82	NC_019439	AAAAGA	2	12	188126	188137	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414079250
83	NC_019439	ATGAAG	2	12	193500	193511	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079254
84	NC_019439	TTAAAT	2	12	194535	194546	50 %	50 %	0 %	0 %	414079255
85	NC_019439	AATTGA	2	12	200403	200414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079258
86	NC_019439	AAGTTT	2	12	202244	202255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079259
87	NC_019439	AAAAGA	2	12	205781	205792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414079261
88	NC_019439	GGAAAT	2	12	205844	205855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079261
89	NC_019439	ACCAAA	2	12	216253	216264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079274
90	NC_019439	GGTGAT	2	12	217989	218000	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414079275
91	NC_019439	CTGGTG	2	12	218593	218604	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079276
92	NC_019439	ATGTAT	2	12	219298	219309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079277
93	NC_019439	TTCTAA	2	12	224849	224860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079281
94	NC_019439	ATAGCT	2	12	225921	225932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079282
95	NC_019439	TGGTAA	2	12	227248	227259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079283
96	NC_019439	CAATGG	2	12	231931	231942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414079287
97	NC_019439	TAAAAC	2	12	235229	235240	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079291
98	NC_019439	ATGTTC	2	12	236015	236026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414079291
99	NC_019439	ATTGGG	2	12	237751	237762	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414079293
100	NC_019439	ACCAGA	2	12	239521	239532	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079294
101	NC_019439	CAATTA	2	12	243852	243863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414079296
102	NC_019439	TAGAAT	2	12	247417	247428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079299
103	NC_019439	CCACTT	2	12	251058	251069	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414079301
104	NC_019439	TTAGAA	2	12	254058	254069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414079303
105	NC_019439	TGAAGA	2	12	254297	254308	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414079303
106	NC_019439	AAAAAT	2	12	255262	255273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414079304
107	NC_019439	AAAAAT	2	12	255688	255699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414079304
108	NC_019439	TAGATT	2	12	255710	255721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079304
109	NC_019439	TGGAGA	2	12	255805	255816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414079305
110	NC_019439	CAAATG	2	12	256491	256502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414079305
111	NC_019439	GAACCA	2	12	257106	257117	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	414079306
112	NC_019439	CCACAG	2	12	262218	262229	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414079310
113	NC_019439	CTTCTG	2	12	268393	268404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414079315
114	NC_019439	TTGGGT	2	12	269584	269595	0 %	50 %	50 %	0 %	414079317
115	NC_019439	GGATTG	2	12	271279	271290	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414079320
116	NC_019439	AATCAA	2	12	275000	275011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079324
117	NC_019439	TTCCAC	2	12	275568	275579	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414079325
118	NC_019439	AAAATC	2	12	277481	277492	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079328
119	NC_019439	TAGTGC	2	12	280582	280593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414079333
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230	NC_019439	CTAAAA	2	12	592105	592116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079601
231	NC_019439	GCAGTA	2	12	598843	598854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414079606
232	NC_019439	GAAGGA	2	12	600125	600136	50 %	0 %	50 %	0 %	414079608
233	NC_019439	ACAACT	2	12	601810	601821	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	414079610
234	NC_019439	TTATCA	2	12	605312	605323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079613
235	NC_019439	TTTCTG	2	12	605487	605498	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414079614
236	NC_019439	TATCGG	2	12	607914	607925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414079618
237	NC_019439	GTGTAG	2	12	611913	611924	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414079620
238	NC_019439	ATTTTG	2	12	614737	614748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414079623
239	NC_019439	GAATGG	2	12	615555	615566	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414079624
240	NC_019439	ATTAAA	2	12	616074	616085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079625
241	NC_019439	ATTTTT	2	12	617204	617215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414079627
242	NC_019439	ATTCTC	2	12	627324	627335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414079635
243	NC_019439	TGTAGA	2	12	629599	629610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079636
244	NC_019439	GCACCT	2	12	630562	630573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414079637
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247	NC_019439	TACCTG	2	12	639187	639198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414079646
248	NC_019439	CTTCTG	2	12	641212	641223	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414079648
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251	NC_019439	CTAATT	2	12	644662	644673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414079651
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253	NC_019439	AATACT	2	12	649071	649082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414079655
254	NC_019439	CCCAAA	2	12	655126	655137	50 %	0 %	0 %	50 %	414079660
255	NC_019439	ATTATG	2	12	655513	655524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079660
256	NC_019439	GCTGGT	2	12	655767	655778	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414079660
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259	NC_019439	CCGCAG	2	12	661863	661874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	414079664
260	NC_019439	TCAACG	2	12	663618	663629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414079665
261	NC_019439	TATTGA	3	18	664170	664187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414079666
262	NC_019439	TTTATC	2	12	666052	666063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414079667
263	NC_019439	TAACAA	2	12	666825	666836	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414079669
264	NC_019439	CAGCTA	2	12	673309	673320	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414079676
265	NC_019439	CACCAG	2	12	673597	673608	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414079676
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268	NC_019439	GGTGAT	2	12	688060	688071	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414079685
269	NC_019439	ATGGTG	2	12	688416	688427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414079686
270	NC_019439	TTCTGC	2	12	690650	690661	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414079688
271	NC_019439	CAATGT	2	12	692554	692565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414079689
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280	NC_019439	CTGGGG	2	12	707589	707600	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	414079700
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320	NC_019439	ACCCGT	2	12	807211	807222	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414079792
321	NC_019439	GTAGGA	2	12	814934	814945	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414079800
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325	NC_019439	TCACCA	2	12	819397	819408	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	414079803

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.