MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS1

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019438	GAT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073320
2	NC_019438	CAA	2	6	240	245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073320
3	NC_019438	AAG	2	6	305	310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073320
4	NC_019438	ATG	3	9	377	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073320
5	NC_019438	TAT	2	6	492	497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073320
6	NC_019438	GAA	2	6	780	785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073320
7	NC_019438	AGA	2	6	795	800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073320
8	NC_019438	AGA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073320
9	NC_019438	AAG	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073320
10	NC_019438	ATG	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073320
11	NC_019438	AGA	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019438	TGG	2	6	1218	1223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073321
13	NC_019438	GAT	2	6	1241	1246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073321
14	NC_019438	GAT	2	6	1292	1297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073321
15	NC_019438	TAC	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073321
16	NC_019438	TCA	2	6	1460	1465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073321
17	NC_019438	CAA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073321
18	NC_019438	GTG	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073321
19	NC_019438	TTC	2	6	1748	1753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073321
20	NC_019438	GAT	2	6	1763	1768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073321
21	NC_019438	TCA	2	6	1780	1785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073321
22	NC_019438	TAA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073321
23	NC_019438	AGA	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073321
24	NC_019438	CTA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073321
25	NC_019438	TTC	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073321
26	NC_019438	TCA	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073321
27	NC_019438	TTG	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073321
28	NC_019438	ATA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019438	GTT	2	6	2507	2512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019438	ATA	2	6	2528	2533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019438	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019438	TTA	2	6	2689	2694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019438	TTA	2	6	2716	2721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019438	TGA	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019438	TGA	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019438	TGA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019438	TGA	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019438	TGA	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019438	TCT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019438	TAT	2	6	3440	3445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019438	GTA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019438	TAA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019438	TAA	2	6	3553	3558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019438	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019438	ATA	2	6	3677	3682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019438	GAT	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019438	TTA	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019438	TAT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019438	TCT	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019438	GAT	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019438	TTG	2	6	3977	3982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019438	TTA	2	6	4161	4166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019438	ATA	2	6	4184	4189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.