MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019435	TTGCTG	2	12	419	430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073324
2	NC_019435	TTGAAG	2	12	1628	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073325
3	NC_019435	TGAAAG	2	12	1931	1942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073325
4	NC_019435	ATGTTG	2	12	4415	4426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414073326
5	NC_019435	TCAAAA	2	12	7004	7015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414073327
6	NC_019435	AAAATG	2	12	7155	7166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073327
7	NC_019435	AAAGAT	2	12	11231	11242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073330
8	NC_019435	TAAAAA	2	12	12750	12761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073332
9	NC_019435	TTGACA	2	12	16732	16743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073334
10	NC_019435	AAATCA	2	12	20105	20116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414073338
11	NC_019435	GCGTGA	2	12	24081	24092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414073341
12	NC_019435	ATCTTC	2	12	24242	24253	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414073341
13	NC_019435	TGTTTG	2	12	35043	35054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073349
14	NC_019435	GATAAT	2	12	36641	36652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414073350
15	NC_019435	TCAGAG	2	12	36860	36871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414073350
16	NC_019435	AAGGAA	2	12	36919	36930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073350
17	NC_019435	TAAAAT	2	12	38816	38827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019435	TTCACC	2	12	41580	41591	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	414073354
19	NC_019435	CTTCAA	2	12	45840	45851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073357
20	NC_019435	TATAAA	2	12	46740	46751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073358
21	NC_019435	GGTCAG	2	12	49802	49813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414073362
22	NC_019435	TTGCTT	2	12	51756	51767	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073364
23	NC_019435	TTGTTT	2	12	52065	52076	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	414073364
24	NC_019435	TCCAAG	2	12	55634	55645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414073367
25	NC_019435	AGAACA	2	12	55664	55675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073367
26	NC_019435	ACAAGA	2	12	57803	57814	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073368
27	NC_019435	TAGGCT	2	12	57932	57943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073369
28	NC_019435	AGCGAT	2	12	68538	68549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414073379
29	NC_019435	TCAGAT	2	12	70526	70537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073382
30	NC_019435	ATTCAG	2	12	70716	70727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073382
31	NC_019435	ATTTTT	2	12	72586	72597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414073385
32	NC_019435	ATTTGC	2	12	78211	78222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073391
33	NC_019435	AAGCAA	2	12	78315	78326	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073391
34	NC_019435	GGGAAT	2	12	79351	79362	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019435	ATCAAA	2	12	81451	81462	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414073393
36	NC_019435	TTTTCG	2	12	82440	82451	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073394
37	NC_019435	AAAACC	2	12	85097	85108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073397
38	NC_019435	TGGACG	2	12	85588	85599	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414073397
39	NC_019435	TGGGAC	2	12	87803	87814	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414073401
40	NC_019435	CAGTTG	2	12	88665	88676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073402
41	NC_019435	AGCTGA	2	12	92060	92071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414073404
42	NC_019435	TTTATC	2	12	94848	94859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414073406
43	NC_019435	TGAACT	2	12	100207	100218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073412
44	NC_019435	TATGGG	2	12	105585	105596	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414073415
45	NC_019435	AATAGC	2	12	110366	110377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_019435	AATCAA	2	12	113489	113500	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019435	TTCATA	2	12	124123	124134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073432
48	NC_019435	ATTGCT	2	12	126150	126161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073434
49	NC_019435	TGCAGC	2	12	126233	126244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414073434
50	NC_019435	TCATAA	2	12	129273	129284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414073440
51	NC_019435	CAAAAG	2	12	129764	129775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073441
52	NC_019435	GTTTAA	2	12	130455	130466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414073442
53	NC_019435	CAAACC	2	12	133333	133344	50 %	0 %	0 %	50 %	414073445
54	NC_019435	TAAAAA	2	12	134139	134150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019435	ATTAAT	2	12	138699	138710	50 %	50 %	0 %	0 %	414073450
56	NC_019435	TATAAT	2	12	139134	139145	50 %	50 %	0 %	0 %	414073450
57	NC_019435	GTGACT	2	12	144163	144174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073451
58	NC_019435	TAACTT	2	12	144534	144545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073451
59	NC_019435	ACCTGG	2	12	145488	145499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414073453
60	NC_019435	ATAATT	2	12	154905	154916	50 %	50 %	0 %	0 %	414073461
61	NC_019435	TTGCTT	2	12	161255	161266	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073468
62	NC_019435	GCTTAT	2	12	162628	162639	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073469
63	NC_019435	GTAAAG	2	12	166537	166548	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073471
64	NC_019435	TTATTT	2	12	169263	169274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019435	GAATAC	2	12	169353	169364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073477
66	NC_019435	ATGAAA	2	12	169481	169492	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073477
67	NC_019435	TTTGAA	2	12	169804	169815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414073477
68	NC_019435	ATAAAA	2	12	173926	173937	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073481
69	NC_019435	TTCGGC	2	12	174127	174138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073482
70	NC_019435	ATTGGG	2	12	175128	175139	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	414073482
71	NC_019435	AAATAG	2	12	177623	177634	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073484
72	NC_019435	TCGTAA	2	12	178380	178391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073485
73	NC_019435	CTTTTT	2	12	182157	182168	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414073489
74	NC_019435	ATGTTG	2	12	187559	187570	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414073493
75	NC_019435	AGCAAT	2	12	188630	188641	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073494
76	NC_019435	AGAAGT	2	12	188660	188671	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073494
77	NC_019435	AACTTT	2	12	188735	188746	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073494
78	NC_019435	TTGGAA	2	12	191084	191095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073497
79	NC_019435	GAAGGT	2	12	194072	194083	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414073502
80	NC_019435	GAAAAC	2	12	194615	194626	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073502
81	NC_019435	AGCAAA	2	12	195909	195920	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073504
82	NC_019435	AAAAGC	2	12	195951	195962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073504
83	NC_019435	TGATAA	2	12	200271	200282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414073509
84	NC_019435	TTGCTT	2	12	200400	200411	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414073509
85	NC_019435	ATTTTA	2	12	201059	201070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073509
86	NC_019435	AGATGA	2	12	214198	214209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073521
87	NC_019435	GGGAGC	2	12	214477	214488	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	414073521
88	NC_019435	AAAAAT	2	12	214555	214566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073521
89	NC_019435	TGTTGC	2	12	215134	215145	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073521
90	NC_019435	AGTTTG	2	12	215771	215782	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414073522
91	NC_019435	ACTAAT	2	12	217148	217159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414073522
92	NC_019435	TTGAAT	2	12	218648	218659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019435	TAACCC	2	12	218966	218977	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019435	TAAAAA	2	12	221592	221603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019435	TGAAAA	2	12	223333	223344	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073525
96	NC_019435	GAGTTA	2	12	226258	226269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073527
97	NC_019435	AAATAG	2	12	226425	226436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019435	TGAAGA	2	12	227720	227731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073530
99	NC_019435	CTGACC	2	12	232118	232129	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414073536
100	NC_019435	GATGAC	2	12	232363	232374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414073536
101	NC_019435	ACGTAA	2	12	237751	237762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073542
102	NC_019435	ACGTAA	2	12	237775	237786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073542
103	NC_019435	TACTCT	2	12	239906	239917	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019435	GAAAGG	2	12	240205	240216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019435	TAAAAA	2	12	242440	242451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019435	TGGAAT	2	12	244522	244533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073546
107	NC_019435	AAGCTC	2	12	251989	252000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414073554
108	NC_019435	TGATTG	2	12	254841	254852	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019435	GTCATT	2	12	256947	256958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073556
110	NC_019435	AAGGCC	2	12	262148	262159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073559
111	NC_019435	TAACGA	2	12	263502	263513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073560
112	NC_019435	TGGCAT	2	12	264412	264423	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414073561
113	NC_019435	ATTCTA	2	12	264619	264630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019435	TTTGAT	2	12	266051	266062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414073563
115	NC_019435	CTTAAC	2	12	268234	268245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073567
116	NC_019435	TTTAAC	2	12	269179	269190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073567
117	NC_019435	AAAACA	2	12	269386	269397	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_019435	ATTTCC	2	12	276313	276324	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414073573
119	NC_019435	TGTATC	2	12	276925	276936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073573
120	NC_019435	TGATAT	2	12	277259	277270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	414073573
121	NC_019435	TTTGAT	2	12	283076	283087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019435	TTTTTC	2	12	283128	283139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019435	TGGTGC	2	12	284688	284699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414073578
124	NC_019435	GGCTCA	2	12	284803	284814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414073578
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130	NC_019435	ATTTTT	2	12	304973	304984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414073598
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136	NC_019435	TTGCTG	2	12	329875	329886	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073619
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218	NC_019435	TGACCT	2	12	492598	492609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414073747
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234	NC_019435	GAAAAA	2	12	519087	519098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
235	NC_019435	ATCAAA	2	12	519139	519150	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
236	NC_019435	TGCAAT	2	12	520910	520921	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073777
237	NC_019435	TATGCT	2	12	524634	524645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073780
238	NC_019435	TTCAAG	2	12	525866	525877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073781
239	NC_019435	GAAACA	2	12	528378	528389	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073783
240	NC_019435	TTTATA	2	12	538865	538876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073794
241	NC_019435	AAGTTC	2	12	539209	539220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414073795
242	NC_019435	TGGAAG	2	12	546094	546105	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
243	NC_019435	AAGCAA	2	12	551129	551140	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073798
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245	NC_019435	TAAAAA	2	12	551469	551480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_019435	GAAATT	2	12	554929	554940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414073800
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251	NC_019435	ATTTGT	2	12	582893	582904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414073824
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337	NC_019435	AATAAA	2	12	760987	760998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_019435	TTGAAG	2	12	768146	768157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073982
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344	NC_019435	ATTTGA	2	12	772892	772903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
345	NC_019435	TAAAAA	2	12	773991	774002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073989
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348	NC_019435	TTATTT	2	12	777171	777182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
349	NC_019435	GAATAT	2	12	780678	780689	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	414073996
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351	NC_019435	TCGCAA	2	12	789215	789226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
352	NC_019435	CGATTG	2	12	793765	793776	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414074009
353	NC_019435	GTCATG	2	12	794413	794424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
354	NC_019435	TATAAA	2	12	795671	795682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414074011
355	NC_019435	AACTAA	2	12	796307	796318	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414074012
356	NC_019435	TTTATA	2	12	798294	798305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414074014
357	NC_019435	AAGTTC	2	12	798638	798649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414074015
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