MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anabaena sp. 90 chromosome chANA02

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019439	CAAAC	2	10	4597	4606	60 %	0 %	0 %	40 %	414079100
2	NC_019439	GGGGA	2	10	8031	8040	20 %	0 %	80 %	0 %	414079101
3	NC_019439	GTGAA	2	10	9638	9647	40 %	20 %	40 %	0 %	414079102
4	NC_019439	GGTGG	2	10	10291	10300	0 %	20 %	80 %	0 %	414079102
5	NC_019439	ATTGA	2	10	10732	10741	40 %	40 %	20 %	0 %	414079102
6	NC_019439	ACCAC	2	10	14057	14066	40 %	0 %	0 %	60 %	414079104
7	NC_019439	GCTAG	2	10	14361	14370	20 %	20 %	40 %	20 %	414079105
8	NC_019439	GAGAA	2	10	16682	16691	60 %	0 %	40 %	0 %	414079108
9	NC_019439	TCCCA	2	10	18392	18401	20 %	20 %	0 %	60 %	414079109
10	NC_019439	CTAAT	2	10	18490	18499	40 %	40 %	0 %	20 %	414079109
11	NC_019439	TAATT	2	10	19150	19159	40 %	60 %	0 %	0 %	414079111
12	NC_019439	TAAGT	2	10	20073	20082	40 %	40 %	20 %	0 %	414079112
13	NC_019439	TAACT	2	10	20562	20571	40 %	40 %	0 %	20 %	414079113
14	NC_019439	AACGG	2	10	21049	21058	40 %	0 %	40 %	20 %	414079113
15	NC_019439	TTCAG	2	10	21884	21893	20 %	40 %	20 %	20 %	414079115
16	NC_019439	ATCAC	2	10	22181	22190	40 %	20 %	0 %	40 %	414079115
17	NC_019439	AGAAA	2	10	23976	23985	80 %	0 %	20 %	0 %	414079117
18	NC_019439	TCTGC	2	10	25363	25372	0 %	40 %	20 %	40 %	414079117
19	NC_019439	GTGAA	2	10	26699	26708	40 %	20 %	40 %	0 %	414079119
20	NC_019439	TAGAT	2	10	27543	27552	40 %	40 %	20 %	0 %	414079119
21	NC_019439	ATTCT	2	10	30247	30256	20 %	60 %	0 %	20 %	414079121
22	NC_019439	CACCC	2	10	30600	30609	20 %	0 %	0 %	80 %	414079122
23	NC_019439	CGTGC	2	10	32657	32666	0 %	20 %	40 %	40 %	414079125
24	NC_019439	TTGGT	2	10	34136	34145	0 %	60 %	40 %	0 %	414079126
25	NC_019439	CAAAA	2	10	36324	36333	80 %	0 %	0 %	20 %	414079127
26	NC_019439	TCTTT	2	10	41677	41686	0 %	80 %	0 %	20 %	414079131
27	NC_019439	GTCTG	2	10	43486	43495	0 %	40 %	40 %	20 %	414079132
28	NC_019439	TCCGA	2	10	46437	46446	20 %	20 %	20 %	40 %	414079135
29	NC_019439	TAATT	2	10	49106	49115	40 %	60 %	0 %	0 %	414079139
30	NC_019439	AATAA	2	10	49264	49273	80 %	20 %	0 %	0 %	414079139
31	NC_019439	ATTAT	2	10	49516	49525	40 %	60 %	0 %	0 %	414079139
32	NC_019439	TCGAC	2	10	52549	52558	20 %	20 %	20 %	40 %	414079142
33	NC_019439	TAATT	2	10	52584	52593	40 %	60 %	0 %	0 %	414079142
34	NC_019439	TAATT	2	10	56782	56791	40 %	60 %	0 %	0 %	414079145
35	NC_019439	GAATT	2	10	58214	58223	40 %	40 %	20 %	0 %	414079145
36	NC_019439	ATTGA	2	10	64033	64042	40 %	40 %	20 %	0 %	414079147
37	NC_019439	AAGTT	2	10	70324	70333	40 %	40 %	20 %	0 %	414079150
38	NC_019439	ACCAG	2	10	74767	74776	40 %	0 %	20 %	40 %	414079156
39	NC_019439	AATTA	2	10	75990	75999	60 %	40 %	0 %	0 %	414079156
40	NC_019439	GAGGG	2	10	76729	76738	20 %	0 %	80 %	0 %	414079156
41	NC_019439	ACAAA	2	10	77021	77030	80 %	0 %	0 %	20 %	414079157
42	NC_019439	TTCAA	2	10	78137	78146	40 %	40 %	0 %	20 %	414079158
43	NC_019439	ATATC	2	10	78421	78430	40 %	40 %	0 %	20 %	414079158
44	NC_019439	CCATT	2	10	81087	81096	20 %	40 %	0 %	40 %	414079164
45	NC_019439	AAATG	2	10	81244	81253	60 %	20 %	20 %	0 %	414079164
46	NC_019439	AAAAG	2	10	83472	83481	80 %	0 %	20 %	0 %	414079166
47	NC_019439	TAATT	2	10	84534	84543	40 %	60 %	0 %	0 %	414079167
48	NC_019439	AGTTT	2	10	87444	87453	20 %	60 %	20 %	0 %	414079170
49	NC_019439	TTTCC	2	10	87459	87468	0 %	60 %	0 %	40 %	414079170
50	NC_019439	TGACC	2	10	89780	89789	20 %	20 %	20 %	40 %	414079172
51	NC_019439	TAGTT	2	10	98086	98095	20 %	60 %	20 %	0 %	414079178
52	NC_019439	CATAA	2	10	99036	99045	60 %	20 %	0 %	20 %	414079179
53	NC_019439	AATTA	2	10	99226	99235	60 %	40 %	0 %	0 %	414079179
54	NC_019439	ATCAG	2	10	100534	100543	40 %	20 %	20 %	20 %	414079180
55	NC_019439	ACCAA	2	10	102642	102651	60 %	0 %	0 %	40 %	414079182
56	NC_019439	ATTTC	2	10	103024	103033	20 %	60 %	0 %	20 %	414079183
57	NC_019439	ATGTG	2	10	103507	103516	20 %	40 %	40 %	0 %	414079183
58	NC_019439	AATTG	2	10	103830	103839	40 %	40 %	20 %	0 %	414079183
59	NC_019439	GAATG	2	10	104775	104784	40 %	20 %	40 %	0 %	414079184
60	NC_019439	ATTGC	2	10	107970	107979	20 %	40 %	20 %	20 %	414079185
61	NC_019439	TTTCA	2	10	109644	109653	20 %	60 %	0 %	20 %	414079187
62	NC_019439	GAAGG	2	10	110021	110030	40 %	0 %	60 %	0 %	414079187
63	NC_019439	GTGAT	2	10	110586	110595	20 %	40 %	40 %	0 %	414079187
64	NC_019439	ATTAT	2	10	112590	112599	40 %	60 %	0 %	0 %	414079189
65	NC_019439	CAAAT	2	10	115225	115234	60 %	20 %	0 %	20 %	414079192
66	NC_019439	AAATT	2	10	115578	115587	60 %	40 %	0 %	0 %	414079193
67	NC_019439	ATTTA	2	10	116344	116353	40 %	60 %	0 %	0 %	414079193
68	NC_019439	AATTA	2	10	117480	117489	60 %	40 %	0 %	0 %	414079194
69	NC_019439	TTTCG	2	10	123865	123874	0 %	60 %	20 %	20 %	414079199
70	NC_019439	TTGAG	2	10	124202	124211	20 %	40 %	40 %	0 %	414079199
71	NC_019439	TTTAA	2	10	125316	125325	40 %	60 %	0 %	0 %	414079200
72	NC_019439	CTTCT	2	10	126016	126025	0 %	60 %	0 %	40 %	414079201
73	NC_019439	TTTTA	2	10	128715	128724	20 %	80 %	0 %	0 %	414079203
74	NC_019439	GGAAA	2	10	132124	132133	60 %	0 %	40 %	0 %	414079207
75	NC_019439	TTAAA	2	10	133477	133486	60 %	40 %	0 %	0 %	414079208
76	NC_019439	ATTCT	2	10	135232	135241	20 %	60 %	0 %	20 %	414079209
77	NC_019439	AATTA	2	10	135844	135853	60 %	40 %	0 %	0 %	414079209
78	NC_019439	ATTTA	2	10	137305	137314	40 %	60 %	0 %	0 %	414079210
79	NC_019439	GAAAC	2	10	139332	139341	60 %	0 %	20 %	20 %	414079210
80	NC_019439	GAAGA	2	10	142593	142602	60 %	0 %	40 %	0 %	414079215
81	NC_019439	GTAAA	2	10	142965	142974	60 %	20 %	20 %	0 %	414079215
82	NC_019439	GTGAT	2	10	145528	145537	20 %	40 %	40 %	0 %	414079218
83	NC_019439	AGGAA	2	10	146362	146371	60 %	0 %	40 %	0 %	414079219
84	NC_019439	GAAAT	2	10	149207	149216	60 %	20 %	20 %	0 %	414079219
85	NC_019439	ACCTG	2	10	150593	150602	20 %	20 %	20 %	40 %	414079220
86	NC_019439	TTAAC	2	10	155812	155821	40 %	40 %	0 %	20 %	414079224
87	NC_019439	TAGAA	2	10	156076	156085	60 %	20 %	20 %	0 %	414079224
88	NC_019439	GGGAA	2	10	156389	156398	40 %	0 %	60 %	0 %	414079225
89	NC_019439	GATGT	2	10	160149	160158	20 %	40 %	40 %	0 %	414079228
90	NC_019439	AAAAT	2	10	160762	160771	80 %	20 %	0 %	0 %	414079228
91	NC_019439	TGCTT	2	10	160895	160904	0 %	60 %	20 %	20 %	414079228
92	NC_019439	CGGAA	2	10	161074	161083	40 %	0 %	40 %	20 %	414079228
93	NC_019439	TTTGG	2	10	161402	161411	0 %	60 %	40 %	0 %	414079228
94	NC_019439	ATCTC	2	10	162846	162855	20 %	40 %	0 %	40 %	414079229
95	NC_019439	TATTT	2	10	167110	167119	20 %	80 %	0 %	0 %	414079232
96	NC_019439	AGGAT	2	10	172703	172712	40 %	20 %	40 %	0 %	414079237
97	NC_019439	TCACC	2	10	173007	173016	20 %	20 %	0 %	60 %	414079237
98	NC_019439	GCAAA	2	10	173141	173150	60 %	0 %	20 %	20 %	414079237
99	NC_019439	CTTGA	2	10	173613	173622	20 %	40 %	20 %	20 %	414079238
100	NC_019439	AAAAG	2	10	174803	174812	80 %	0 %	20 %	0 %	414079239
101	NC_019439	AACTA	2	10	175194	175203	60 %	20 %	0 %	20 %	414079240
102	NC_019439	TTTTC	2	10	180480	180489	0 %	80 %	0 %	20 %	414079246
103	NC_019439	TTACT	2	10	184287	184296	20 %	60 %	0 %	20 %	414079249
104	NC_019439	AATTG	2	10	184634	184643	40 %	40 %	20 %	0 %	414079249
105	NC_019439	GTTTG	2	10	185161	185170	0 %	60 %	40 %	0 %	414079249
106	NC_019439	TGCTG	2	10	185317	185326	0 %	40 %	40 %	20 %	414079250
107	NC_019439	AATCA	2	10	186424	186433	60 %	20 %	0 %	20 %	414079250
108	NC_019439	TGAAA	2	10	188279	188288	60 %	20 %	20 %	0 %	414079250
109	NC_019439	AAAGG	2	10	192074	192083	60 %	0 %	40 %	0 %	414079253
110	NC_019439	GAAGA	2	10	192420	192429	60 %	0 %	40 %	0 %	414079253
111	NC_019439	GAAAA	2	10	192750	192759	80 %	0 %	20 %	0 %	414079253
112	NC_019439	GGATG	2	10	192800	192809	20 %	20 %	60 %	0 %	414079253
113	NC_019439	TTTTG	2	10	195693	195702	0 %	80 %	20 %	0 %	414079256
114	NC_019439	TTGGT	2	10	197287	197296	0 %	60 %	40 %	0 %	414079256
115	NC_019439	GATTT	2	10	198434	198443	20 %	60 %	20 %	0 %	414079257
116	NC_019439	CGCTA	2	10	201555	201564	20 %	20 %	20 %	40 %	414079259
117	NC_019439	TAATT	2	10	201995	202004	40 %	60 %	0 %	0 %	414079259
118	NC_019439	TGGTA	2	10	208472	208481	20 %	40 %	40 %	0 %	414079262
119	NC_019439	TTGTC	2	10	215211	215220	0 %	60 %	20 %	20 %	414079274
120	NC_019439	TCAGT	2	10	221632	221641	20 %	40 %	20 %	20 %	414079279
121	NC_019439	TCAAT	2	10	221789	221798	40 %	40 %	0 %	20 %	414079279
122	NC_019439	CCAGC	2	10	223973	223982	20 %	0 %	20 %	60 %	414079280
123	NC_019439	TAAAT	2	10	225159	225168	60 %	40 %	0 %	0 %	414079281
124	NC_019439	AGAAT	2	10	225427	225436	60 %	20 %	20 %	0 %	414079281
125	NC_019439	GGTTG	2	10	229124	229133	0 %	40 %	60 %	0 %	414079283
126	NC_019439	AAGGT	2	10	229206	229215	40 %	20 %	40 %	0 %	414079283
127	NC_019439	ACTTT	2	10	231294	231303	20 %	60 %	0 %	20 %	414079287
128	NC_019439	AAATC	2	10	232588	232597	60 %	20 %	0 %	20 %	414079288
129	NC_019439	ACAAA	2	10	233441	233450	80 %	0 %	0 %	20 %	414079289
130	NC_019439	ATCAG	2	10	238005	238014	40 %	20 %	20 %	20 %	414079293
131	NC_019439	CAAAA	2	10	247432	247441	80 %	0 %	0 %	20 %	414079299
132	NC_019439	TTATT	2	10	247920	247929	20 %	80 %	0 %	0 %	414079299
133	NC_019439	CAATG	2	10	248477	248486	40 %	20 %	20 %	20 %	414079299
134	NC_019439	AAATT	2	10	252225	252234	60 %	40 %	0 %	0 %	414079302
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.