MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019436	AT	3	6	1298	1303	50 %	50 %	0 %	0 %	414075270
2	NC_019436	TA	3	6	2403	2408	50 %	50 %	0 %	0 %	414075272
3	NC_019436	TC	3	6	4158	4163	0 %	50 %	0 %	50 %	414075273
4	NC_019436	AC	3	6	4449	4454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019436	AT	3	6	5038	5043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019436	AC	3	6	5432	5437	50 %	0 %	0 %	50 %	414075274
7	NC_019436	AT	3	6	5662	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	414075274
8	NC_019436	CT	4	8	5747	5754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019436	TA	3	6	5849	5854	50 %	50 %	0 %	0 %	414075275
10	NC_019436	TA	3	6	5996	6001	50 %	50 %	0 %	0 %	414075275
11	NC_019436	CT	3	6	6459	6464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019436	TA	4	8	9165	9172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019436	TA	4	8	10129	10136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019436	GA	3	6	12213	12218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019436	TA	3	6	13383	13388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019436	AT	3	6	14555	14560	50 %	50 %	0 %	0 %	414075283
17	NC_019436	CA	3	6	14782	14787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019436	CT	3	6	14900	14905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019436	CT	3	6	15148	15153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019436	TA	3	6	15248	15253	50 %	50 %	0 %	0 %	414075284
21	NC_019436	TA	3	6	15395	15400	50 %	50 %	0 %	0 %	414075284
22	NC_019436	CT	3	6	15858	15863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019436	GA	3	6	16320	16325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019436	AT	3	6	17226	17231	50 %	50 %	0 %	0 %	414075285
25	NC_019436	TC	3	6	18371	18376	0 %	50 %	0 %	50 %	414075286
26	NC_019436	CT	3	6	19145	19150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019436	CA	3	6	21519	21524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019436	TC	3	6	22111	22116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019436	TC	3	6	22602	22607	0 %	50 %	0 %	50 %	414075288
30	NC_019436	AT	3	6	22772	22777	50 %	50 %	0 %	0 %	414075288
31	NC_019436	AG	3	6	24180	24185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019436	TA	3	6	24643	24648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019436	AT	3	6	24789	24794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019436	AG	3	6	24890	24895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019436	TC	3	6	25328	25333	0 %	50 %	0 %	50 %	414075290
36	NC_019436	TA	3	6	28433	28438	50 %	50 %	0 %	0 %	414075290
37	NC_019436	TA	3	6	31206	31211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019436	TA	3	6	31221	31226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019436	AG	3	6	32478	32483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019436	TA	3	6	32740	32745	50 %	50 %	0 %	0 %	414075292
41	NC_019436	TG	3	6	33009	33014	0 %	50 %	50 %	0 %	414075292
42	NC_019436	AC	3	6	34209	34214	50 %	0 %	0 %	50 %	414075293
43	NC_019436	CA	3	6	34494	34499	50 %	0 %	0 %	50 %	414075293
44	NC_019436	CA	3	6	35516	35521	50 %	0 %	0 %	50 %	414075294
45	NC_019436	TA	3	6	35835	35840	50 %	50 %	0 %	0 %	414075294
46	NC_019436	GA	3	6	37116	37121	50 %	0 %	50 %	0 %	414075295
47	NC_019436	TA	3	6	37869	37874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019436	AG	3	6	38311	38316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019436	AT	3	6	38409	38414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019436	TA	3	6	38421	38426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019436	TA	3	6	38509	38514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019436	TA	3	6	38531	38536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019436	TA	3	6	38553	38558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.