MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019436	TAT	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019436	ATT	2	6	2164	2169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019436	TCA	2	6	2273	2278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019436	GGT	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019436	ATT	2	6	4511	4516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019436	TTC	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019436	TCT	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019436	TAT	2	6	4923	4928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019436	CCT	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019436	TGA	2	6	5696	5701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019436	TAA	2	6	8358	8363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019436	TAT	2	6	9147	9152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019436	ATA	2	6	9161	9166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019436	ATA	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019436	AAG	2	6	10037	10042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019436	TTG	2	6	10113	10118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019436	ATG	2	6	11184	11189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019436	TTA	2	6	12179	12184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019436	GAA	2	6	12228	12233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019436	TGA	2	6	13258	13263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019436	CTT	2	6	13283	13288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019436	TAT	2	6	13297	13302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019436	ATA	2	6	13446	13451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019436	GAT	2	6	13482	13487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019436	AGC	2	6	13514	13519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019436	AGC	2	6	13612	13617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019436	ATT	2	6	13633	13638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019436	CAA	2	6	13664	13669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019436	TCC	2	6	14667	14672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019436	TTG	2	6	14706	14711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019436	TAT	2	6	14821	14826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019436	CTA	2	6	14920	14925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019436	TAA	2	6	14956	14961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019436	TGT	2	6	14964	14969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019436	ATC	3	9	15074	15082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019436	TAA	2	6	15093	15098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019436	AAT	2	6	15101	15106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019436	AAT	3	9	18894	18902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019436	GTT	2	6	19261	19266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019436	AAT	2	6	19304	19309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019436	TCT	2	6	19692	19697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019436	GTA	2	6	19823	19828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019436	TAT	2	6	21254	21259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019436	TCA	2	6	21312	21317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019436	ATT	2	6	21321	21326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019436	CAA	2	6	21401	21406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019436	TGC	2	6	21423	21428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019436	CTT	2	6	21437	21442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019436	TGA	2	6	21629	21634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019436	TCC	2	6	21664	21669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019436	TAT	2	6	21731	21736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019436	CAT	2	6	21741	21746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019436	ACC	2	6	21759	21764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019436	ACG	2	6	21950	21955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019436	GAA	2	6	22049	22054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019436	CTG	2	6	22164	22169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019436	CGT	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019436	CAG	2	6	22193	22198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019436	AAC	2	6	22874	22879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019436	TCT	2	6	22915	22920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019436	ATA	2	6	23029	23034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019436	CAT	2	6	23053	23058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019436	CTT	2	6	23104	23109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019436	ATC	2	6	23144	23149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019436	ATC	2	6	23159	23164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019436	ACC	2	6	23810	23815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019436	ACT	2	6	23874	23879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019436	TCC	2	6	23912	23917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019436	CCT	2	6	23949	23954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019436	ACA	2	6	23983	23988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019436	TAT	2	6	24064	24069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019436	ATT	2	6	24234	24239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019436	TAC	2	6	24252	24257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019436	TAC	2	6	24326	24331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019436	TAT	2	6	24369	24374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019436	GAA	3	9	24380	24388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019436	AGC	2	6	24527	24532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019436	ACG	2	6	24716	24721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019436	GAA	2	6	24805	24810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019436	CAA	2	6	25083	25088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019436	TCA	2	6	25137	25142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019436	GCT	2	6	25205	25210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019436	ATA	2	6	31199	31204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019436	TAT	2	6	31213	31218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019436	GAA	2	6	31232	31237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019436	TCT	2	6	31259	31264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019436	TTA	2	6	31299	31304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019436	ATT	2	6	31346	31351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019436	ATT	2	6	32532	32537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019436	TAC	2	6	32550	32555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019436	TCC	2	6	33347	33352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_019436	TAT	2	6	33366	33371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019436	TAG	2	6	33386	33391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019436	GAA	2	6	33415	33420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019436	GAA	2	6	33490	33495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019436	TAG	2	6	35068	35073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019436	ATA	2	6	35087	35092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019436	ATA	2	6	35143	35148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019436	ATT	2	6	35179	35184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019436	AAG	2	6	36072	36077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019436	TAA	2	6	36152	36157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019436	AGT	2	6	36173	36178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019436	AAT	2	6	37466	37471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019436	GTT	2	6	37478	37483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019436	AAC	2	6	37484	37489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019436	TTG	2	6	37492	37497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019436	ATA	4	12	37502	37513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019436	TTC	2	6	37854	37859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019436	TAT	2	6	38405	38410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019436	GGA	2	6	38475	38480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019436	CAA	2	6	38494	38499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019436	CAA	2	6	38516	38521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019436	CAA	2	6	38538	38543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019436	CAA	2	6	38560	38565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.