MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS4

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019437	AATC	2	8	547	554	50 %	25 %	0 %	25 %	414075303
2	NC_019437	AAAG	2	8	675	682	75 %	0 %	25 %	0 %	414075303
3	NC_019437	GCAA	2	8	1004	1011	50 %	0 %	25 %	25 %	414075304
4	NC_019437	AAGG	2	8	1022	1029	50 %	0 %	50 %	0 %	414075304
5	NC_019437	AAAC	2	8	1199	1206	75 %	0 %	0 %	25 %	414075304
6	NC_019437	TGAT	2	8	1412	1419	25 %	50 %	25 %	0 %	414075304
7	NC_019437	AATT	2	8	1804	1811	50 %	50 %	0 %	0 %	414075305
8	NC_019437	AATT	2	8	2068	2075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019437	TCAC	2	8	2132	2139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019437	CGAT	2	8	2299	2306	25 %	25 %	25 %	25 %	414075306
11	NC_019437	CGAA	2	8	2927	2934	50 %	0 %	25 %	25 %	414075307
12	NC_019437	GGCT	2	8	3615	3622	0 %	25 %	50 %	25 %	414075308
13	NC_019437	CGTG	2	8	3718	3725	0 %	25 %	50 %	25 %	414075308
14	NC_019437	ACCA	2	8	3748	3755	50 %	0 %	0 %	50 %	414075308
15	NC_019437	AGTC	2	8	3781	3788	25 %	25 %	25 %	25 %	414075308
16	NC_019437	TTGG	2	8	4116	4123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019437	ATTG	2	8	4645	4652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019437	CACG	2	8	4674	4681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019437	TCAT	2	8	4718	4725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019437	GTGA	2	8	4915	4922	25 %	25 %	50 %	0 %	414075309
21	NC_019437	ATTA	2	8	5185	5192	50 %	50 %	0 %	0 %	414075309
22	NC_019437	TGAT	2	8	5732	5739	25 %	50 %	25 %	0 %	414075310
23	NC_019437	AAAG	2	8	6145	6152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019437	TGCT	2	8	6174	6181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019437	TATT	2	8	6277	6284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019437	AACT	2	8	6473	6480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019437	TAGA	2	8	6940	6947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019437	TAGA	2	8	6984	6991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.